199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_5148 on replicon NC_009973
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009973  Haur_5148  hypothetical protein  100 
 
 
392 aa  802    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0430972  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  83.24 
 
 
953 aa  562  1.0000000000000001e-159  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5158  TPR repeat-containing protein  75.59 
 
 
652 aa  560  1e-158  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.455207  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5207  TPR repeat-containing protein  79.89 
 
 
671 aa  555  1e-157  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143534  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  76.33 
 
 
1105 aa  543  1e-153  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5267  TPR repeat-containing protein  74.71 
 
 
640 aa  519  1e-146  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.433566  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  64.44 
 
 
924 aa  462  1e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  70.15 
 
 
814 aa  447  1.0000000000000001e-124  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5289  TPR repeat-containing protein  36.65 
 
 
857 aa  220  3.9999999999999997e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.752131  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2257  tetratricopeptide TPR_4  39.52 
 
 
828 aa  197  3e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0136  TPR repeat-containing protein  40.31 
 
 
776 aa  193  5e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.955072  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0641  TPR repeat-containing protein  45.21 
 
 
966 aa  189  8e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.249187 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.75 
 
 
1424 aa  155  8e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6956  NB-ARC domain-containing protein  30.63 
 
 
1500 aa  110  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.270488 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  27.38 
 
 
1039 aa  100  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6918  putative ATP/GTP-binding protein  31.79 
 
 
845 aa  100  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  30.88 
 
 
1000 aa  99.8  7e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5728  tetratricopeptide TPR_4  33.33 
 
 
849 aa  99.8  8e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  30.68 
 
 
911 aa  97.8  3e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  30.28 
 
 
785 aa  95.9  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4251  tetratricopeptide TPR_4  34.11 
 
 
899 aa  93.6  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.553547  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4516  NB-ARC domain protein  32.86 
 
 
1509 aa  91.7  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.247222 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1167  putative ATP/GTP binding protein  31.47 
 
 
992 aa  91.3  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.944316  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1862  NB-ARC domain protein  31.02 
 
 
897 aa  90.1  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  28.78 
 
 
1212 aa  89.7  8e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  30.1 
 
 
1228 aa  87.4  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.688496 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0876  putative ATP/GTP binding protein  33.03 
 
 
934 aa  87  5e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2553  putative ATP/GTP-binding protein  34.01 
 
 
838 aa  85.5  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000100802  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  28.37 
 
 
1068 aa  83.6  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4762  putative ATP/GTP binding protein  35.94 
 
 
675 aa  82.8  0.000000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0403  hypothetical protein  28.71 
 
 
1523 aa  82.8  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1407  putative ATP/GTP binding protein  27.69 
 
 
859 aa  82  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5531  transcriptional regulator, SARP family  30.15 
 
 
963 aa  82  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.394906 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1603  NB-ARC domain protein  29.23 
 
 
843 aa  82  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0482408  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1587  NB-ARC  26.77 
 
 
1044 aa  79.7  0.00000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257434  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  32.72 
 
 
1088 aa  78.6  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4606  NB-ARC domain protein  31.78 
 
 
1261 aa  78.6  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.350947  normal  0.437049 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01071  conserved hypothetical protein  27.64 
 
 
1185 aa  77.8  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0324435  normal  0.67029 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7957  Tetratricopeptide TPR_4  29.88 
 
 
1324 aa  75.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0918027  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0515  putative ATP/GTP-binding protein  31.31 
 
 
1314 aa  75.1  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.388399 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3866  NB-ARC domain protein  29.89 
 
 
680 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.641069 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5724  ATP/GTP-binding protein  28.63 
 
 
1309 aa  73.9  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.308781 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1471  TPR repeat-containing protein  31.02 
 
 
1283 aa  73.6  0.000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.791072  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3848  NB-ARC domain-containing protein  30.24 
 
 
811 aa  72.8  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3272  hypothetical protein  30.8 
 
 
801 aa  72  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1260  putative ATP/GTP binding protein  31.47 
 
 
900 aa  71.6  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.223492  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5337  TIR protein  32.98 
 
