185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6333 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6333  hypothetical protein  100 
 
 		 373 aa  736    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5337  TIR protein  71.85 
 
 		 385 aa  386  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.135441 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0876  putative ATP/GTP binding protein  43.54 
 
 		 934 aa  214  9.999999999999999e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  42.04 
 
 		 1056 aa  194  3e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1407  putative ATP/GTP binding protein  44.58 
 
 		 859 aa  186  7e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1862  NB-ARC domain protein  42.36 
 
 		 897 aa  186  8e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1260  putative ATP/GTP binding protein  45.22 
 
 		 900 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.223492  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1167  putative ATP/GTP binding protein  44.36 
 
 		 992 aa  182  1e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.944316  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  43.49 
 
 		 1000 aa  181  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7957  Tetratricopeptide TPR_4  38.91 
 
 		 1324 aa  177  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  33.93 
 
 		 911 aa  175  9e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 785 aa  173  5e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  39.44 
 
 		 1068 aa  166  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2553  putative ATP/GTP-binding protein  41.09 
 
 		 838 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000100802  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6918  putative ATP/GTP-binding protein  40.93 
 
 		 845 aa  162  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4762  putative ATP/GTP binding protein  43.27 
 
 		 675 aa  160  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2455  tetratricopeptide TPR_4  39.46 
 
 		 829 aa  159  5e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262289  normal  0.779517 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6956  NB-ARC domain-containing protein  39.75 
 
 		 1500 aa  159  8e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.270488 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4251  tetratricopeptide TPR_4  36.48 
 
 		 899 aa  152  7e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.553547  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5728  tetratricopeptide TPR_4  39.31 
 
 		 849 aa  149  6e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0515  putative ATP/GTP-binding protein  38.78 
 
 		 1314 aa  149  8e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.388399 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1603  NB-ARC domain protein  38.19 
 
 		 843 aa  144  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0482408  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2650  tetratricopeptide TPR_4  35.25 
 
 		 1311 aa  132  9e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0589865  normal  0.0118034 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4516  NB-ARC domain protein  36.82 
 
 		 1509 aa  130  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.247222 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5724  ATP/GTP-binding protein  33.53 
 
 		 1309 aa  129  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.308781 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1600  hypothetical protein  35.71 
 
 		 1383 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.726146  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4606  NB-ARC domain protein  34.8 
 
 		 1261 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.350947  normal  0.437049 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4186  tetratricopeptide TPR_4  33.33 
 
 		 963 aa  117  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2454  tetratricopeptide TPR_4  33.72 
 
 		 686 aa  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.928825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0403  hypothetical protein  27.41 
 
 		 1523 aa  103  6e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3272  hypothetical protein  33.6 
 
 		 801 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  27.27 
 
 		 1039 aa  101  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  33.2 
 
 		 1088 aa  93.6  6e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  30.77 
 
 		 1288 aa  89.4  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0441  hypothetical protein  27.68 
 
 		 1010 aa  86.3  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.38406 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1513  tetratricopeptide TPR_4  32.47 
 
 		 1326 aa  85.5  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0434  putative ATP/GTP binding protein  35 
 
 		 713 aa  85.1  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.342423 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5267  TPR repeat-containing protein  34.72 
 
 		 640 aa  83.2  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.433566  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5148  hypothetical protein  34.02 
 
 		 392 aa  82  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0430972  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6357  TIR protein  42.95 
 
 		 715 aa  81.3  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  30.13 
 
 		 1131 aa  79.3  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1511  hypothetical protein  28.96 
 
 		 633 aa  79  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  32.48 
 
 		 983 aa  79.3  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5158  TPR repeat-containing protein  33.68 
 
 		 652 aa  78.2  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.455207  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04339  conserved hypothetical protein  27.39 
 
 		 1146 aa  75.5  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.541265 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  34.15 
 
 		 1228 aa  75.1  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.688496 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3483  NB-ARC domain protein  27.83 
 
 		 793 aa  75.5  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03881  conserved hypothetical protein  27.3 
 
