More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0735 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1047  putative signal transduction protein with Nacht domain  43.31 
 
 		 1183 aa  972    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.598608  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1562  putative signal transduction protein with Nacht domain  43.58 
 
 		 1044 aa  704    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0856  hypothetical protein  44.61 
 
 		 923 aa  711    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2349  protein of unknown function DUF323  46.05 
 
 		 1186 aa  1021    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.719002  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0735  protein of unknown function DUF323  100 
 
 		 1201 aa  2494    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2186  protein of unknown function DUF323  44.97 
 
 		 1007 aa  716    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000553602  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1452  protein of unknown function DUF323  61.5 
 
 		 1053 aa  1088    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1565  putative signal transduction protein with Nacht domain  44.43 
 
 		 1041 aa  737    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2427  putative signal transduction protein with Nacht domain  46.9 
 
 		 1044 aa  733    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.509479  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2344  protein of unknown function DUF323  41.23 
 
 		 1190 aa  827    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1553  putative signal transduction protein with Nacht domain  44.36 
 
 		 1023 aa  757    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0972336  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2192  protein of unknown function DUF323  46.51 
 
 		 1049 aa  779    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1587  protein of unknown function DUF323  44.69 
 
 		 1064 aa  688    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0068  hypothetical protein  37.69 
 
 		 1200 aa  741    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0457  signal transduction protein  43.98 
 
 		 1049 aa  713    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1299  hypothetical protein  43.81 
 
 		 1492 aa  702    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1893  hypothetical protein  43.83 
 
 		 1581 aa  972    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0460  hypothetical protein  42.18 
 
 		 965 aa  625  1e-177  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0102271  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0364  signal transduction protein  41.08 
 
 		 960 aa  600  1e-170  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2339  protein of unknown function DUF323  51.48 
 
 		 775 aa  320  9e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1598  hypothetical protein  33.94 
 
 		 644 aa  211  5e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2222  serine/threonine protein kinase  25.18 
 
 		 1818 aa  160  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.943108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3090  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.1 
 
 		 908 aa  115  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.624689  normal  0.76371 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4811  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.79 
 
 		 1067 aa  114  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.382069  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1556  hypothetical protein  42.75 
 
 		 263 aa  106  3e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.808052  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5122  signal transduction protein  24.06 
 
 		 953 aa  102  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0904  hypothetical protein  37.87 
 
 		 251 aa  101  7e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000158237 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  23.54 
 
 		 1148 aa  100  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3131  GUN4 domain protein  26.21 
 
 		 818 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4280  hypothetical protein  30.57 
 
 		 412 aa  100  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2114  hypothetical protein  29.27 
 
 		 444 aa  100  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0420844 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2498  signal transduction protein  26.98 
 
 		 1349 aa  98.6  6e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2650  hypothetical protein  26.86 
 
 		 439 aa  99  6e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.112589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2563  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.96 
 
 		 997 aa  98.6  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.238788  normal  0.0710109 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2919  hypothetical protein  31.84 
 
 		 1080 aa  97.4  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3236  hypothetical protein  22.89 
 
 		 957 aa  97.4  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0887  hypothetical protein  36.36 
 
 		 240 aa  96.3  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0897  hypothetical protein  35.39 
 
 		 291 aa  95.9  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000129772  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4476  signal transduction protein  25.35 
 
 		 1237 aa  95.9  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.62278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22460  conserved hypothetical protein TIGR03440  27.21 
 
 		 468 aa  95.5  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.599861 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2496  signal transduction protein  28.45 
 
 		 1339 aa  95.1  7e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3570  signal transduction protein  24.51 
 
 		 783 aa  94.7  9e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2380  protein of unknown function DUF323  32.65 
 
 		 417 aa  94.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2123  protein of unknown function DUF323  27.11 
 
 		 442 aa  94.4  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1500  putative signal transduction protein with Nacht domain  26.58 
 
 		 762 aa  93.6  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1473  putative signal transduction protein with Nacht domain  26.58 
 
