196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5337 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5337  TIR protein  100 
 
 		 385 aa  766    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.135441 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6333  hypothetical protein  71.85 
 
 		 373 aa  362  4e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0876  putative ATP/GTP binding protein  46.03 
 
 		 934 aa  284  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  41.03 
 
 		 911 aa  254  1.0000000000000001e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  40.22 
 
 		 785 aa  250  2e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  43.41 
 
 		 1056 aa  246  6.999999999999999e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2455  tetratricopeptide TPR_4  41.32 
 
 		 829 aa  216  4e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262289  normal  0.779517 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1862  NB-ARC domain protein  39.61 
 
 		 897 aa  211  1e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1260  putative ATP/GTP binding protein  40.17 
 
 		 900 aa  210  3e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.223492  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1407  putative ATP/GTP binding protein  37.88 
 
 		 859 aa  207  3e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  39.51 
 
 		 1068 aa  200  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1167  putative ATP/GTP binding protein  37.71 
 
 		 992 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.944316  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1951  tetratricopeptide TPR_4  57.46 
 
 		 358 aa  197  4.0000000000000005e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.202218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6357  TIR protein  48.35 
 
 		 715 aa  186  5e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2317  TIR protein  55.03 
 
 		 266 aa  185  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6751  WD-40 repeat-containing protein  64.18 
 
 		 540 aa  175  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4251  tetratricopeptide TPR_4  33.86 
 
 		 899 aa  169  8e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.553547  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4186  tetratricopeptide TPR_4  36.84 
 
 		 963 aa  165  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7957  Tetratricopeptide TPR_4  33.69 
 
 		 1324 aa  163  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1486  hypothetical protein  49.7 
 
 		 705 aa  159  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6388  putative ATP/GTP binding protein  54.88 
 
 		 161 aa  158  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124755 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6780  hypothetical protein  55.29 
 
 		 405 aa  155  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  33.5 
 
 		 850 aa  152  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5724  ATP/GTP-binding protein  31.9 
 
 		 1309 aa  151  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.308781 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3107  hypothetical protein  49.34 
 
 		 235 aa  146  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408395  normal  0.664388 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2751  WD-40 repeat-containing protein  36.34 
 
 		 1355 aa  145  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6114  TIR protein  50 
 
 		 237 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8809  TIR protein  49.69 
 
 		 238 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0515  putative ATP/GTP-binding protein  32.7 
 
 		 1314 aa  137  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.388399 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2995  Toll-interleukin receptor  47.02 
 
 		 374 aa  136  5e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.462352 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  48.03 
 
 		 1901 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1875  TIR protein  46.56 
 
 		 564 aa  134  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.399913 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  39.45 
 
 		 1000 aa  133  5e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4762  putative ATP/GTP binding protein  41.84 
 
 		 675 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3483  NB-ARC domain protein  31.36 
 
 		 793 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0313  hypothetical protein  45.45 
 
 		 388 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6918  putative ATP/GTP-binding protein  36.67 
 
 		 845 aa  120  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6956  NB-ARC domain-containing protein  36.68 
 
 		 1500 aa  119  9e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.270488 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2553  putative ATP/GTP-binding protein  38.43 
 
 		 838 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000100802  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5728  tetratricopeptide TPR_4  36.23 
 
 		 849 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2650  tetratricopeptide TPR_4  29.54 
 
 		 1311 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0589865  normal  0.0118034 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0319  TIR protein  40.28 
 
 		 157 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1603  NB-ARC domain protein  34.43 
 
 		 843 aa  107  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0482408  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1600  hypothetical protein  34.58 
 
 		 1383 aa  105  9e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.726146  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4516  NB-ARC domain protein  32.67 
 
 		 1509 aa  99.8  7e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.247222 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3522  hypothetical protein  37.8 
 
 		 268 aa  99  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.722717  normal  0.782368 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0434  putative ATP/GTP binding protein  35.95 
 
 		 713 aa  85.9  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.342423 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3439  hypothetical protein  39.04 
 
