165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0403 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0403  hypothetical protein  100 
 
 		 1523 aa  3077    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4516  NB-ARC domain protein  39.59 
 
 		 1509 aa  853    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.247222 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6956  NB-ARC domain-containing protein  31.45 
 
 		 1500 aa  535  1e-150  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.270488 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6918  putative ATP/GTP-binding protein  35.12 
 
 		 845 aa  428  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1600  hypothetical protein  28.32 
 
 		 1383 aa  404  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.726146  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1603  NB-ARC domain protein  33.49 
 
 		 843 aa  397  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0482408  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4606  NB-ARC domain protein  29.56 
 
 		 1261 aa  392  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.350947  normal  0.437049 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2553  putative ATP/GTP-binding protein  33.25 
 
 		 838 aa  364  8e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000100802  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7957  Tetratricopeptide TPR_4  31.57 
 
 		 1324 aa  361  5e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5728  tetratricopeptide TPR_4  31.76 
 
 		 849 aa  345  4e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5724  ATP/GTP-binding protein  30.28 
 
 		 1309 aa  327  1e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.308781 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  34.2 
 
 		 1000 aa  293  1e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1260  putative ATP/GTP binding protein  31.23 
 
 		 900 aa  291  6e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.223492  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1407  putative ATP/GTP binding protein  33.48 
 
 		 859 aa  291  9e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1862  NB-ARC domain protein  31.13 
 
 		 897 aa  283  2e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1167  putative ATP/GTP binding protein  33.68 
 
 		 992 aa  283  3e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.944316  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0515  putative ATP/GTP-binding protein  28.06 
 
 		 1314 aa  275  4.0000000000000004e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.388399 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2650  tetratricopeptide TPR_4  29.32 
 
 		 1311 aa  275  7e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0589865  normal  0.0118034 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  29.48 
 
 		 1068 aa  234  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0876  putative ATP/GTP binding protein  29.26 
 
 		 934 aa  228  8e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2455  tetratricopeptide TPR_4  30.34 
 
 		 829 aa  223  3e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262289  normal  0.779517 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4251  tetratricopeptide TPR_4  27.83 
 
 		 899 aa  216  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.553547  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4762  putative ATP/GTP binding protein  31.34 
 
 		 675 aa  216  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0441  hypothetical protein  26.64 
 
 		 1010 aa  213  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.38406 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4186  tetratricopeptide TPR_4  27.85 
 
 		 963 aa  201  7e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  27.85 
 
 		 911 aa  199  4.0000000000000005e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01071  conserved hypothetical protein  25.91 
 
 		 1185 aa  196  3e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0324435  normal  0.67029 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  29.04 
 
 		 785 aa  191  9e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  28.21 
 
 		 1056 aa  189  3e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1513  tetratricopeptide TPR_4  25.86 
 
 		 1326 aa  182  4e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08322  conserved hypothetical protein  24.49 
 
 		 1050 aa  180  2e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  24.5 
 
 		 1039 aa  173  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3272  hypothetical protein  26.8 
 
 		 801 aa  168  6.9999999999999995e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  23.23 
 
 		 1262 aa  167  1.0000000000000001e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03881  conserved hypothetical protein  24.19 
 
 		 1125 aa  161  1e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.693693 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  27.09 
 
 		 924 aa  159  4e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  22.26 
 
 		 1288 aa  153  2e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  25.12 
 
 		 1105 aa  152  6e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  22.96 
 
 		 1131 aa  151  1.0000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  24.34 
 
 		 1088 aa  145  4e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04339  conserved hypothetical protein  24.53 
 
 		 1146 aa  144  1.9999999999999998e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.541265 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2257  tetratricopeptide TPR_4  24.15 
 
 		 828 aa  139  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3483  NB-ARC domain protein  27.21 
 
 		 793 aa  137  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01580  conserved hypothetical protein  23.93 
 
 		 1128 aa  136  3e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0427699 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  24.17 
 
 		 814 aa  136  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0434  putative ATP/GTP binding protein  25.49 
 
 		 713 aa  128  7e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.342423 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.89 
 
