252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1603 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1603  NB-ARC domain protein  100 
 
 
843 aa  1707    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0482408  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2553  putative ATP/GTP-binding protein  44.04 
 
 
838 aa  637    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000100802  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5728  tetratricopeptide TPR_4  47.25 
 
 
849 aa  732    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6918  putative ATP/GTP-binding protein  60.19 
 
 
845 aa  982    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6956  NB-ARC domain-containing protein  38.82 
 
 
1500 aa  546  1e-154  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.270488 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1600  hypothetical protein  37.56 
 
 
1383 aa  509  1e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.726146  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7957  Tetratricopeptide TPR_4  37.91 
 
 
1324 aa  474  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0918027  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5724  ATP/GTP-binding protein  35.48 
 
 
1309 aa  458  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.308781 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0515  putative ATP/GTP-binding protein  34.88 
 
 
1314 aa  431  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.388399 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0403  hypothetical protein  33.73 
 
 
1523 aa  403  1e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4516  NB-ARC domain protein  33.61 
 
 
1509 aa  380  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.247222 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1167  putative ATP/GTP binding protein  36.08 
 
 
992 aa  366  1e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.944316  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1862  NB-ARC domain protein  36.41 
 
 
897 aa  352  2e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  34.68 
 
 
1000 aa  345  2.9999999999999997e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1260  putative ATP/GTP binding protein  33.87 
 
 
900 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.223492  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1407  putative ATP/GTP binding protein  36.43 
 
 
859 aa  337  7e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2650  tetratricopeptide TPR_4  31.21 
 
 
1311 aa  333  9e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0589865  normal  0.0118034 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  31.71 
 
 
911 aa  288  2e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0876  putative ATP/GTP binding protein  34.04 
 
 
934 aa  288  2.9999999999999996e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4762  putative ATP/GTP binding protein  32.61 
 
 
675 aa  281  5e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  31.16 
 
 
1068 aa  279  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4606  NB-ARC domain protein  28.18 
 
 
1261 aa  274  4.0000000000000004e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.350947  normal  0.437049 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4251  tetratricopeptide TPR_4  31.92 
 
 
899 aa  273  1e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.553547  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  33.69 
 
 
785 aa  270  7e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0441  hypothetical protein  28.6 
 
 
1010 aa  263  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.38406 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2455  tetratricopeptide TPR_4  33.05 
 
 
829 aa  260  1e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262289  normal  0.779517 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4186  tetratricopeptide TPR_4  30.21 
 
 
963 aa  253  1e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  25.7 
 
 
1039 aa  241  4e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  29.89 
 
 
1056 aa  233  2e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1513  tetratricopeptide TPR_4  29.48 
 
 
1326 aa  217  5.9999999999999996e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08322  conserved hypothetical protein  25.69 
 
 
1050 aa  203  9.999999999999999e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  26.85 
 
 
1288 aa  199  2.0000000000000003e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  25.65 
 
 
1088 aa  197  6e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3272  hypothetical protein  28.59 
 
 
801 aa  194  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01071  conserved hypothetical protein  25.42 
 
 
1185 aa  193  1e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0324435  normal  0.67029 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1471  TPR repeat-containing protein  26.42 
 
 
1283 aa  193  1e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.791072  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  27.93 
 
 
1105 aa  192  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  24.94 
 
 
1262 aa  192  2.9999999999999997e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2257  tetratricopeptide TPR_4  26.96 
 
 
828 aa  185  3e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0434  putative ATP/GTP binding protein  28.91 
 
 
713 aa  185  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.342423 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  27.76 
 
 
1131 aa  181  4.999999999999999e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  26.79 
 
 
924 aa  178  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03881  conserved hypothetical protein  25.3 
 
 
1125 aa  177  6e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.693693 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.2 
 
 
1424 aa  163  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  22.24 
 
 
1404 aa  159  1e-37  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04339  conserved hypothetical protein  25.53 
 
 
1146 aa  151  5e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.541265 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01580  conserved hypothetical protein  23.35 
 
 
1128 aa  147  6e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0427699 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5289  TPR repeat-containing protein  22.67 
 
 
857 aa  133  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.752131  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6333  hypothetical protein  40.55 
 
 
373 aa  132  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.57 
 
 
767 aa  130  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  27.52 
 
 
814 aa  130  9.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3483  NB-ARC domain protein  27.75 
 
 
793 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  24.43 
 
 
953 aa  128  5e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.55 
 
 
1186 aa  127  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  29.36 
 
 
454 aa  125  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2454  tetratricopeptide TPR_4  29.03 
 
 
686 aa  124  7e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.928825  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  23.19 
 
 
1212 aa  120  7e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  26.89 
 
 
1215 aa  120  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  25.95 
 
 
1228 aa  117  6e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.688496 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  20.22 
 
 
1550 aa  115  4.0000000000000004e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4641  hypothetical protein  28.71 
 
 
457 aa  115  5e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  26.43 
 
 
1328 aa  115  5e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5267  TPR repeat-containing protein  28.63 
 
 
640 aa  114  7.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.433566  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5337  TIR protein  37.02 
 
 
385 aa  114  9e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.135441 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08545  conserved hypothetical protein  24.06 
 
 
1136 aa  113  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  20 
 
 
2145 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  23.58 
 
 
822 aa  112  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10448  TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01710)  25.72 
 
 
1488 aa  108  3e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.162575 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  22.5 
 
 
843 aa  108  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0641  TPR repeat-containing protein  25.9 
 
 
966 aa  108  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.249187 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6844  Tetratricopeptide TPR_4  24.65 
 
 
1468 aa  107  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0351351  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  26.03 
 
 
1040 aa  107  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0136  TPR repeat-containing protein  23.05 
 
 
776 aa  105  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.955072  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08541  conserved hypothetical protein  24.48 
 
 
577 aa  102  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1587  NB-ARC  22.79 
 
 
1044 aa  101  6e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257434  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  24.33 
 
 
672 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  27.51 
 
 
568 aa  99.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.51 
 
 
568 aa  99.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2522  Tetratricopeptide TPR_4  24.11 
 
 
958 aa  95.5  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.27051  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06955  conserved hypothetical protein  30.33 
 
 
526 aa  93.6  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  24.77 
 
 
825 aa  93.2  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  31.67 
 
 
284 aa  93.2  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
949 aa  92.4  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3866  NB-ARC domain protein  23.66 
 
 
680 aa  90.9  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.641069 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5158  TPR repeat-containing protein  31.12 
 
 
652 aa  90.9  9e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.455207  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1729  TPR repeat-containing protein  25.38 
 
 
837 aa  89.4  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0459  hypothetical protein  27.44 
 
 
1017 aa  89  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.104459 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.32 
 
 
885 aa  89.4  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1796  putative ATP/GTP binding protein  25.34 
 
 
847 aa  88.6  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0346132  normal  0.567176 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5148  hypothetical protein  30.63 
 
 
392 aa  88.6  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0430972  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5207  TPR repeat-containing protein  31.34 
 
 
671 aa  88.2  6e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143534  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2652  hypothetical protein  26.04 
 
 
919 aa  87.4  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00496775  normal  0.0664064 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.94 
 
 
787 aa  87  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2528  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.58 
 
 
991 aa  84  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122653  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  30.39 
 
 
995 aa  84  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  30.31 
 
 
1014 aa  82.8  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25 
 
 
771 aa  83.2  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32160  tetratricopeptide repeat protein  31.94 
 
 
702 aa  83.2  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.277202 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  29.95 
 
 
751 aa  81.3  0.00000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  24.16 
 
 
493 aa  80.5  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>