70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1185 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_1185  hypothetical protein  100 
 
 
647 aa  1280    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.132787  decreased coverage  0.00946214 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0411  hypothetical protein  34.19 
 
 
637 aa  223  8e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0440311  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0430  NACHT family-like NTPase  26.91 
 
 
573 aa  109  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00169219  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3298  NACHT family-like NTPase  24.82 
 
 
625 aa  108  4e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3798  NACHT family-like NTPase  28.18 
 
 
584 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4437  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  26.36 
 
 
725 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5325  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  26.78 
 
 
805 aa  94.7  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2386  signal transduction protein  25.86 
 
 
595 aa  93.2  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.76685  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1916  signal transduction protein  24.52 
 
 
766 aa  86.7  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.394463 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1763  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  25.72 
 
 
1475 aa  80.9  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.923912 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1500  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.26 
 
 
762 aa  78.6  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1473  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.26 
 
 
762 aa  78.6  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4586  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.01 
 
 
1086 aa  77  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2449  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.54 
 
 
888 aa  76.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.152058  normal  0.158989 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0049  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.07 
 
 
944 aa  70.9  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229879  normal  0.368167 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3214  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.78 
 
 
649 aa  70.1  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.614434  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0650  signal transduction protein  24.46 
 
 
801 aa  68.9  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.190918 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0067  signal transduction protein  23.68 
 
 
773 aa  65.9  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.571466  normal  0.0199052 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3090  putative signal transduction protein with Nacht domain  22.05 
 
 
908 aa  65.5  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.624689  normal  0.76371 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4811  putative signal transduction protein with Nacht domain  20.1 
 
 
1067 aa  62.8  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.382069  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1465  signal transduction protein  25.06 
 
 
570 aa  60.8  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.137269 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2498  signal transduction protein  23.44 
 
 
1349 aa  60.1  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2751  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  24.79 
 
 
942 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3571  signal transduction protein  24.26 
 
 
2194 aa  59.7  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3244  signal transduction protein  24.67 
 
 
799 aa  58.9  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0094323  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4765  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  20.31 
 
 
887 aa  59.7  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2632  signal transduction protein  24.4 
 
 
1742 aa  58.5  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3131  GUN4 domain protein  20.11 
 
 
818 aa  58.9  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1133  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  24.32 
 
 
951 aa  58.9  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5163  signal transduction protein  18.84 
 
 
969 aa  58.5  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2563  putative signal transduction protein with Nacht domain  20 
 
 
997 aa  58.5  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.238788  normal  0.0710109 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7397  NTPase (NACHT family)-like protein  23.59 
 
 
1106 aa  57.8  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1392  putative signal transduction protein with Nacht domain  20.91 
 
 
1091 aa  57.4  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5124  hypothetical protein  21.33 
 
 
951 aa  57.4  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3181  NTPase (NACHT family)-like protein  23.97 
 
 
1150 aa  57.4  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00494273  normal  0.197936 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3570  signal transduction protein  25.35 
 
 
783 aa  57  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0622  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  23.01 
 
 
872 aa  57  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4985  signal transduction protein  23.72 
 
 
1345 aa  56.6  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266997  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2496  signal transduction protein  24.08 
 
 
1339 aa  56.2  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3050  NTPase (NACHT family)-like protein  21.7 
 
 
2216 aa  55.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.512729 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5141  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  23.19 
 
 
951 aa  55.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224088  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1605  hypothetical protein  24.38 
 
 
1065 aa  53.9  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0129457  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  22.5 
 
 
1148 aa  53.9  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1452  protein of unknown function DUF323  19.19 
 
 
1053 aa  53.1  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.32 
 
 
1343 aa  52.8  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3032  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.96 
 
 
1004 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00461923  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4476  signal transduction protein  21.72 
 
 
1237 aa  52  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.62278  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5122  signal transduction protein  20.83 
 
 
953 aa  52  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0457  signal transduction protein  19.73 
 
 
1049 aa  52  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1482  NTPase (NACHT family)-like protein  22.59 
 
 
1051 aa  50.4  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0735  protein of unknown function DUF323  19.44 
 
 
1201 aa  50.1  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3088  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.06 
 
 
798 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2529  putative signal transduction protein with Nacht domain  20.71 
 
 
1174 aa  48.9  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.250967  normal  0.208659 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  26.67 
 
 
1831 aa  48.5  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5241  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.49 
 
 
914 aa  48.5  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.668655  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1048  signal transduction protein  21.47 
 
 
1216 aa  47.8  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.958943  normal  0.02885 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4212  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  22.04 
 
 
1234 aa  47.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  26.14 
 
 
1094 aa  47.8  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  22.73 
 
 
1766 aa  46.6  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8620  putative signal transduction protein with Nacht domain  30.88 
 
 
1239 aa  46.2  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00545608  normal  0.590106 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.45 
 
 
2240 aa  45.4  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2430  putative signal transduction protein with Nacht domain  26.4 
 
 
911 aa  45.1  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0856  hypothetical protein  21.47 
 
 
923 aa  45.1  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2192  protein of unknown function DUF323  21.53 
 
 
1049 aa  44.7  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6778  hypothetical protein  20.59 
 
 
670 aa  44.7  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  25.35 
 
 
1901 aa  44.7  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.97 
 
 
1438 aa  44.3  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3580  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  24.62 
 
 
778 aa  44.3  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.786261 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0364  signal transduction protein  30.08 
 
 
960 aa  44.3  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2638  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  23.68 
 
 
852 aa  43.9  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.637289 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>