 		 464 aa  84.7  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.492006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6887  hypothetical protein  35.76 
 
 		 524 aa  84.7  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0441  hypothetical protein  25.07 
 
 		 1010 aa  83.2  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.38406 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4606  NB-ARC domain protein  32.83 
 
 		 1261 aa  82.8  0.000000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.350947  normal  0.437049 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0403  hypothetical protein  29.56 
 
 		 1523 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  27.23 
 
 		 1039 aa  73.9  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3272  hypothetical protein  33.18 
 
 		 801 aa  72.4  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5148  hypothetical protein  32.98 
 
 		 392 aa  71.2  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0430972  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5158  TPR repeat-containing protein  33.51 
 
 		 652 aa  70.5  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.455207  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2454  tetratricopeptide TPR_4  27.98 
 
 		 686 aa  70.1  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.928825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5267  TPR repeat-containing protein  32.98 
 
 		 640 aa  69.7  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.433566  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  33.17 
 
 		 1088 aa  69.7  0.00000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  32.09 
 
 		 993 aa  68.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01580  conserved hypothetical protein  28.91 
 
 		 1128 aa  67.8  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0427699 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1513  tetratricopeptide TPR_4  32.08 
 
 		 1326 aa  65.5  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5207  TPR repeat-containing protein  32.98 
 
 		 671 aa  65.5  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143534  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  28.8 
 
 		 1288 aa  64.7  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04339  conserved hypothetical protein  25.58 
 
 		 1146 aa  64.7  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.541265 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0136  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 		 776 aa  64.3  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.955072  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  28.33 
 
 		 1131 aa  63.9  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  30.46 
 
 		 953 aa  62.8  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  29.7 
 
 		 990 aa  62.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3866  NB-ARC domain protein  30.77 
 
 		 680 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.641069 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3432  transcriptional regulator, SARP family  29.36 
 
 		 775 aa  60.5  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00818273  normal  0.368034 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1587  NB-ARC  27.55 
 
 		 1044 aa  60.1  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  31.89 
 
 		 672 aa  60.1  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3801  transcriptional regulator, SARP family  31.88 
 
 		 993 aa  59.7  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000525265 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10398  conserved hypothetical protein  28.65 
 
 		 335 aa  59.7  0.00000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  30.58 
 
 		 1228 aa  59.3  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.688496 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1511  hypothetical protein  26.73 
 
 		 633 aa  59.3  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  31.82 
 
 		 981 aa  58.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3848  NB-ARC domain-containing protein  28.64 
 
 		 811 aa  58.9  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  28.96 
 
 		 816 aa  57.8  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2713  NB-ARC domain protein  32.04 
 
 		 838 aa  57.4  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000220271  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  33.74 
 
 		 814 aa  57  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  28.63 
 
 		 996 aa  57.4  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  30.31 
 
 		 1108 aa  56.6  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5118  SARP family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 1346 aa  57  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0180644  normal  0.388014 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1770  Tetratricopeptide TPR_4  28.04 
 
 		 741 aa  57  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.430666  normal  0.588831 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1958  transcriptional regulator  34.48 
 
 		 928 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  29.29 
 
 		 1105 aa  56.6  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01071  conserved hypothetical protein  28.44 
 
 		 1185 aa  56.6  0.0000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0324435  normal  0.67029 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06955  conserved hypothetical protein  26.78 
 
 		 526 aa  56.2  0.0000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  31.49 
 
 		 957 aa  56.2  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1398  SARP family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 1319 aa  56.2  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229363  decreased coverage  0.000262464 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 1137 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2572  transcriptional regulator, SARP family  30.91 
 
 		 1011 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  26.97 
 
 		 1550 aa  56.2  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1471  TPR repeat-containing protein  24.58 
 
 		 1283 aa  55.5  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.791072  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  26.47 
 
 		 822 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  30.04 
 
 		 1025 aa  55.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  32.08 
 
 		 931 aa  54.7  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2954  transcriptional regulator, XRE family  28.99 
 
 		 915 aa  54.7  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111801 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>