149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1112 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_1112  NB-ARC domain-containing protein  100 
 
 		 447 aa  899    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0411959  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  23.28 
 
 		 964 aa  63.5  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5472  transcriptional regulator, SARP family  30.05 
 
 		 994 aa  63.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.959943  normal  0.441932 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3866  NB-ARC domain protein  26.15 
 
 		 680 aa  60.1  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.641069 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  28.51 
 
 		 946 aa  58.9  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  31.33 
 
 		 1020 aa  58.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  25.88 
 
 		 1050 aa  58.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  28.35 
 
 		 992 aa  57.4  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7016  transcriptional regulator  25.65 
 
 		 973 aa  57  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252317  normal  0.0265916 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5826  transcriptional regulator  25.94 
 
 		 948 aa  56.2  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3338  transcriptional regulator, LuxR family  26.85 
 
 		 919 aa  55.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.682048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5717  transcriptional regulator  24.38 
 
 		 973 aa  56.6  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2832  transcriptional regulator, SARP family  25.87 
 
 		 1145 aa  55.8  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  23.7 
 
 		 1017 aa  55.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5609  transcriptional regulator  25.13 
 
 		 948 aa  55.5  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160081  normal  0.519557 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  27.22 
 
 		 1055 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5402  transcriptional regulator, winged helix family  27.9 
 
 		 901 aa  55.5  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  22.64 
 
 		 1108 aa  55.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  25.86 
 
 		 990 aa  55.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  24.31 
 
 		 999 aa  55.8  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0901  hypothetical protein  27.2 
 
 		 937 aa  54.7  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6350  transcriptional regulator  25.36 
 
 		 973 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00620791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1407  putative ATP/GTP binding protein  35.11 
 
 		 859 aa  54.7  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6333  hypothetical protein  38.24 
 
 		 373 aa  54.7  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5360  transcriptional regulator, SARP family  24.89 
 
 		 913 aa  54.3  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.265987 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5280  transcriptional regulator, SARP family  25.33 
 
 		 632 aa  54.3  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1621  transcriptional activator domain protein  21.88 
 
 		 1064 aa  54.7  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.77523  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  24.26 
 
 		 1049 aa  54.3  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  28.5 
 
 		 941 aa  53.9  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  24.18 
 
 		 1088 aa  53.5  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  23.24 
 
 		 1085 aa  53.5  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  25.84 
 
 		 981 aa  53.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1540  AAA ATPase  26.61 
 
 		 778 aa  53.1  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000740195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  25 
 
 		 957 aa  53.1  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5337  TIR protein  27.85 
 
 		 385 aa  53.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.135441 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2257  tetratricopeptide TPR_4  30.41 
 
 		 828 aa  53.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4526  transcriptional regulator  25 
 
 		 468 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3432  transcriptional regulator, SARP family  25.8 
 
 		 775 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00818273  normal  0.368034 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3101  transcriptional regulator, SARP family  27.59 
 
 		 910 aa  53.1  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.423529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0228  transcriptional regulator, XRE family  25.56 
 
 		 770 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00256597  normal  0.277855 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  24.02 
 
 		 921 aa  53.1  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  26.02 
 
 		 934 aa  52  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5728  tetratricopeptide TPR_4  30.49 
 
 		 849 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3099  transcriptional regulator, SARP family  25.11 
 
 		 910 aa  52  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8120  NB-ARC domain protein  25.33 
 
 		 978 aa  52.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5401  transcriptional regulator, winged helix family  24.65 
 
 		 906 aa  51.6  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  24.59 
 
 		 1125 aa  51.2  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0441  hypothetical protein  23.35 
 
 		 1010 aa  51.6  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.38406 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  32.28 
 
 		 1000 aa  51.2  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2248  transcriptional regulator  28.18 
 
 		 959 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1308  transcriptional regulator  22.87 
 
 		 493 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6521  transcriptional regulator  22.87 
 
 		 493 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0681996  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  24.17 
 
 		 1227 aa  50.8  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2677  NB-ARC domain protein  23.85 
 
 		 788 aa  50.8  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0391388 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 1221 aa  50.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1207  transcriptional regulator  22.55 
 
 		 922 aa  50.8  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.598339  normal  0.808052 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1866  XRE family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 812 aa  50.8  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7957  Tetratricopeptide TPR_4  26.41 
 
 		 1324 aa  50.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6123  transcriptional regulator  23.71 
 
 		 493 aa  50.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5408  transcriptional regulator, winged helix family  26.56 
 
 		 953 aa  50.4  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.17847  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1973  transcriptional regulator, SARP family  27.88 
 
 		 1008 aa  50.4  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5531  transcriptional regulator, SARP family  24.14 
 
 		 963 aa  50.1  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.394906 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  24.13 
 
 		 1071 aa  50.4  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3102  winged helix family transcriptional regulator  27.02 
 
 		 1034 aa  50.4  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.306498  normal  0.034161 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0394  transcriptional regulator, winged helix family  25 
 
 		 1049 aa  50.1  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4657  transcriptional regulator, winged helix family  26.86 
 
 		 1076 aa  49.7  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08322  conserved hypothetical protein  23.91 
 
 		 1050 aa  49.3  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01580  conserved hypothetical protein  25.16 
 
 		 1128 aa  49.3  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0427699 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  25 
 
 		 1003 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2522  Tetratricopeptide TPR_4  26.74 
 
 		 958 aa  49.3  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.27051  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  25.52 
 
 		 1097 aa  49.7  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5355  transcriptional regulator, SARP family  25.49 
 
 		 1138 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.610748 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2843  TPR repeat-containing protein  28.24 
 
 		 907 aa  48.5  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1958  transcriptional regulator  25.35 
 
 		 928 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  25.75 
 
 		 962 aa  48.9  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6918  putative ATP/GTP-binding protein  25.53 
 
 		 845 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  26.05 
 
 		 1056 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1167  putative ATP/GTP binding protein  32.08 
 
 		 992 aa  48.5  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.944316  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  25.33 
 
 		 1010 aa  48.5  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  25.1 
 
 		 931 aa  48.5  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2430  transcriptional regulator, SARP family  25.28 
 
 		 612 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930066 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1145  TPR repeat-containing protein  27.05 
 
 		 736 aa  48.5  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5267  TPR repeat-containing protein  29.03 
 
 		 640 aa  48.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.433566  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  25.91 
 
 		 1058 aa  48.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1260  putative ATP/GTP binding protein  35.11 
 
 		 900 aa  48.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.223492  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3483  NB-ARC domain protein  27.13 
 
 		 793 aa  47.8  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5286  transcriptional regulator, XRE family  27.42 
 
 		 810 aa  47.8  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  24.15 
 
 		 1093 aa  47.8  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2553  putative ATP/GTP-binding protein  26.61 
 
 		 838 aa  48.1  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000100802  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  23.56 
 
 		 1092 aa  47.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1232  transcriptional regulator  25 
 
 		 481 aa  47.4  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  24.1 
 
 		 822 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  24.5 
 
 		 1110 aa  47  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3287  transcriptional activator domain protein  25.64 
 
 		 1044 aa  47  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0920226  hitchhiker  0.00000903469 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1479  transcriptional regulator  25.63 
 
 		 502 aa  47  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  24 
 
 		 993 aa  46.6  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  27.27 
 
 		 1228 aa  47  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.688496 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0687  transcriptional regulator, SARP family  23.51 
 
 		 1003 aa  46.6  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.622837 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3477  hypothetical protein  24.36 
 
 		 996 aa  46.6  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6694  transcriptional regulator, winged helix family  25.21 
 
 		 504 aa  46.2  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.795253  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>