285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0515 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7957  Tetratricopeptide TPR_4  49.81 
 
 		 1324 aa  1197    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0515  putative ATP/GTP-binding protein  100 
 
 		 1314 aa  2643    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.388399 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5724  ATP/GTP-binding protein  38.99 
 
 		 1309 aa  858    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.308781 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2650  tetratricopeptide TPR_4  40.34 
 
 		 1311 aa  893    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0589865  normal  0.0118034 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1513  tetratricopeptide TPR_4  33.78 
 
 		 1326 aa  531  1e-149  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6918  putative ATP/GTP-binding protein  35.87 
 
 		 845 aa  480  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5728  tetratricopeptide TPR_4  35.83 
 
 		 849 aa  480  1e-134  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2553  putative ATP/GTP-binding protein  34.86 
 
 		 838 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000100802  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6956  NB-ARC domain-containing protein  33.76 
 
 		 1500 aa  444  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.270488 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1603  NB-ARC domain protein  34.88 
 
 		 843 aa  432  1e-119  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0482408  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1600  hypothetical protein  32.9 
 
 		 1383 aa  393  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.726146  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0493  hypothetical protein  56.21 
 
 		 1046 aa  341  7e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00353648  decreased coverage  0.00104497 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4516  NB-ARC domain protein  31.55 
 
 		 1509 aa  329  3e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.247222 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1407  putative ATP/GTP binding protein  33.06 
 
 		 859 aa  328  4.0000000000000003e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4762  putative ATP/GTP binding protein  36.38 
 
 		 675 aa  313  2e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  33 
 
 		 1000 aa  311  4e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1862  NB-ARC domain protein  32.17 
 
 		 897 aa  308  5.0000000000000004e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1167  putative ATP/GTP binding protein  32.97 
 
 		 992 aa  296  2e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.944316  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1260  putative ATP/GTP binding protein  31.76 
 
 		 900 aa  295  3e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.223492  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0403  hypothetical protein  28.16 
 
 		 1523 aa  289  2e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2455  tetratricopeptide TPR_4  32.68 
 
 		 829 aa  282  2e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262289  normal  0.779517 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0876  putative ATP/GTP binding protein  32.39 
 
 		 934 aa  281  5e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0441  hypothetical protein  28.94 
 
 		 1010 aa  280  1e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.38406 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4251  tetratricopeptide TPR_4  30.71 
 
 		 899 aa  272  2.9999999999999997e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.553547  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  29.61 
 
 		 1068 aa  266  3e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  28.27 
 
 		 1056 aa  262  4e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4186  tetratricopeptide TPR_4  31.25 
 
 		 963 aa  260  1e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  26.66 
 
 		 911 aa  249  2e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4606  NB-ARC domain protein  28.18 
 
 		 1261 aa  235  3e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.350947  normal  0.437049 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  27.11 
 
 		 1262 aa  228  5.0000000000000005e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  25.2 
 
 		 1288 aa  219  2.9999999999999998e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  27.01 
 
 		 785 aa  219  4e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  24.49 
 
 		 1039 aa  212  4e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01071  conserved hypothetical protein  26.68 
 
 		 1185 aa  207  7e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0324435  normal  0.67029 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08322  conserved hypothetical protein  25.36 
 
 		 1050 aa  197  8.000000000000001e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  25.69 
 
 		 1105 aa  193  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  25.12 
 
 		 1131 aa  190  1e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 		 924 aa  187  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01580  conserved hypothetical protein  26.27 
 
 		 1128 aa  181  1e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0427699 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2257  tetratricopeptide TPR_4  25.24 
 
 		 828 aa  178  6e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  25.82 
 
 		 1088 aa  174  1e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0434  putative ATP/GTP binding protein  28.34 
 
 		 713 aa  172  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.342423 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03881  conserved hypothetical protein  24.61 
 
 		 1125 aa  169  2e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.693693 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3272  hypothetical protein  26.54 
 
 		 801 aa  170  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5289  TPR repeat-containing protein  23.28 
 
