72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0493 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0493  hypothetical protein  100 
 
 
1046 aa  2098    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00353648  decreased coverage  0.00104497 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5724  ATP/GTP-binding protein  58.82 
 
 
1309 aa  395  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.308781 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2650  tetratricopeptide TPR_4  48.96 
 
 
1311 aa  335  3e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0589865  normal  0.0118034 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0515  putative ATP/GTP-binding protein  56.35 
 
 
1314 aa  329  1.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.388399 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7957  Tetratricopeptide TPR_4  49.23 
 
 
1324 aa  325  2e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0918027  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1513  tetratricopeptide TPR_4  41.55 
 
 
1326 aa  243  1e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6778  hypothetical protein  30.38 
 
 
670 aa  195  5e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3477  transcriptional regulator, XRE family  30.02 
 
 
737 aa  177  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.552103  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1950  putative signal transduction protein with Nacht domain  35.84 
 
 
778 aa  161  7e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0899222  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5025  hypothetical protein  30.06 
 
 
481 aa  149  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.898737  normal  0.21169 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0180  XRE family transcriptional regulator  28.55 
 
 
800 aa  147  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.476576  hitchhiker  0.00129717 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0399  hypothetical protein  32.75 
 
 
844 aa  142  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6380  hypothetical protein  29.62 
 
 
1017 aa  134  9e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.726246 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5192  NTPase (NACHT family)-like protein  30.29 
 
 
721 aa  132  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0473131 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26360  hypothetical protein  29.38 
 
 
715 aa  110  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3282  chromosome partitioning ATPase  33.95 
 
 
476 aa  109  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.24711  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2817  chromosome partitioning ATPase  33.49 
 
 
472 aa  108  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0869  hypothetical protein  30 
 
 
902 aa  96.7  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.181564 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2703  putative signal transduction protein with Nacht domain  27.95 
 
 
880 aa  91.3  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3400  putative signal transduction protein with Nacht domain  27.64 
 
 
880 aa  89.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1507  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  28.47 
 
 
825 aa  84  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000204604 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3129  NACHT family-like NTPase  35.14 
 
 
402 aa  81.6  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.554855  hitchhiker  0.000164305 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0709  hypothetical protein  23.96 
 
 
447 aa  76.3  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3580  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  23.74 
 
 
778 aa  75.5  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.786261 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2430  putative signal transduction protein with Nacht domain  29.67 
 
 
911 aa  73.9  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3997  SEFIR domain protein  35.29 
 
 
293 aa  71.6  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.565957  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0427  hypothetical protein  34.48 
 
 
276 aa  70.1  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3623  hypothetical protein  30.73 
 
 
888 aa  67.4  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.489503 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1614  hypothetical protein  31.61 
 
 
465 aa  67  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.190402  normal  0.863337 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3056  chromosome partitioning ATPase  30.39 
 
 
894 aa  66.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.490133 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1597  hypothetical protein  29.39 
 
 
909 aa  65.9  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.332095  normal  0.980488 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8748  hypothetical protein  25.62 
 
 
841 aa  65.5  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2173  hypothetical protein  35.03 
 
 
440 aa  65.5  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.785467  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4206  hypothetical protein  29.95 
 
 
429 aa  64.3  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2065  hypothetical protein  29.44 
 
 
432 aa  63.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.126756  decreased coverage  0.00107186 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0750  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.94 
 
 
254 aa  60.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal  0.078886 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1793  hypothetical protein  28.16 
 
 
1149 aa  60.1  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0302  cell division inhibitor  28.18 
 
 
257 aa  57  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0302  ParA family protein  28.18 
 
 
257 aa  57  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4284  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.64 
 
 
257 aa  57  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2798  cell division inhibitor  27.96 
 
 
251 aa  57.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.208643 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3447  cell division inhibitor  26.89 
 
 
252 aa  55.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2669  ParA family protein  26.89 
 
 
252 aa  55.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0703  hypothetical protein  26.85 
 
 
466 aa  55.1  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.190504  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1254  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.46 
 
 
250 aa  54.3  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3303  tetratricopeptide domain-containing protein  50 
 
 
1098 aa  53.5  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1136  cell division inhibitor  27.1 
 
 
263 aa  53.5  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0412072 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0220  cell division inhibitor MinD  26.52 
 
 
252 aa  53.1  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.709861 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2994  hypothetical protein  33.85 
 
 
435 aa  53.1  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5547  putative signal transduction protein with Nacht domain  31.25 
 
 
747 aa  53.1  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.653518  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17420  hypothetical protein  32.66 
 
 
436 aa  53.1  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.448731  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1318  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.63 
 
 
259 aa  53.1  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0453  ParA family protein  26.73 
 
 
255 aa  51.6  0.00008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.149306  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1185  hypothetical protein  24.36 
 
 
647 aa  50.1  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.132787  decreased coverage  0.00946214 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1170  cell division inhibitor  24.38 
 
 
256 aa  50.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1605  hypothetical protein  21.54 
 
 
1065 aa  49.3  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0129457  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3346  adenylate/guanylate cyclase  24.89 
 
 
1392 aa  48.9  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0911306  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5272  hypothetical protein  29.17 
 
 
857 aa  48.5  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26 
 
 
2240 aa  48.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1255  putative cell division inhibitor minD  25 
 
 
254 aa  47.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1843  SEFIR domain-containing protein  29.91 
 
 
513 aa  47.8  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3284  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.38 
 
 
309 aa  46.6  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2864  hypothetical protein  51.16 
 
 
905 aa  45.8  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0981058  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3318  chromosome partitioning ATPase protein-like  25.4 
 
 
274 aa  45.8  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2676  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48.94 
 
 
294 aa  45.8  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.391114 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2632  non-specific protein-tyrosine kinase  42 
 
 
745 aa  45.8  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.405291  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5325  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  29.37 
 
 
805 aa  45.8  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1660  sefir domain protein  30.16 
 
 
316 aa  45.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0959  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  39.68 
 
 
372 aa  45.1  0.007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.152007 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1413  capsular exopolysaccharide family  40.43 
 
 
735 aa  45.1  0.008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.44637  normal  0.40956 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0194  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  37.25 
 
 
575 aa  44.7  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.27748  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1586  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.92 
 
 
253 aa  44.7  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0407218 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>