108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2522 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_2522  Tetratricopeptide TPR_4  100 
 
 
958 aa  1912    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.27051  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1657  hypothetical protein  40.12 
 
 
513 aa  332  3e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.826128  normal  0.755126 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1658  Tetratricopeptide TPR_4  43.44 
 
 
405 aa  284  5.000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.856151  normal  0.917391 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6918  putative ATP/GTP-binding protein  25.69 
 
 
845 aa  122  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7957  Tetratricopeptide TPR_4  26.92 
 
 
1324 aa  113  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0918027  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3751  ATP/GTP-binding protein  29.95 
 
 
702 aa  112  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.145042  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5728  tetratricopeptide TPR_4  26.51 
 
 
849 aa  110  9.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.885214 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  25.25 
 
 
1262 aa  107  9e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4606  NB-ARC domain protein  24.64 
 
 
1261 aa  100  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.350947  normal  0.437049 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4762  putative ATP/GTP binding protein  26.62 
 
 
675 aa  97.8  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1260  putative ATP/GTP binding protein  27.89 
 
 
900 aa  97.8  9e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.223492  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04339  conserved hypothetical protein  24.92 
 
 
1146 aa  92.4  3e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.541265 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  26.1 
 
 
1056 aa  92.8  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1471  TPR repeat-containing protein  24.34 
 
 
1283 aa  92.4  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.791072  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01580  conserved hypothetical protein  23.75 
 
 
1128 aa  92  5e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0427699 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01071  conserved hypothetical protein  22.81 
 
 
1185 aa  92  5e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0324435  normal  0.67029 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1600  hypothetical protein  26.39 
 
 
1383 aa  90.5  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.726146  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0136  TPR repeat-containing protein  23.47 
 
 
776 aa  89  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.955072  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5724  ATP/GTP-binding protein  27.68 
 
 
1309 aa  87.4  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.308781 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1603  NB-ARC domain protein  23.91 
 
 
843 aa  87.4  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0482408  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4186  tetratricopeptide TPR_4  25 
 
 
963 aa  86.7  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2257  tetratricopeptide TPR_4  27.56 
 
 
828 aa  87  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  29.03 
 
 
1000 aa  85.5  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1407  putative ATP/GTP binding protein  26.98 
 
 
859 aa  85.5  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0434  putative ATP/GTP binding protein  28.01 
 
 
713 aa  84.3  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.342423 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2553  putative ATP/GTP-binding protein  25.14 
 
 
838 aa  83.2  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000100802  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1862  NB-ARC domain protein  27.29 
 
 
897 aa  83.6  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  21.39 
 
 
1039 aa  80.9  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4516  NB-ARC domain protein  26.5 
 
 
1509 aa  78.2  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.247222 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1167  putative ATP/GTP binding protein  33.49 
 
 
992 aa  75.5  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.944316  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3483  NB-ARC domain protein  25.66 
 
 
793 aa  75.9  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  23.61 
 
 
911 aa  75.1  0.000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1729  TPR repeat-containing protein  29.7 
 
 
837 aa  73.6  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  23.77 
 
 
785 aa  73.6  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3272  hypothetical protein  25.08 
 
 
801 aa  72  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08322  conserved hypothetical protein  23.55 
 
 
1050 aa  71.2  0.00000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2362  serine/threonine protein kinase  31.6 
 
 
1435 aa  71.2  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0458945 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0403  hypothetical protein  24.09 
 
 
1523 aa  70.9  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0441  hypothetical protein  29.02 
 
 
1010 aa  70.9  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.38406 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1796  putative ATP/GTP binding protein  26.84 
 
 
847 aa  67.4  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0346132  normal  0.567176 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10448  TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01710)  28.16 
 
 
1488 aa  66.2  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.162575 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6956  NB-ARC domain-containing protein  26.1 
 
 
1500 aa  66.6  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.270488 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08545  conserved hypothetical protein  22.31 
 
 
1136 aa  66.2  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08541  conserved hypothetical protein  32.34 
 
 
577 aa  65.1  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  23.51 
 
 
1088 aa  65.1  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2650  tetratricopeptide TPR_4  23.13 
 
 
1311 aa  65.1  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0589865  normal  0.0118034 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.12 
 