 		 1125 aa  73.6  0.000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.693693 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01580  conserved hypothetical protein  30 
 
 		 1128 aa  73.6  0.000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0427699 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  27.51 
 
 		 1262 aa  71.6  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  32.56 
 
 		 993 aa  71.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  31.44 
 
 		 953 aa  71.6  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08322  conserved hypothetical protein  25.44 
 
 		 1050 aa  70.5  0.00000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5207  TPR repeat-containing protein  30.93 
 
 		 671 aa  70.5  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143534  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10398  conserved hypothetical protein  27.19 
 
 		 335 aa  67.8  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4641  hypothetical protein  37.16 
 
 		 457 aa  67.8  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3866  NB-ARC domain protein  30.93 
 
 		 680 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.641069 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0459  hypothetical protein  31.36 
 
 		 1017 aa  67.4  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.104459 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1471  TPR repeat-containing protein  27.35 
 
 		 1283 aa  67.4  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.791072  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  36.57 
 
 		 924 aa  66.6  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  26.72 
 
 		 1404 aa  66.6  0.0000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5289  TPR repeat-containing protein  29.47 
 
 		 857 aa  65.9  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.752131  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1587  NB-ARC  27.72 
 
 		 1044 aa  65.1  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5512  hypothetical protein  26.27 
 
 		 918 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.104688  normal  0.128387 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 1071 aa  64.7  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  25.64 
 
 		 1550 aa  64.3  0.000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06955  conserved hypothetical protein  25 
 
 		 526 aa  62.4  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2249  hypothetical protein  26.51 
 
 		 916 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.560102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1112  NB-ARC domain-containing protein  32.7 
 
 		 447 aa  62.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0411959  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  29.59 
 
 		 1105 aa  62.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08545  conserved hypothetical protein  26.64 
 
 		 1136 aa  61.6  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0641  TPR repeat-containing protein  32.67 
 
 		 966 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249187 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2522  Tetratricopeptide TPR_4  30.49 
 
 		 958 aa  61.2  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.27051  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0136  TPR repeat-containing protein  28.74 
 
 		 776 aa  61.6  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.955072  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2257  tetratricopeptide TPR_4  30.2 
 
 		 828 aa  62  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  34.97 
 
 		 814 aa  61.6  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01071  conserved hypothetical protein  26.43 
 
 		 1185 aa  61.2  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0324435  normal  0.67029 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1875  TIR protein  44.79 
 
 		 564 aa  60.8  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.399913 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2572  transcriptional regulator, SARP family  35.17 
 
 		 1011 aa  60.5  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  34.95 
 
 		 981 aa  60.5  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  29.96 
 
 		 995 aa  60.1  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  26.19 
 
 		 2145 aa  60.1  0.00000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  27.1 
 
 		 822 aa  60.1  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  24.53 
 
 		 1212 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6844  Tetratricopeptide TPR_4  33.73 
 
 		 1468 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0351351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2954  transcriptional regulator, XRE family  30.7 
 
 		 915 aa  58.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111801 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6515  transcriptional regulator, SARP family  33.79 
 
 		 1004 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409149  normal  0.360927 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3848  NB-ARC domain-containing protein  32.3 
 
 		 811 aa  58.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  31.4 
 
 		 992 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1951  tetratricopeptide TPR_4  40.2 
 
 		 358 aa  56.6  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.202218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  31.28 
 
 		 990 aa  56.6  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5691  transcriptional regulator, SARP family  31.88 
 
 		 956 aa  57  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1822  NB-ARC  29.27 
 
 		 977 aa  56.6  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.244157  normal  0.101864 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  35.03 
 
 		 992 aa  56.6  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  31.12 
 
 		 1108 aa  56.2  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0228  transcriptional regulator, XRE family  31.46 
 
 		 770 aa  56.2  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00256597  normal  0.277855 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  30.48 
 
 		 672 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  28.37 
 
 		 843 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  31.33 
 
 		 1003 aa  54.7  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6751  WD-40 repeat-containing protein  60.87 
 
 		 540 aa  54.7  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>