197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4641 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4641  hypothetical protein  100 
 
 
457 aa  894    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3272  hypothetical protein  51.64 
 
 
801 aa  390  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  31.15 
 
 
785 aa  170  5e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  30.86 
 
 
911 aa  168  2e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1260  putative ATP/GTP binding protein  35.14 
 
 
900 aa  154  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.223492  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2455  tetratricopeptide TPR_4  32.55 
 
 
829 aa  151  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262289  normal  0.779517 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4762  putative ATP/GTP binding protein  34.95 
 
 
675 aa  149  9e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6918  putative ATP/GTP-binding protein  29.67 
 
 
845 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1862  NB-ARC domain protein  36.15 
 
 
897 aa  146  7.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  30.09 
 
 
1088 aa  146  8.000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4186  tetratricopeptide TPR_4  33.68 
 
 
963 aa  145  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  34.45 
 
 
1068 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  30.67 
 
 
1056 aa  142  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  34.83 
 
 
1000 aa  141  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  26.74 
 
 
1039 aa  140  6e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  29.28 
 
 
1262 aa  137  3.0000000000000003e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1167  putative ATP/GTP binding protein  35.21 
 
 
992 aa  136  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.944316  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7957  Tetratricopeptide TPR_4  28.45 
 
 
1324 aa  131  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0918027  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01071  conserved hypothetical protein  28.64 
 
 
1185 aa  128  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0324435  normal  0.67029 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1407  putative ATP/GTP binding protein  31.28 
 
 
859 aa  126  7e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08322  conserved hypothetical protein  28.16 
 
 
1050 aa  124  3e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0403  hypothetical protein  29.63 
 
 
1523 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5724  ATP/GTP-binding protein  28.79 
 
 
1309 aa  117  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.308781 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1603  NB-ARC domain protein  28.71 
 
 
843 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0482408  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  29.3 
 
 
672 aa  114  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6956  NB-ARC domain-containing protein  28.22 
 
 
1500 aa  112  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.270488 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  27.06 
 
 
1212 aa  111  3e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0876  putative ATP/GTP binding protein  32.45 
 
 
934 aa  110  5e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5728  tetratricopeptide TPR_4  28.5 
 
 
849 aa  110  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.885214 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  26.81 
 
 
1288 aa  105  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0434  putative ATP/GTP binding protein  32.22 
 
 
713 aa  103  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.342423 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  27.16 
 
 
1131 aa  103  5e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  25.69 
 
 
1404 aa  103  6e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4516  NB-ARC domain protein  27.58 
 
 
1509 aa  102  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.247222 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.57 
 
 
767 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1471  TPR repeat-containing protein  25.84 
 
 
1283 aa  100  4e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.791072  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0515  putative ATP/GTP-binding protein  27.25 
 
 
1314 aa  100  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.388399 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08541  conserved hypothetical protein  25.64 
 
 
577 aa  99.8  8e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3483  NB-ARC domain protein  26.76 
 
 
793 aa  96.3  9e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  30.61 
 
 
1105 aa  96.7  9e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01580  conserved hypothetical protein  26.22 
 
 
1128 aa  94.7  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0427699 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.01 
 
 
1424 aa  94.4  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  39.2 
 
 
568 aa  94  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.2 
 
 
568 aa  94  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6335  hypothetical protein  46.51 
 
 
144 aa  93.2  9e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2553  putative ATP/GTP-binding protein  27.54 
 
 
838 aa  92.4  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000100802  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1600  hypothetical protein  27.58 
 
 
1383 aa  92  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.726146  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  29.5 
 
 
1228 aa  92  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.688496 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  41.13 
 
 
751 aa  91.3  4e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0416  TPR repeat-containing protein  42.15 
 
 
481 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.80889 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3866  NB-ARC domain protein  34.48 
 
 
680 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.641069 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08545  conserved hypothetical protein  24.19 
 
 
1136 aa  88.2  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.58 
 
 
1186 aa  88.2  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03881  conserved hypothetical protein  24.15 
 
 
1125 aa  87.4  4e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.693693 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  37.86 
 
 
843 aa  87.8  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5267  TPR repeat-containing protein  30.22 
 
 
640 aa  87.4  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.433566  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0136  TPR repeat-containing protein  27.17 
 
 
776 aa  86.7  8e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.955072  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  41.32 
 
 
1328 aa  86.3  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  37.19 
 
 
825 aa  85.5  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1796  putative ATP/GTP binding protein  46.85 
 
 
847 aa  85.1  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0346132  normal  0.567176 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04339  conserved hypothetical protein  25.52 
 
 
1146 aa  84.3  0.000000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.541265 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  45.83 
 
 
924 aa  84.3  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10448  TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01710)  41.27 
 
 
1488 aa  82.4  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.162575 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  39.67 
 
 
1215 aa  82.4  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2257  tetratricopeptide TPR_4  35.9 
 
 
828 aa  81.3  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  40.71 
 
 
284 aa  81.3  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5289  TPR repeat-containing protein  23.39 
 
 
857 aa  81.3  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.752131  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  36.43 
 
 
1040 aa  80.5  0.00000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5147  TPR repeat-containing protein  33.59 
 
 
469 aa  79.7  0.00000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0779428  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  33.54 
 
 
919 aa  79.3  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05237  conserved hypothetical protein  26.67 
 
 
551 aa  79  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00419082  hitchhiker  0.0029586 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  28.06 
 
 
814 aa  78.6  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  37.5 
 
 
454 aa  78.2  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1729  TPR repeat-containing protein  38.35 
 
 
837 aa  77.8  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6844  Tetratricopeptide TPR_4  28.94 
 
 
1468 aa  77.8  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0351351  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2118  TPR repeat-containing protein  30.81 
 
 
1028 aa  75.5  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  34.68 
 
 
953 aa  75.5  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.54 
 
 
787 aa  74.7  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  35.77 
 
 
493 aa  74.7  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3245  tetratricopeptide TPR_2  41.58 
 
 
212 aa  73.9  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2650  tetratricopeptide TPR_4  26.22 
 
 
1311 aa  73.6  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0589865  normal  0.0118034 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35 
 
 
771 aa  73.6  0.000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4251  tetratricopeptide TPR_4  29.67 
 
 
899 aa  73.6  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.553547  normal  0.492439 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06956  conserved hypothetical protein  35.58 
 
 
304 aa  73.2  0.000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
949 aa  72  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49558  predicted protein  36.75 
 
 
1106 aa  72  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.022156  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.76 
 
 
885 aa  69.7  0.00000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  30.65 
 
 
1550 aa  69.7  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32160  tetratricopeptide repeat protein  38.76 
 
 
702 aa  69.3  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.277202 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  34.92 
 
 
444 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2833  TPR repeat-containing protein  40.62 
 
 
344 aa  68.9  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.922484  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2707  kinesin light chain  33.07 
 
 
311 aa  68.2  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  27.06 
 
 
822 aa  67.8  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0229  TIR protein  27.27 
 
 
965 aa  67  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0105613  normal  0.178125 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0641  TPR repeat-containing protein  36.13 
 
 
966 aa  66.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.249187 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2528  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.56 
 
 
991 aa  65.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122653  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0167  TPR repeat-containing protein  32.86 
 
 
190 aa  65.1  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4606  NB-ARC domain protein  23.9 
 
 
1261 aa  64.7  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.350947  normal  0.437049 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  40.21 
 
 
1475 aa  63.9  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2652  hypothetical protein  28.24 
 
 
919 aa  63.9  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00496775  normal  0.0664064 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>