 		 1424 aa  127  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  24.47 
 
 		 953 aa  123  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4641  hypothetical protein  29.44 
 
 		 457 aa  122  7.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.43 
 
 		 767 aa  114  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5289  TPR repeat-containing protein  21.88 
 
 		 857 aa  110  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.752131  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1471  TPR repeat-containing protein  22.85 
 
 		 1283 aa  109  5e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.791072  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08545  conserved hypothetical protein  22.35 
 
 		 1136 aa  108  6e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2454  tetratricopeptide TPR_4  26.85 
 
 		 686 aa  107  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.928825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6844  Tetratricopeptide TPR_4  25.03 
 
 		 1468 aa  107  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0351351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.24 
 
 		 1186 aa  105  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  21.98 
 
 		 822 aa  104  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  20.11 
 
 		 1404 aa  104  1e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0136  TPR repeat-containing protein  23.99 
 
 		 776 aa  103  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.955072  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1729  TPR repeat-containing protein  28.25 
 
 		 837 aa  101  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5267  TPR repeat-containing protein  26.34 
 
 		 640 aa  100  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.433566  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  22.93 
 
 		 1212 aa  97.4  2e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1796  putative ATP/GTP binding protein  26.25 
 
 		 847 aa  95.9  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0346132  normal  0.567176 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10448  TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01710)  24.35 
 
 		 1488 aa  94.7  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.162575 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  23.83 
 
 		 1228 aa  92  8e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.688496 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0641  TPR repeat-containing protein  23.6 
 
 		 966 aa  90.5  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249187 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  24.83 
 
 		 843 aa  87.8  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0459  hypothetical protein  26.96 
 
 		 1017 aa  84  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.104459 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6333  hypothetical protein  26.25 
 
 		 373 aa  84.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5158  TPR repeat-containing protein  29.58 
 
 		 652 aa  84  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.455207  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  26.13 
 
 		 1475 aa  83.2  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5148  hypothetical protein  28.71 
 
 		 392 aa  82.4  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0430972  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4304  hypothetical protein  23.08 
 
 		 862 aa  81.6  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0966898  normal  0.160271 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2228  hypothetical protein  24.93 
 
 		 1196 aa  80.1  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  24.67 
 
 		 454 aa  79.3  0.0000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  22.62 
 
 		 672 aa  78.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3233  serine/threonine protein kinase  24.05 
 
 		 1290 aa  78.2  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.273331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5337  TIR protein  29.56 
 
 		 385 aa  77.8  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.135441 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2528  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.99 
 
 		 991 aa  76.3  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122653  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1731  hypothetical protein  23.17 
 
 		 877 aa  75.9  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  23.81 
 
 		 825 aa  75.5  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1587  NB-ARC  23.61 
 
 		 1044 aa  75.5  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  30.08 
 
 		 284 aa  75.5  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32160  tetratricopeptide repeat protein  34.64 
 
 		 702 aa  75.1  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.277202 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2071  hypothetical protein  26.97 
 
 		 892 aa  73.9  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5207  TPR repeat-containing protein  27.7 
 
 		 671 aa  73.9  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143534  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.83 
 
 		 568 aa  73.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  24.83 
 
 		 568 aa  73.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06955  conserved hypothetical protein  26.42 
 
 		 526 aa  73.2  0.00000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1511  hypothetical protein  31 
 
 		 633 aa  73.2  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2310  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.19 
 
 		 841 aa  72.4  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544847  normal  0.283617 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  22.71 
 
 		 1328 aa  72.4  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2522  Tetratricopeptide TPR_4  23.47 
 
 		 958 aa  71.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.27051  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3105  hypothetical protein  23.77 
 
 		 745 aa  70.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.890364 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  26.58 
 
 		 949 aa  70.5  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3881  hypothetical protein  28.03 
 
 		 1199 aa  69.7  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0452998 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  22.38 
 
 		 1215 aa  68.9  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10398  conserved hypothetical protein  24.21 
 
 		 335 aa  67.8  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  24.62 
 
 		 444 aa  67.4  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5512  hypothetical protein  26.9 
 
 		 918 aa  66.2  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.104688  normal  0.128387 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>