16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5025 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5025  hypothetical protein  100 
 
 		 481 aa  935    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.898737  normal  0.21169 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0180  XRE family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 800 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.476576  hitchhiker  0.00129717 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3477  transcriptional regulator, XRE family  33.7 
 
 		 737 aa  172  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.552103  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6778  hypothetical protein  32.26 
 
 		 670 aa  171  4e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0493  hypothetical protein  30.06 
 
 		 1046 aa  149  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00353648  decreased coverage  0.00104497 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1950  putative signal transduction protein with Nacht domain  28.85 
 
 		 778 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0899222  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5192  NTPase (NACHT family)-like protein  30.67 
 
 		 721 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0473131 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0399  hypothetical protein  27.24 
 
 		 844 aa  107  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5056  hypothetical protein  40.35 
 
 		 184 aa  63.2  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.152418 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26360  hypothetical protein  29.37 
 
 		 715 aa  60.5  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3400  putative signal transduction protein with Nacht domain  22.74 
 
 		 880 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2703  putative signal transduction protein with Nacht domain  22.48 
 
 		 880 aa  54.3  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3580  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  21.73 
 
 		 778 aa  53.9  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.786261 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8748  hypothetical protein  31.98 
 
 		 841 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0427  hypothetical protein  40.32 
 
 		 276 aa  48.9  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_15060  predicted protein  24.84 
 
 		 191 aa  44.3  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>