More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0320 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  100 
 
 
1068 aa  2122    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  32.91 
 
 
911 aa  397  1e-109  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01071  conserved hypothetical protein  31.12 
 
 
1185 aa  372  1e-101  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0324435  normal  0.67029 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08322  conserved hypothetical protein  31.5 
 
 
1050 aa  368  1e-100  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1167  putative ATP/GTP binding protein  35.72 
 
 
992 aa  351  5e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.944316  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7957  Tetratricopeptide TPR_4  33.03 
 
 
1324 aa  350  6e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0918027  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  27.95 
 
 
1039 aa  349  2e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  30.57 
 
 
1262 aa  345  2e-93  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1260  putative ATP/GTP binding protein  33.62 
 
 
900 aa  338  3.9999999999999995e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.223492  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  32.2 
 
 
785 aa  337  5e-91  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01580  conserved hypothetical protein  32.52 
 
 
1128 aa  337  7.999999999999999e-91  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0427699 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1862  NB-ARC domain protein  34.78 
 
 
897 aa  335  4e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1407  putative ATP/GTP binding protein  34.58 
 
 
859 aa  334  5e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5724  ATP/GTP-binding protein  32.57 
 
 
1309 aa  328  4.0000000000000003e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.308781 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0876  putative ATP/GTP binding protein  32.91 
 
 
934 aa  323  8e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 
1105 aa  317  9.999999999999999e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  32.58 
 
 
1056 aa  315  3.9999999999999997e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2455  tetratricopeptide TPR_4  35.05 
 
 
829 aa  313  7.999999999999999e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262289  normal  0.779517 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6956  NB-ARC domain-containing protein  33.41 
 
 
1500 aa  306  2.0000000000000002e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.270488 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6918  putative ATP/GTP-binding protein  31.02 
 
 
845 aa  301  4e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.92 
 
 
1424 aa  300  8e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4186  tetratricopeptide TPR_4  32.12 
 
 
963 aa  300  1e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  28.62 
 
 
1088 aa  296  2e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2553  putative ATP/GTP-binding protein  31.11 
 
 
838 aa  283  2e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000100802  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  34.61 
 
 
1000 aa  281  4e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10448  TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01710)  40.31 
 
 
1488 aa  278  5e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.162575 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1603  NB-ARC domain protein  31.4 
 
 
843 aa  273  1e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0482408  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03881  conserved hypothetical protein  30.17 
 
 
1125 aa  263  1e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.693693 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5728  tetratricopeptide TPR_4  31.53 
 
 
849 aa  263  2e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0515  putative ATP/GTP-binding protein  29.77 
 
 
1314 aa  257  7e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.388399 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1471  TPR repeat-containing protein  26.13 
 
 
1283 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.791072  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1600  hypothetical protein  29.5 
 
 
1383 aa  256  2.0000000000000002e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.726146  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  30.98 
 
 
924 aa  245  3e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4762  putative ATP/GTP binding protein  34.55 
 
 
675 aa  244  7.999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  25.53 
 
 
1288 aa  241  5e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  33.69 
 
 
1328 aa  239  3e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0434  putative ATP/GTP binding protein  34.18 
 
 
713 aa  233  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.342423 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0403  hypothetical protein  29.52 
 
 
1523 aa  232  2e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1729  TPR repeat-containing protein  38.02 
 
 
837 aa  232  3e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3272  hypothetical protein  31.56 
 
 
801 aa  229  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2257  tetratricopeptide TPR_4  28.66 
 
 
828 aa  220  8.999999999999998e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  31.79 
 
 
1215 aa  214  5.999999999999999e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.83 
 
 
1186 aa  202  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  27.31 
 
 
953 aa  201  5e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.56 
 
 
767 aa  198  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5337  TIR protein  38.96 
 
 
385 aa  198  4.0000000000000005e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.135441 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  32.49 
 
 
454 aa  198  4.0000000000000005e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0441  hypothetical protein  27.69 
 