 
385 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.135441 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6333  hypothetical protein  32.99 
 
 
373 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  28.12 
 
 
1404 aa  72  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03881  conserved hypothetical protein  28.28 
 
 
1125 aa  70.9  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.693693 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01580  conserved hypothetical protein  27.34 
 
 
1128 aa  71.2  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0427699 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1822  NB-ARC  29.77 
 
 
977 aa  71.2  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.244157  normal  0.101864 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2455  tetratricopeptide TPR_4  31.66 
 
 
829 aa  71.2  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262289  normal  0.779517 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  27.8 
 
 
672 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  27.1 
 
 
843 aa  70.1  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08545  conserved hypothetical protein  29.82 
 
 
1136 aa  70.1  0.00000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  28.29 
 
 
981 aa  70.1  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  32.99 
 
 
1056 aa  69.3  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  27.65 
 
 
822 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3432  transcriptional regulator, SARP family  27.31 
 
 
775 aa  67.8  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00818273  normal  0.368034 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  30.77 
 
 
1014 aa  67  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  29.58 
 
 
996 aa  67  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5355  transcriptional regulator, SARP family  28.92 
 
 
1138 aa  66.6  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.610748 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5286  transcriptional regulator, XRE family  31.82 
 
 
810 aa  65.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6283  transcriptional regulator, SARP family  29 
 
 
1022 aa  64.7  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0641  transcriptional regulator, XRE family  32.34 
 
 
806 aa  65.1  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2522  Tetratricopeptide TPR_4  30.53 
 
 
958 aa  64.7  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.27051  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  30.26 
 
 
993 aa  64.3  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  24.89 
 
 
1550 aa  63.5  0.000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  33.01 
 
 
1003 aa  62.4  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0434  putative ATP/GTP binding protein  31.03 
 
 
713 aa  61.2  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.342423 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.42 
 
 
767 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5472  transcriptional regulator, SARP family  29.15 
 
 
994 aa  60.8  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.959943  normal  0.441932 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  25.77 
 
 
990 aa  60.1  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1600  hypothetical protein  26.28 
 
 
1383 aa  59.7  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.726146  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3131  NB-ARC domain-containing protein  26.67 
 
 
399 aa  59.7  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00106243 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  26.39 
 
 
971 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3099  transcriptional regulator, SARP family  29.21 
 
 
910 aa  59.3  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2767  hypothetical protein  29.51 
 
 
715 aa  59.3  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0532773  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  26.75 
 
 
1108 aa  58.9  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.319347 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  27.1 
 
 
1262 aa  58.9  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5280  transcriptional regulator, SARP family  27.42 
 
 
632 aa  58.9  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18548  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2954  transcriptional regulator, XRE family  27.68 
 
 
915 aa  58.9  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00111801 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  28.57 
 
 
995 aa  58.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  26.42 
 
 
2413 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0226  hypothetical protein  32.85 
 
 
345 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0353537  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  30.27 
 
 
990 aa  57.8  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2249  hypothetical protein  24.24 
 
 
916 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.560102  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06955  conserved hypothetical protein  24.74 
 
 
526 aa  57.4  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3782  transcriptional regulator, SARP family  26.49 
 
 
982 aa  57.4  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.519842  hitchhiker  0.00738187 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5051  transcriptional regulator, SARP family  29.56 
 
 
965 aa  57.4  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1666  transcriptional regulator, XRE family  29.52 
 
 
462 aa  57.4  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.237229  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0976  transcriptional regulator, XRE family  30.36 
 
 
775 aa  57  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0796  transcriptional regulator, SARP family  28.88 
 
 
1033 aa  57  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64254  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3637  transcriptional regulator, XRE family  28.53 
 
 
757 aa  57  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.317729  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0899  transcriptional regulator, SARP family  29.72 
 
 
919 aa  56.6  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0538686 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0545  hypothetical protein  24.43 
 
 
969 aa  56.2  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.963711 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  28.33 
 
 
1021 aa  56.2  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  28.57 
 
 
921 aa  56.2  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2713  NB-ARC domain protein  30.33 
 
 
838 aa  55.8  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000220271  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>