249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5728 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6918  putative ATP/GTP-binding protein  50.41 
 
 		 845 aa  751    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1603  NB-ARC domain protein  47.25 
 
 		 843 aa  703    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0482408  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5728  tetratricopeptide TPR_4  100 
 
 		 849 aa  1713    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2553  putative ATP/GTP-binding protein  42.74 
 
 		 838 aa  612  9.999999999999999e-175  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000100802  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6956  NB-ARC domain-containing protein  39.64 
 
 		 1500 aa  530  1e-149  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.270488 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7957  Tetratricopeptide TPR_4  39.26 
 
 		 1324 aa  509  9.999999999999999e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5724  ATP/GTP-binding protein  37.75 
 
 		 1309 aa  477  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.308781 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1600  hypothetical protein  37.2 
 
 		 1383 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.726146  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0515  putative ATP/GTP-binding protein  35.83 
 
 		 1314 aa  458  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.388399 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4516  NB-ARC domain protein  33.29 
 
 		 1509 aa  341  4e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.247222 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0403  hypothetical protein  31.76 
 
 		 1523 aa  335  2e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1167  putative ATP/GTP binding protein  35.85 
 
 		 992 aa  334  5e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.944316  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1862  NB-ARC domain protein  34.92 
 
 		 897 aa  322  9.999999999999999e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  34.68 
 
 		 1000 aa  315  2.9999999999999996e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1407  putative ATP/GTP binding protein  35.54 
 
 		 859 aa  305  3.0000000000000004e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1260  putative ATP/GTP binding protein  32.5 
 
 		 900 aa  300  7e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.223492  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2650  tetratricopeptide TPR_4  30.17 
 
 		 1311 aa  296  9e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0589865  normal  0.0118034 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0876  putative ATP/GTP binding protein  33.51 
 
 		 934 aa  285  3.0000000000000004e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  31.6 
 
 		 911 aa  262  2e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4762  putative ATP/GTP binding protein  35.14 
 
 		 675 aa  261  3e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  31.28 
 
 		 1068 aa  257  6e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0441  hypothetical protein  28.91 
 
 		 1010 aa  256  9e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.38406 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4606  NB-ARC domain protein  29.01 
 
 		 1261 aa  256  1.0000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.350947  normal  0.437049 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4186  tetratricopeptide TPR_4  31.2 
 
 		 963 aa  255  3e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  27.45 
 
 		 1039 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2455  tetratricopeptide TPR_4  31.87 
 
 		 829 aa  238  4e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262289  normal  0.779517 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  25.94 
 
 		 1262 aa  226  1e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4251  tetratricopeptide TPR_4  28.92 
 
 		 899 aa  226  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.553547  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  32.28 
 
 		 785 aa  223  8e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  29.87 
 
 		 1056 aa  221  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01071  conserved hypothetical protein  26.71 
 
 		 1185 aa  214  7e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0324435  normal  0.67029 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08322  conserved hypothetical protein  25.97 
 
 		 1050 aa  213  1e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  25.82 
 
 		 1288 aa  202  1.9999999999999998e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1513  tetratricopeptide TPR_4  28.4 
 
 		 1326 aa  201  5e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  29.81 
 
 		 1105 aa  200  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01580  conserved hypothetical protein  26.79 
 
 		 1128 aa  199  2.0000000000000003e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0427699 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  28.66 
 
 		 924 aa  197  7e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.65 
 
 		 1424 aa  184  6e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3272  hypothetical protein  29.89 
 
 		 801 aa  175  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2257  tetratricopeptide TPR_4  25.7 
 
 		 828 aa  176  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  25.66 
 
 		 1131 aa  174  5.999999999999999e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  26.41 
 
 		 1088 aa  170  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0434  putative ATP/GTP binding protein  29.5 
 
 		 713 aa  166  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.342423 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03881  conserved hypothetical protein  25.37 
 
 		 1125 aa  166  2.0000000000000002e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.693693 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1471  TPR repeat-containing protein  25.03 
 
 		 1283 aa  165  3e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.791072  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  25.93 
 
