37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3477 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3477  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 737 aa  1399    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.552103  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0180  XRE family transcriptional regulator  45.06 
 
 		 800 aa  532  1e-149  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.476576  hitchhiker  0.00129717 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1950  putative signal transduction protein with Nacht domain  32.78 
 
 		 778 aa  228  4e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0899222  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5025  hypothetical protein  33.69 
 
 		 481 aa  173  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.898737  normal  0.21169 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0493  hypothetical protein  30.02 
 
 		 1046 aa  167  5e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00353648  decreased coverage  0.00104497 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5192  NTPase (NACHT family)-like protein  29.76 
 
 		 721 aa  150  8e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0473131 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0399  hypothetical protein  29.01 
 
 		 844 aa  146  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26360  hypothetical protein  31.75 
 
 		 715 aa  82.4  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3580  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  20.92 
 
 		 778 aa  82  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.786261 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8748  hypothetical protein  27.38 
 
 		 841 aa  80.9  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6778  hypothetical protein  37.95 
 
 		 670 aa  78.2  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0427  hypothetical protein  38.41 
 
 		 276 aa  74.7  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2703  putative signal transduction protein with Nacht domain  20.34 
 
 		 880 aa  70.1  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0709  hypothetical protein  21.56 
 
 		 447 aa  70.5  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3400  putative signal transduction protein with Nacht domain  20.19 
 
 		 880 aa  68.2  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5476  transcriptional regulator, XRE family  48.53 
 
 		 761 aa  54.7  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  47.76 
 
 		 816 aa  50.1  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5170  XRE family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 280 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.624653  normal  0.480627 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1507  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  22.61 
 
 		 825 aa  48.9  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000204604 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3129  NACHT family-like NTPase  33.94 
 
 		 402 aa  48.1  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.554855  hitchhiker  0.000164305 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2954  transcriptional regulator, XRE family  32.74 
 
 		 223 aa  47.8  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000000401895  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2467  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 122 aa  47.8  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000461389  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06790  hypothetical protein  42.11 
 
 		 187 aa  46.2  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171424  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0433  transcriptional regulator, XRE family  41.56 
 
 		 215 aa  46.6  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2125  transcriptional regulator, XRE family  45.45 
 
 		 91 aa  46.2  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0791  transcriptional regulator, XRE family  46.3 
 
 		 91 aa  46.6  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0650  XRE family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 91 aa  46.6  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3134  DNA-binding protein  44.64 
 
 		 80 aa  46.6  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1922  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 123 aa  45.8  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.189064  normal  0.0105553 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4610  XRE family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 252 aa  45.4  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.985679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0641  transcriptional regulator, XRE family  45.16 
 
 		 806 aa  45.8  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1165  toxin-antitoxin system, antitoxin component, Xre family  49.12 
 
 		 94 aa  45.4  0.004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000604987 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5286  transcriptional regulator, XRE family  41.79 
 
 		 810 aa  45.4  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0381  XRE family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 91 aa  45.4  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5326  transcriptional regulator, XRE family  41.18 
 
 		 68 aa  45.1  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.134062 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0504  transcriptional regulator  47.27 
 
 		 75 aa  44.7  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1887  XRE family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 104 aa  44.7  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.603654  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>