24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5192 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5192  NTPase (NACHT family)-like protein  100 
 
 		 721 aa  1438    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0473131 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1950  putative signal transduction protein with Nacht domain  39.07 
 
 		 778 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0899222  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0180  XRE family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 800 aa  178  4e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.476576  hitchhiker  0.00129717 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6778  hypothetical protein  28.81 
 
 		 670 aa  172  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3477  transcriptional regulator, XRE family  30.25 
 
 		 737 aa  159  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.552103  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5025  hypothetical protein  30.67 
 
 		 481 aa  144  7e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.898737  normal  0.21169 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0399  hypothetical protein  26.35 
 
 		 844 aa  137  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0493  hypothetical protein  30.53 
 
 		 1046 aa  129  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00353648  decreased coverage  0.00104497 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0427  hypothetical protein  35.13 
 
 		 276 aa  114  5e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26360  hypothetical protein  29.74 
 
 		 715 aa  100  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8748  hypothetical protein  27.69 
 
 		 841 aa  79.7  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2703  putative signal transduction protein with Nacht domain  22.73 
 
 		 880 aa  64.7  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0709  hypothetical protein  22.71 
 
 		 447 aa  65.1  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3580  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  25.79 
 
 		 778 aa  63.9  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.786261 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3400  putative signal transduction protein with Nacht domain  22.44 
 
 		 880 aa  63.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3129  NACHT family-like NTPase  35 
 
 		 402 aa  62.4  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.554855  hitchhiker  0.000164305 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1465  signal transduction protein  30.67 
 
 		 570 aa  57.4  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.137269 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1507  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  27.5 
 
 		 825 aa  54.3  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000204604 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3214  putative signal transduction protein with Nacht domain  26.36 
 
 		 649 aa  52  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.614434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1133  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  24.74 
 
 		 951 aa  47.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4437  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  24.5 
 
 		 725 aa  45.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.08 
 
 		 2240 aa  44.7  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1500  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.81 
 
 		 762 aa  43.9  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1473  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.81 
 
 		 762 aa  43.9  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>