296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4762 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4762  putative ATP/GTP binding protein  100 
 
 		 675 aa  1320    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0876  putative ATP/GTP binding protein  47.33 
 
 		 934 aa  436  1e-121  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1407  putative ATP/GTP binding protein  46.72 
 
 		 859 aa  426  1e-117  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2455  tetratricopeptide TPR_4  45.77 
 
 		 829 aa  424  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262289  normal  0.779517 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1260  putative ATP/GTP binding protein  44.93 
 
 		 900 aa  411  1e-113  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.223492  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1167  putative ATP/GTP binding protein  47.37 
 
 		 992 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.944316  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1862  NB-ARC domain protein  45.19 
 
 		 897 aa  405  1e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  45.91 
 
 		 1000 aa  383  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7957  Tetratricopeptide TPR_4  39.66 
 
 		 1324 aa  354  2.9999999999999997e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6918  putative ATP/GTP-binding protein  36.58 
 
 		 845 aa  323  5e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0515  putative ATP/GTP-binding protein  35.55 
 
 		 1314 aa  301  2e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.388399 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6956  NB-ARC domain-containing protein  34.17 
 
 		 1500 aa  291  3e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.270488 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5724  ATP/GTP-binding protein  35.14 
 
 		 1309 aa  286  1.0000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.308781 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1603  NB-ARC domain protein  32.59 
 
 		 843 aa  283  9e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0482408  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5728  tetratricopeptide TPR_4  35.14 
 
 		 849 aa  274  4.0000000000000004e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  34.98 
 
 		 1056 aa  269  1e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1600  hypothetical protein  33.49 
 
 		 1383 aa  262  2e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.726146  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2553  putative ATP/GTP-binding protein  33.33 
 
 		 838 aa  261  2e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000100802  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  33.7 
 
 		 785 aa  259  2e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2650  tetratricopeptide TPR_4  34.63 
 
 		 1311 aa  256  8e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0589865  normal  0.0118034 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  32.19 
 
 		 911 aa  252  2e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  35.23 
 
 		 1068 aa  242  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4186  tetratricopeptide TPR_4  33.13 
 
 		 963 aa  241  4e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4251  tetratricopeptide TPR_4  35.74 
 
 		 899 aa  229  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.553547  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0403  hypothetical protein  31.63 
 
 		 1523 aa  223  8e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4516  NB-ARC domain protein  31.76 
 
 		 1509 aa  220  7e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.247222 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  26.37 
 
 		 1039 aa  218  2e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3272  hypothetical protein  34.8 
 
 		 801 aa  216  8e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0434  putative ATP/GTP binding protein  33.9 
 
 		 713 aa  215  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.342423 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2454  tetratricopeptide TPR_4  33.92 
 
 		 686 aa  213  9e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.928825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  27.93 
 
 		 1088 aa  194  6e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01071  conserved hypothetical protein  27.89 
 
 		 1185 aa  192  2e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0324435  normal  0.67029 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 1105 aa  186  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08322  conserved hypothetical protein  26.76 
 
 		 1050 aa  183  1e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  31.81 
 
 		 924 aa  176  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5289  TPR repeat-containing protein  25.75 
 
 		 857 aa  169  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.752131  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03881  conserved hypothetical protein  27.34 
 
 		 1125 aa  168  4e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.693693 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4606  NB-ARC domain protein  27.58 
 
 		 1261 aa  162  3e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.350947  normal  0.437049 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  25.76 
 
 		 1404 aa  160  7e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  25.46 
 
 		 1212 aa  159  2e-37  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  29.74 
 
 		 953 aa  158  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01580  conserved hypothetical protein  26.54 
 
 		 1128 aa  157  5.0000000000000005e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0427699 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4641  hypothetical protein  35.37 
 
 		 457 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1471  TPR repeat-containing protein  25.67 
 
 		 1283 aa  157  8e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.791072  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  27.67 
 
 		 672 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0136  TPR repeat-containing protein  27.52 
 
 		 776 aa  154  5e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.955072  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04339  conserved hypothetical protein  25.12 
 