 
1010 aa  194  7e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.38406 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3483  NB-ARC domain protein  28.78 
 
 
793 aa  194  7e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08545  conserved hypothetical protein  27.55 
 
 
1136 aa  189  2e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  33.22 
 
 
568 aa  189  3e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.22 
 
 
568 aa  189  3e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0199548 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  25.52 
 
 
1131 aa  187  8e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5289  TPR repeat-containing protein  23.29 
 
 
857 aa  187  9e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.752131  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  32 
 
 
843 aa  187  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1718  tetratricopeptide TPR_4  26.62 
 
 
799 aa  182  2.9999999999999997e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2650  tetratricopeptide TPR_4  28.47 
 
 
1311 aa  180  1e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0589865  normal  0.0118034 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0136  TPR repeat-containing protein  26.08 
 
 
776 aa  179  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.955072  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04339  conserved hypothetical protein  25.57 
 
 
1146 aa  179  3e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.541265 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  42.8 
 
 
284 aa  174  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  32.13 
 
 
919 aa  173  1e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1587  NB-ARC  27.31 
 
 
1044 aa  169  2.9999999999999998e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257434  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  29.2 
 
 
825 aa  167  6.9999999999999995e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.57 
 
 
771 aa  167  1.0000000000000001e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  34.17 
 
 
444 aa  166  2.0000000000000002e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0641  TPR repeat-containing protein  29.38 
 
 
966 aa  165  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.249187 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  32.86 
 
 
751 aa  162  4e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  29.38 
 
 
1475 aa  162  4e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  26.97 
 
 
1507 aa  161  8e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2528  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.09 
 
 
991 aa  158  6e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122653  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4606  NB-ARC domain protein  26.35 
 
 
1261 aa  158  6e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.350947  normal  0.437049 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.88 
 
 
787 aa  158  6e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  22.48 
 
 
1404 aa  158  7e-37  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3233  serine/threonine protein kinase  30.14 
 
 
1290 aa  158  7e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.273331  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  25.62 
 
 
725 aa  157  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 
814 aa  156  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  27.22 
 
 
822 aa  155  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6844  Tetratricopeptide TPR_4  29.41 
 
 
1468 aa  153  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0351351  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  26.54 
 
 
1040 aa  153  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.89 
 
 
885 aa  154  1e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  32.72 
 
 
672 aa  152  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08541  conserved hypothetical protein  33.86 
 
 
577 aa  152  4e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6333  hypothetical protein  39.27 
 
 
373 aa  152  4e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4641  hypothetical protein  35.17 
 
 
457 aa  150  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4516  NB-ARC domain protein  34.16 
 
 
1509 aa  147  8.000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.247222 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0319  TIR protein  49.37 
 
 
157 aa  147  8.000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4251  tetratricopeptide TPR_4  34.24 
 
 
899 aa  146  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.553547  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  31.56 
 
 
1228 aa  145  4e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.688496 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1822  NB-ARC  30.14 
 
 
977 aa  140  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.244157  normal  0.101864 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06956  conserved hypothetical protein  41.71 
 
 
304 aa  139  4e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1262  Tetratricopeptide TPR_4  35.71 
 
 
1429 aa  138  5e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.803703  normal  0.0826044 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32160  tetratricopeptide repeat protein  41.94 
 
 
702 aa  138  7.000000000000001e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.277202 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49558  predicted protein  32.62 
 
 
1106 aa  135  3.9999999999999996e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.022156  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3866  NB-ARC domain protein  32.65 
 
 
680 aa  133  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.641069 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2310  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.07 
 
 
841 aa  133  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544847  normal  0.283617 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  22.7 
 
 
2145 aa  132  3e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0416  TPR repeat-containing protein  34.47 
 
 
481 aa  130  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.80889 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2454  tetratricopeptide TPR_4  29.49 
 
 
686 aa  125  5e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.928825  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  25.71 
 
 
1550 aa  123  9.999999999999999e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5147  TPR repeat-containing protein  28.96 
 
 
469 aa  121  7e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0779428  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>