52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0459 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0459  hypothetical protein  100 
 
 
1017 aa  2060    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.104459 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2249  hypothetical protein  27.98 
 
 
916 aa  146  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.560102  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5512  hypothetical protein  27.67 
 
 
918 aa  143  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.104688  normal  0.128387 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4516  NB-ARC domain protein  30.43 
 
 
1509 aa  97.1  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.247222 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1407  putative ATP/GTP binding protein  33.08 
 
 
859 aa  85.5  0.000000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1603  NB-ARC domain protein  26.4 
 
 
843 aa  85.5  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0482408  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0403  hypothetical protein  26.96 
 
 
1523 aa  84.3  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  30.94 
 
 
1000 aa  79.7  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6956  NB-ARC domain-containing protein  26.01 
 
 
1500 aa  80.5  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.270488 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5724  ATP/GTP-binding protein  28.88 
 
 
1309 aa  77  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.308781 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4251  tetratricopeptide TPR_4  29.9 
 
 
899 aa  76.3  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.553547  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4762  putative ATP/GTP binding protein  32.29 
 
 
675 aa  73.9  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7957  Tetratricopeptide TPR_4  26.9 
 
 
1324 aa  74.3  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0918027  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2553  putative ATP/GTP-binding protein  28.49 
 
 
838 aa  74.3  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000100802  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1260  putative ATP/GTP binding protein  30.38 
 
 
900 aa  73.6  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.223492  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1167  putative ATP/GTP binding protein  30.69 
 
 
992 aa  72.4  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.944316  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6918  putative ATP/GTP-binding protein  26.02 
 
 
845 aa  72.4  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1862  NB-ARC domain protein  28.67 
 
 
897 aa  71.6  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  28.41 
 
 
785 aa  71.2  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4606  NB-ARC domain protein  28.32 
 
 
1261 aa  68.2  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.350947  normal  0.437049 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2455  tetratricopeptide TPR_4  31.15 
 
 
829 aa  65.5  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262289  normal  0.779517 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  30.58 
 
 
1068 aa  63.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  27.82 
 
 
911 aa  63.5  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  34.68 
 
 
1056 aa  63.2  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0876  putative ATP/GTP binding protein  29.62 
 
 
934 aa  62.4  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5728  tetratricopeptide TPR_4  27.64 
 
 
849 aa  61.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2650  tetratricopeptide TPR_4  28.57 
 
 
1311 aa  60.8  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0589865  normal  0.0118034 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0434  putative ATP/GTP binding protein  31.61 
 
 
713 aa  60.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.342423 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3272  hypothetical protein  27.56 
 
 
801 aa  59.7  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  26.92 
 
 
1131 aa  58.9  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03881  conserved hypothetical protein  27.64 
 
 
1125 aa  58.9  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.693693 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1513  tetratricopeptide TPR_4  30.41 
 
 
1326 aa  57.8  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  29.51 
 
 
1288 aa  57.8  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0441  hypothetical protein  26.71 
 
 
1010 aa  57.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.38406 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0515  putative ATP/GTP-binding protein  26.47 
 
 
1314 aa  55.5  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.388399 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  25.11 
 
 
1262 aa  55.5  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  22.5 
 
 
1039 aa  54.7  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5337  TIR protein  27.84 
 
 
385 aa  54.3  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.135441 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01071  conserved hypothetical protein  25.93 
 
 
1185 aa  53.9  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0324435  normal  0.67029 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10398  conserved hypothetical protein  29.31 
 
 
335 aa  52.8  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1600  hypothetical protein  25.95 
 
 
1383 aa  52.8  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.726146  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01580  conserved hypothetical protein  27.97 
 
 
1128 aa  52.4  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0427699 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06955  conserved hypothetical protein  25.24 
 
 
526 aa  50.8  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3866  NB-ARC domain protein  25.85 
 
 
680 aa  50.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.641069 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3483  NB-ARC domain protein  25 
 
 
793 aa  50.8  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6333  hypothetical protein  31.36 
 
 
373 aa  50.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  26.11 
 
 
924 aa  50.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02895  LipA and NB-ARC domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G11500)  26.09 
 
 
1478 aa  47.4  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5148  hypothetical protein  27.11 
 
 
392 aa  47.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0430972  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5158  TPR repeat-containing protein  28.9 
 
 
652 aa  47  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.455207  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2454  tetratricopeptide TPR_4  27.81 
 
 
686 aa  45.1  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.928825  normal 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5267  TPR repeat-containing protein  26.21 
 
 
640 aa  45.1  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.433566  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>