 		 857 aa  162  5e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.752131  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10448  TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01710)  29.57 
 
 		 1488 aa  158  7e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.162575 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.95 
 
 		 1424 aa  157  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6333  hypothetical protein  38.78 
 
 		 373 aa  145  5e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  24.24 
 
 		 953 aa  142  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1471  TPR repeat-containing protein  24.03 
 
 		 1283 aa  141  7e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.791072  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5337  TIR protein  32.43 
 
 		 385 aa  141  7.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.135441 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  23.39 
 
 		 1212 aa  138  7.000000000000001e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.73 
 
 		 1186 aa  137  9e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2454  tetratricopeptide TPR_4  25.9 
 
 		 686 aa  137  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.928825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0136  TPR repeat-containing protein  24.76 
 
 		 776 aa  137  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.955072  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1729  TPR repeat-containing protein  31.88 
 
 		 837 aa  135  3.9999999999999996e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  20.93 
 
 		 1550 aa  135  3.9999999999999996e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04339  conserved hypothetical protein  22.77 
 
 		 1146 aa  128  9e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.541265 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08545  conserved hypothetical protein  24.28 
 
 		 1136 aa  126  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  21.31 
 
 		 1404 aa  123  1.9999999999999998e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  25.74 
 
 		 814 aa  122  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.55 
 
 		 767 aa  119  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  28.39 
 
 		 454 aa  115  5e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1718  tetratricopeptide TPR_4  27.33 
 
 		 799 aa  111  7.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0641  TPR repeat-containing protein  25.66 
 
 		 966 aa  111  7.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249187 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  27.57 
 
 		 1215 aa  111  8.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  26.35 
 
 		 1328 aa  111  8.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  24.18 
 
 		 1228 aa  110  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.688496 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  21.18 
 
 		 2145 aa  110  2e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6844  Tetratricopeptide TPR_4  24.24 
 
 		 1468 aa  106  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0351351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4641  hypothetical protein  27.25 
 
 		 457 aa  105  7e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2528  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.25 
 
 		 991 aa  102  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122653  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5267  TPR repeat-containing protein  25.79 
 
 		 640 aa  101  9e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.433566  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  26.38 
 
 		 825 aa  101  9e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  27.7 
 
 		 1475 aa  101  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  25.23 
 
 		 843 aa  100  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3483  NB-ARC domain protein  24.81 
 
 		 793 aa  100  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1796  putative ATP/GTP binding protein  25.88 
 
 		 847 aa  99  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0346132  normal  0.567176 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  22.68 
 
 		 822 aa  99.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1822  NB-ARC  22.83 
 
 		 977 aa  98.6  8e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.244157  normal  0.101864 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6380  hypothetical protein  29.29 
 
 		 1017 aa  97.8  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.726246 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.7 
 
 		 568 aa  97.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  24.7 
 
 		 568 aa  97.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  31.02 
 
 		 751 aa  96.7  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  28.73 
 
 		 672 aa  96.3  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49686  predicted protein  25.61 
 
 		 686 aa  96.3  4e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2310  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.05 
 
 		 841 aa  96.3  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544847  normal  0.283617 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  29.33 
 
 		 284 aa  95.9  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2817  chromosome partitioning ATPase  30.14 
 
 		 472 aa  92  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1587  NB-ARC  22.47 
 
 		 1044 aa  91.3  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.2 
 
 		 771 aa  90.5  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5158  TPR repeat-containing protein  25.28 
 
 		 652 aa  90.9  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.455207  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5148  hypothetical protein  31.66 
 
 		 392 aa  89.7  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0430972  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  26.99 
 
 		 444 aa  89.7  4e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3282  chromosome partitioning ATPase  30.14 
 
 		 476 aa  89.4  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.24711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25 
 
 		 787 aa  88.6  6e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3866  NB-ARC domain protein  23.48 
 
 		 680 aa  88.6  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.641069 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  22.67 
 
 		 1040 aa  88.2  9e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1511  hypothetical protein  29.44 
 
 		 633 aa  87  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  24.86 
 
 		 1507 aa  87  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>