19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6778 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6778  hypothetical protein  100 
 
 		 670 aa  1301    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3477  transcriptional regulator, XRE family  32.53 
 
 		 737 aa  227  4e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.552103  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1950  putative signal transduction protein with Nacht domain  29.97 
 
 		 778 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0899222  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0180  XRE family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 800 aa  197  5.000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.476576  hitchhiker  0.00129717 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0493  hypothetical protein  31.53 
 
 		 1046 aa  192  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00353648  decreased coverage  0.00104497 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5025  hypothetical protein  33 
 
 		 481 aa  190  7e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.898737  normal  0.21169 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5192  NTPase (NACHT family)-like protein  28.76 
 
 		 721 aa  175  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0473131 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0399  hypothetical protein  28.18 
 
 		 844 aa  137  5e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2703  putative signal transduction protein with Nacht domain  22.31 
 
 		 880 aa  87.4  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3400  putative signal transduction protein with Nacht domain  21.71 
 
 		 880 aa  87  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0709  hypothetical protein  24.48 
 
 		 447 aa  73.6  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3580  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  20.26 
 
 		 778 aa  72.4  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.786261 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26360  hypothetical protein  26.86 
 
 		 715 aa  72  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3129  NACHT family-like NTPase  31.22 
 
 		 402 aa  59.7  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.554855  hitchhiker  0.000164305 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0427  hypothetical protein  31.72 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8748  hypothetical protein  35.29 
 
 		 841 aa  56.6  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3181  NTPase (NACHT family)-like protein  30.42 
 
 		 1150 aa  49.3  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00494273  normal  0.197936 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5123  hypothetical protein  27.9 
 
 		 949 aa  43.9  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1185  hypothetical protein  20.59 
 
 		 647 aa  43.9  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.132787  decreased coverage  0.00946214 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>