 		 953 aa  155  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04339  conserved hypothetical protein  25.59 
 
 		 1146 aa  154  5e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.541265 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10448  TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01710)  28.24 
 
 		 1488 aa  138  5e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.162575 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  21.82 
 
 		 1404 aa  133  1.0000000000000001e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  28.02 
 
 		 814 aa  130  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  25.17 
 
 		 1212 aa  129  2.0000000000000002e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6333  hypothetical protein  38.55 
 
 		 373 aa  129  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0136  TPR repeat-containing protein  26.23 
 
 		 776 aa  129  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.955072  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5289  TPR repeat-containing protein  23.86 
 
 		 857 aa  127  8.000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.752131  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  28.86 
 
 		 454 aa  125  4e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08545  conserved hypothetical protein  25.89 
 
 		 1136 aa  122  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 1215 aa  122  3.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.64 
 
 		 1186 aa  122  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.15 
 
 		 767 aa  120  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6844  Tetratricopeptide TPR_4  25.96 
 
 		 1468 aa  116  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0351351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  28.3 
 
 		 1328 aa  115  4.0000000000000004e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5337  TIR protein  36.23 
 
 		 385 aa  112  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.135441 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2522  Tetratricopeptide TPR_4  26.51 
 
 		 958 aa  110  7.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.27051  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4641  hypothetical protein  28.5 
 
 		 457 aa  110  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5158  TPR repeat-containing protein  34.68 
 
 		 652 aa  108  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.455207  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3483  NB-ARC domain protein  25.57 
 
 		 793 aa  108  5e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5267  TPR repeat-containing protein  28.22 
 
 		 640 aa  107  7e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.433566  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1729  TPR repeat-containing protein  31.34 
 
 		 837 aa  104  6e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  24.14 
 
 		 843 aa  104  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.68 
 
 		 885 aa  102  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5148  hypothetical protein  33.33 
 
 		 392 aa  99.8  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0430972  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  32.53 
 
 		 284 aa  98.6  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  21.78 
 
 		 2145 aa  97.1  1e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2454  tetratricopeptide TPR_4  27.12 
 
 		 686 aa  97.1  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.928825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  22.69 
 
 		 822 aa  96.3  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  20.62 
 
 		 1550 aa  95.9  3e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.67 
 
 		 787 aa  94.7  6e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  25.64 
 
 		 1475 aa  94.7  6e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2528  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.53 
 
 		 991 aa  94.7  7e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122653  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5207  TPR repeat-containing protein  32.88 
 
 		 671 aa  94.4  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143534  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.91 
 
 		 568 aa  94  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0199548 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08541  conserved hypothetical protein  23.66 
 
 		 577 aa  94  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  27.91 
 
 		 568 aa  94  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1796  putative ATP/GTP binding protein  28.61 
 
 		 847 aa  91.7  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0346132  normal  0.567176 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.78 
 
 		 771 aa  91.3  7e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06955  conserved hypothetical protein  28.24 
 
 		 526 aa  89.7  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  23.8 
 
 		 825 aa  89  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1587  NB-ARC  22.24 
 
 		 1044 aa  87.8  8e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3233  serine/threonine protein kinase  27.72 
 
 		 1290 aa  87  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.273331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3866  NB-ARC domain protein  24.7 
 
 		 680 aa  87.4  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.641069 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  27.78 
 
 		 672 aa  85.5  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  29.52 
 
 		 751 aa  85.1  0.000000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  23.6 
 
 		 1228 aa  84.7  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.688496 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2310  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.94 
 
 		 841 aa  81.3  0.00000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544847  normal  0.283617 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  22.99 
 
 		 732 aa  80.5  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54602  predicted protein  26.32 
 
 		 740 aa  80.1  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32160  tetratricopeptide repeat protein  34.12 
 
 		 702 aa  79.7  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.277202 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0641  TPR repeat-containing protein  24.29 
 
 		 966 aa  79.7  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249187 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  25.65 
 
 		 1507 aa  77  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1718  tetratricopeptide TPR_4  22.52 
 
 		 799 aa  75.9  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>