55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3580 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3580  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  100 
 
 		 778 aa  1576    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.786261 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2703  putative signal transduction protein with Nacht domain  41.05 
 
 		 880 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3400  putative signal transduction protein with Nacht domain  40.9 
 
 		 880 aa  469  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1507  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  41.57 
 
 		 825 aa  254  3e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000204604 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0709  hypothetical protein  31.27 
 
 		 447 aa  172  2e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3129  NACHT family-like NTPase  38.08 
 
 		 402 aa  166  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.554855  hitchhiker  0.000164305 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5547  putative signal transduction protein with Nacht domain  26.03 
 
 		 747 aa  89.4  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.653518  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1587  TIR protein  56.52 
 
 		 275 aa  89.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0118312 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0399  hypothetical protein  22.27 
 
 		 844 aa  85.1  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3477  transcriptional regulator, XRE family  20.87 
 
 		 737 aa  82.4  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.552103  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2860  NB-ARC domain protein  46.91 
 
 		 1144 aa  78.2  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1950  putative signal transduction protein with Nacht domain  21.19 
 
 		 778 aa  76.3  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0899222  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0180  XRE family transcriptional regulator  23.47 
 
 		 800 aa  74.7  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.476576  hitchhiker  0.00129717 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0493  hypothetical protein  23.74 
 
 		 1046 aa  73.2  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00353648  decreased coverage  0.00104497 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6778  hypothetical protein  21.53 
 
 		 670 aa  69.3  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26360  hypothetical protein  25.69 
 
 		 715 aa  67  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5192  NTPase (NACHT family)-like protein  25.79 
 
 		 721 aa  65.9  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0473131 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3570  signal transduction protein  30.9 
 
 		 783 aa  63.5  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3090  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.3 
 
 		 908 aa  60.1  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.624689  normal  0.76371 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1465  signal transduction protein  24.56 
 
 		 570 aa  60.8  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.137269 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3131  GUN4 domain protein  26.45 
 
 		 818 aa  58.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1473  putative signal transduction protein with Nacht domain  29.58 
 
 		 762 aa  57.8  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1500  putative signal transduction protein with Nacht domain  29.58 
 
 		 762 aa  57.8  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4040  hypothetical protein  58.33 
 
 		 72 aa  56.6  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.980634  normal  0.140721 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5025  hypothetical protein  21.96 
 
 		 481 aa  56.6  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.898737  normal  0.21169 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4437  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  26.07 
 
 		 725 aa  54.7  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3244  signal transduction protein  22.39 
 
 		 799 aa  54.7  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0094323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4531  hypothetical protein  38.18 
 
 		 73 aa  54.3  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.12716 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8748  hypothetical protein  24.12 
 
 		 841 aa  53.5  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2498  signal transduction protein  22.37 
 
 		 1349 aa  52.4  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2751  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  24.82 
 
 		 942 aa  51.6  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2529  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.91 
 
 		 1174 aa  52  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.250967  normal  0.208659 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0457  signal transduction protein  27.35 
 
 		 1049 aa  51.2  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3126  NTPase (NACHT family)-like protein  24.28 
 
 		 1282 aa  48.9  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.791023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1185  hypothetical protein  24.87 
 
 		 647 aa  48.9  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.132787  decreased coverage  0.00946214 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5325  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  25.96 
 
 		 805 aa  49.3  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4476  signal transduction protein  25.68 
 
 		 1237 aa  48.5  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.62278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0856  hypothetical protein  26.75 
 
 		 923 aa  48.9  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1916  signal transduction protein  23.5 
 
 		 766 aa  48.9  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.394463 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4811  putative signal transduction protein with Nacht domain  22.95 
 
 		 1067 aa  48.1  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.382069  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1642  putative signal transduction protein with Nacht domain  26.54 
 
 		 911 aa  48.1  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.409211 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.87 
 
 		 1438 aa  47.8  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0364  signal transduction protein  32.35 
 
 		 960 aa  47  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1763  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  27.23 
 
 		 1475 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.923912 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2192  protein of unknown function DUF323  30.71 
 
 		 1049 aa  47.4  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  27.45 
 
 		 1831 aa  47.4  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.29 
 
 		 1343 aa  46.2  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3181  NTPase (NACHT family)-like protein  22.42 
 
 		 1150 aa  46.2  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00494273  normal  0.197936 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1133  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  27 
 
 		 951 aa  45.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0460  hypothetical protein  30.06 
 
 		 965 aa  45.4  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0102271  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4985  signal transduction protein  25 
 
 		 1345 aa  45.4  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3088  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.18 
 
 		 798 aa  44.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2496  signal transduction protein  21.85 
 
 		 1339 aa  44.7  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2638  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  23.81 
 
 		 852 aa  44.3  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.637289 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0799  putative signal transduction protein with Nacht domain  30.37 
 
 		 549 aa  44.3  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>