 		 1146 aa  152  2e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.541265 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6333  hypothetical protein  42.62 
 
 		 373 aa  147  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  24.53 
 
 		 1288 aa  146  1e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  25.28 
 
 		 1262 aa  145  2e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3483  NB-ARC domain protein  27.08 
 
 		 793 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.92 
 
 		 767 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 814 aa  141  3.9999999999999997e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  43.58 
 
 		 1424 aa  141  4.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1951  tetratricopeptide TPR_4  52.87 
 
 		 358 aa  141  4.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.202218  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  24.82 
 
 		 1131 aa  139  2e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5267  TPR repeat-containing protein  30.24 
 
 		 640 aa  137  7.000000000000001e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.433566  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1513  tetratricopeptide TPR_4  30.7 
 
 		 1326 aa  136  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5337  TIR protein  41.84 
 
 		 385 aa  132  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.135441 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  25.52 
 
 		 843 aa  131  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  25.31 
 
 		 822 aa  128  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.5 
 
 		 568 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  34.5 
 
 		 568 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1729  TPR repeat-containing protein  42.05 
 
 		 837 aa  125  3e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.78 
 
 		 1186 aa  124  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2257  tetratricopeptide TPR_4  32.65 
 
 		 828 aa  122  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  23.97 
 
 		 2145 aa  120  7e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  40.64 
 
 		 1228 aa  120  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.688496 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08541  conserved hypothetical protein  24.9 
 
 		 577 aa  119  3e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0641  TPR repeat-containing protein  30.41 
 
 		 966 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249187 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3866  NB-ARC domain protein  25.29 
 
 		 680 aa  115  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.641069 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1822  NB-ARC  24.43 
 
 		 977 aa  114  9e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.244157  normal  0.101864 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10448  TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01710)  32.47 
 
 		 1488 aa  112  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.162575 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1587  NB-ARC  24.61 
 
 		 1044 aa  111  5e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257434  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08545  conserved hypothetical protein  25.71 
 
 		 1136 aa  110  6e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  34.67 
 
 		 454 aa  109  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  40.46 
 
 		 284 aa  110  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  23.29 
 
 		 1550 aa  109  2e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  35.14 
 
 		 751 aa  108  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5158  TPR repeat-containing protein  29.2 
 
 		 652 aa  107  6e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.455207  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1796  putative ATP/GTP binding protein  29.1 
 
 		 847 aa  107  6e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0346132  normal  0.567176 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0441  hypothetical protein  30.22 
 
 		 1010 aa  107  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.38406 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2522  Tetratricopeptide TPR_4  26.62 
 
 		 958 aa  107  7e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.27051  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0706  tetratricopeptide TPR_4  45.81 
 
 		 234 aa  104  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0416  TPR repeat-containing protein  32.66 
 
 		 481 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.80889 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32160  tetratricopeptide repeat protein  35.55 
 
 		 702 aa  102  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.277202 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  31.44 
 
 		 1328 aa  100  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1718  tetratricopeptide TPR_4  27.34 
 
 		 799 aa  97.4  8e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  32.8 
 
 		 825 aa  96.3  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 1215 aa  95.1  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1511  hypothetical protein  34.65 
 
 		 633 aa  92.4  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6844  Tetratricopeptide TPR_4  27.01 
 
 		 1468 aa  91.7  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0351351  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06956  conserved hypothetical protein  36.21 
 
 		 304 aa  89  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5207  TPR repeat-containing protein  27.93 
 
 		 671 aa  89.7  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143534  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2310  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.15 
 
 		 841 aa  89.4  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544847  normal  0.283617 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.32 
 
 		 771 aa  87.8  6e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  31.38 
 
 		 919 aa  86.7  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5148  hypothetical protein  35.85 
 
 		 392 aa  87  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0430972  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5147  TPR repeat-containing protein  31.79 
 
 		 469 aa  85.9  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0779428  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06955  conserved hypothetical protein  28.62 
 
 		 526 aa  82.4  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>