36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0709 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0709  hypothetical protein  100 
 
 
447 aa  904    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2703  putative signal transduction protein with Nacht domain  33.6 
 
 
880 aa  195  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3400  putative signal transduction protein with Nacht domain  33.6 
 
 
880 aa  194  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3580  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  31.64 
 
 
778 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.786261 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1507  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  32.64 
 
 
825 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000204604 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3129  NACHT family-like NTPase  39.78 
 
 
402 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.554855  hitchhiker  0.000164305 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5547  putative signal transduction protein with Nacht domain  30.69 
 
 
747 aa  78.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.653518  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0399  hypothetical protein  23.68 
 
 
844 aa  76.6  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6778  hypothetical protein  24.48 
 
 
670 aa  75.1  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1950  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.36 
 
 
778 aa  73.9  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0899222  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0493  hypothetical protein  23.96 
 
 
1046 aa  71.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00353648  decreased coverage  0.00104497 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3477  transcriptional regulator, XRE family  21.18 
 
 
737 aa  71.6  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.552103  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26360  hypothetical protein  25.5 
 
 
715 aa  68.6  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0180  XRE family transcriptional regulator  24.63 
 
 
800 aa  66.2  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.476576  hitchhiker  0.00129717 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3570  signal transduction protein  27.52 
 
 
783 aa  64.3  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5192  NTPase (NACHT family)-like protein  27.16 
 
 
721 aa  63.2  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0473131 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4531  hypothetical protein  49.12 
 
 
73 aa  62.8  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.12716 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5141  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  27.86 
 
 
951 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224088  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3181  NTPase (NACHT family)-like protein  26.03 
 
 
1150 aa  58.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00494273  normal  0.197936 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5325  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  23.76 
 
 
805 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4040  hypothetical protein  60 
 
 
72 aa  55.8  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.980634  normal  0.140721 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4985  signal transduction protein  27.45 
 
 
1345 aa  52  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266997  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8748  hypothetical protein  28.72 
 
 
841 aa  49.3  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2498  signal transduction protein  24.29 
 
 
1349 aa  48.5  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2496  signal transduction protein  23.17 
 
 
1339 aa  48.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0460  hypothetical protein  28.67 
 
 
965 aa  48.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0102271  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3090  putative signal transduction protein with Nacht domain  26.61 
 
 
908 aa  48.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.624689  normal  0.76371 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0364  signal transduction protein  25.57 
 
 
960 aa  47.8  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.24 
 
 
1343 aa  46.2  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1473  putative signal transduction protein with Nacht domain  30.16 
 
 
762 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0735  protein of unknown function DUF323  29.58 
 
 
1201 aa  44.7  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1500  putative signal transduction protein with Nacht domain  30.16 
 
 
762 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4437  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  21.65 
 
 
725 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1299  hypothetical protein  27.21 
 
 
1492 aa  43.1  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3214  putative signal transduction protein with Nacht domain  26.77 
 
 
649 aa  43.5  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.614434  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  23.87 
 
 
1901 aa  43.1  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>