 
1186 aa  64.3  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32160  tetratricopeptide repeat protein  27.69 
 
 
702 aa  63.9  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.277202 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  36.32 
 
 
1068 aa  64.3  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5148  hypothetical protein  32.3 
 
 
392 aa  63.2  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0430972  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  31.02 
 
 
1105 aa  63.5  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0515  putative ATP/GTP-binding protein  22.73 
 
 
1314 aa  63.2  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.388399 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3057  hypothetical protein  24.03 
 
 
407 aa  61.2  0.00000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000245353  decreased coverage  0.000000000123111 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  21.54 
 
 
822 aa  61.2  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2455  tetratricopeptide TPR_4  26.98 
 
 
829 aa  60.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262289  normal  0.779517 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  21.32 
 
 
1288 aa  60.5  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4251  tetratricopeptide TPR_4  32.27 
 
 
899 aa  60.1  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.553547  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1822  NB-ARC  21.27 
 
 
977 aa  58.9  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.244157  normal  0.101864 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0876  putative ATP/GTP binding protein  29.07 
 
 
934 aa  57.4  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5207  TPR repeat-containing protein  31.72 
 
 
671 aa  57.4  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143534  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2478  PGAP1 family protein  27.59 
 
 
465 aa  56.6  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2232  hypothetical protein  27.71 
 
 
467 aa  55.8  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000103157  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2833  TPR repeat-containing protein  29.53 
 
 
344 aa  55.5  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.922484  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6844  Tetratricopeptide TPR_4  31.16 
 
 
1468 aa  55.5  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0351351  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  26.03 
 
 
1328 aa  54.3  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5337  TIR protein  30.51 
 
 
385 aa  53.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.135441 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  27.8 
 
 
924 aa  53.9  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  30.15 
 
 
814 aa  53.5  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5267  TPR repeat-containing protein  30.65 
 
 
640 aa  53.1  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.433566  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  28.38 
 
 
953 aa  53.5  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.81 
 
 
1424 aa  53.1  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2310  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.86 
 
 
841 aa  52.8  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544847  normal  0.283617 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03881  conserved hypothetical protein  21.82 
 
 
1125 aa  52.4  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.693693 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  22.15 
 
 
1131 aa  52  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  26.98 
 
 
1215 aa  52  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  25.47 
 
 
843 aa  52  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5719  transcriptional regulator  30.48 
 
 
966 aa  51.2  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5158  TPR repeat-containing protein  30.48 
 
 
652 aa  50.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.455207  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06955  conserved hypothetical protein  27.22 
 
 
526 aa  50.1  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6333  hypothetical protein  28.14 
 
 
373 aa  49.7  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4175  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.58 
 
 
854 aa  50.1  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0937  WD repeat-containing protein  25.12 
 
 
566 aa  49.7  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5512  hypothetical protein  26.51 
 
 
918 aa  49.7  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.104688  normal  0.128387 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1380  tetratricopeptide TPR_4  25.58 
 
 
937 aa  49.7  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  31.02 
 
 
284 aa  49.7  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1112  NB-ARC domain-containing protein  26.74 
 
 
447 aa  49.3  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0411959  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  22.37 
 
 
1411 aa  48.9  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5289  TPR repeat-containing protein  24.74 
 
 
857 aa  48.5  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.752131  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0416  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
481 aa  48.1  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.80889 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  24.31 
 
 
919 aa  47.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2249  hypothetical protein  27.65 
 
 
916 aa  47.4  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.560102  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7016  transcriptional regulator  33.16 
 
 
973 aa  47.8  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252317  normal  0.0265916 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  22.79 
 
 
568 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5472  transcriptional regulator, SARP family  28.47 
 
 
994 aa  46.6  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.959943  normal  0.441932 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.79 
 
 
568 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1621  transcriptional activator domain protein  29.48 
 
 
1064 aa  46.6  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.77523  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2454  tetratricopeptide TPR_4  30 
 
 
686 aa  46.2  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.928825  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5147  TPR repeat-containing protein  24.53 
 
 
469 aa  46.2  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0779428  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46573  TPR repeat-contain kinesin light chain  23.85 
 
 
694 aa  45.4  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.22 
 
 
767 aa  45.4  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>