42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3129 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3129  NACHT family-like NTPase  100 
 
 		 402 aa  812    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.554855  hitchhiker  0.000164305 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3580  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  38.08 
 
 		 778 aa  180  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.786261 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1507  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  40.8 
 
 		 825 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000204604 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2703  putative signal transduction protein with Nacht domain  38.15 
 
 		 880 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3400  putative signal transduction protein with Nacht domain  38.15 
 
 		 880 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0709  hypothetical protein  39.78 
 
 		 447 aa  142  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1950  putative signal transduction protein with Nacht domain  31.65 
 
 		 778 aa  84  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0899222  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0493  hypothetical protein  35.14 
 
 		 1046 aa  79  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00353648  decreased coverage  0.00104497 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26360  hypothetical protein  35.91 
 
 		 715 aa  78.6  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5192  NTPase (NACHT family)-like protein  35 
 
 		 721 aa  75.1  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0473131 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8748  hypothetical protein  30.85 
 
 		 841 aa  70.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5547  putative signal transduction protein with Nacht domain  35.67 
 
 		 747 aa  70.1  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.653518  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6778  hypothetical protein  31.22 
 
 		 670 aa  68.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0180  XRE family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 800 aa  62  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.476576  hitchhiker  0.00129717 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3477  transcriptional regulator, XRE family  29.89 
 
 		 737 aa  58.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.552103  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5325  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  23.5 
 
 		 805 aa  53.5  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2349  protein of unknown function DUF323  28.81 
 
 		 1186 aa  52.4  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.719002  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4040  hypothetical protein  53.49 
 
 		 72 aa  52.8  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.980634  normal  0.140721 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4437  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  22.4 
 
 		 725 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1500  putative signal transduction protein with Nacht domain  31.97 
 
 		 762 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1473  putative signal transduction protein with Nacht domain  31.97 
 
 		 762 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1642  putative signal transduction protein with Nacht domain  29.33 
 
 		 911 aa  50.4  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.409211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3181  NTPase (NACHT family)-like protein  30.94 
 
 		 1150 aa  50.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00494273  normal  0.197936 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5025  hypothetical protein  34.35 
 
 		 481 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.898737  normal  0.21169 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4811  putative signal transduction protein with Nacht domain  30.26 
 
 		 1067 aa  49.7  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.382069  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3244  signal transduction protein  26.67 
 
 		 799 aa  48.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0094323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0399  hypothetical protein  27.88 
 
 		 844 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0457  signal transduction protein  28.43 
 
 		 1049 aa  48.5  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0799  putative signal transduction protein with Nacht domain  32.71 
 
 		 549 aa  47.8  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1047  putative signal transduction protein with Nacht domain  28.81 
 
 		 1183 aa  45.8  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.598608  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2529  putative signal transduction protein with Nacht domain  26.9 
 
 		 1174 aa  45.8  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.250967  normal  0.208659 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2186  protein of unknown function DUF323  27.48 
 
 		 1007 aa  45.1  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000553602  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3214  putative signal transduction protein with Nacht domain  28 
 
 		 649 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.614434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3570  signal transduction protein  25.93 
 
 		 783 aa  45.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  27.23 
 
 		 1807 aa  45.1  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.3 
 
 		 1343 aa  44.7  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0067  signal transduction protein  24.19 
 
 		 773 aa  43.5  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.571466  normal  0.0199052 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1185  hypothetical protein  21.37 
 
 		 647 aa  43.5  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.132787  decreased coverage  0.00946214 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3090  putative signal transduction protein with Nacht domain  28.89 
 
 		 908 aa  43.5  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.624689  normal  0.76371 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1565  putative signal transduction protein with Nacht domain  28.93 
 
 		 1041 aa  43.1  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0856  hypothetical protein  29.25 
 
 		 923 aa  43.1  0.009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1587  protein of unknown function DUF323  30.06 
 
 		 1064 aa  42.7  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>