 		 762 aa  93.6  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2257  hypothetical protein  28.18 
 
 		 444 aa  92.8  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689177  normal  0.0943468 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2449  putative signal transduction protein with Nacht domain  22.73 
 
 		 888 aa  92.8  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.152058  normal  0.158989 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3050  NTPase (NACHT family)-like protein  25.71 
 
 		 2216 aa  93.2  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.512729 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4512  hypothetical protein  26.87 
 
 		 487 aa  92.8  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.720233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1465  signal transduction protein  24.76 
 
 		 570 aa  92.8  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.137269 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0638  protein of unknown function DUF323  33.7 
 
 		 446 aa  92.4  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.749121 
 
 
-
 
NC_002620  TC0422  hypothetical protein  28.91 
 
 		 614 aa  91.3  1e-16  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.385064  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4092  hypothetical protein  29.37 
 
 		 253 aa  91.3  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.189106  normal  0.479505 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0602  protein of unknown function DUF323  34.43 
 
 		 273 aa  90.9  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0325143  normal  0.360547 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2071  hypothetical protein  31.11 
 
 		 892 aa  90.9  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5141  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  26.19 
 
 		 951 aa  91.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2548  methyltransferase  33.72 
 
 		 766 aa  90.1  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5123  hypothetical protein  29.45 
 
 		 949 aa  89.7  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2751  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  25.85 
 
 		 942 aa  89.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0331  hypothetical protein  27.03 
 
 		 433 aa  89.7  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.188129  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0687  hypothetical protein  24.81 
 
 		 437 aa  89.7  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3225  protein of unknown function DUF323  26.06 
 
 		 377 aa  89.7  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.05466  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7301  hypothetical protein  27.14 
 
 		 506 aa  89.4  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4586  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.98 
 
 		 1086 aa  89.4  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2940  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.25 
 
 		 416 aa  89  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.279621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1392  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.71 
 
 		 1091 aa  89  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1944  protein of unknown function DUF323  26.98 
 
 		 829 aa  88.6  6e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.550405  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3177  protein of unknown function DUF323  31.25 
 
 		 416 aa  88.6  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2006  hypothetical protein  26.64 
 
 		 522 aa  88.2  8e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2228  hypothetical protein  29.44 
 
 		 1196 aa  87.8  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3940  hypothetical protein  35.63 
 
 		 277 aa  87.4  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  27.76 
 
 		 433 aa  87  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3571  signal transduction protein  27.58 
 
 		 2194 aa  87.4  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3181  NTPase (NACHT family)-like protein  26.41 
 
 		 1150 aa  86.7  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00494273  normal  0.197936 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  30.59 
 
 		 517 aa  85.9  0.000000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5124  hypothetical protein  31.63 
 
 		 951 aa  85.9  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  27.92 
 
 		 751 aa  85.5  0.000000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3248  hypothetical protein  33.9 
 
 		 416 aa  85.5  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000238215  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8029  protein of unknown function DUF323  26.96 
 
 		 446 aa  85.1  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.217933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2098  hypothetical protein  33.71 
 
 		 586 aa  84.7  0.000000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.092784 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2077  hypothetical protein  33.68 
 
 		 636 aa  84.7  0.000000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189777  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2632  signal transduction protein  27.7 
 
 		 1742 aa  85.1  0.000000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  28.86 
 
 		 325 aa  84.7  0.000000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4970  hypothetical protein  27.09 
 
 		 436 aa  84.7  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4881  hypothetical protein  27.09 
 
 		 436 aa  84.7  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.546495  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2689  hypothetical protein  34.43 
 
 		 781 aa  84.3  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.36496  decreased coverage  0.00230732 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0670  protein of unknown function DUF323  34.03 
 
 		 654 aa  84.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  27.31 
 
 		 826 aa  84.7  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5249  hypothetical protein  27.09 
 
 		 436 aa  84.7  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  34.72 
 
 		 925 aa  84  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1634  hypothetical protein  32.74 
 
 		 263 aa  83.6  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1081  protein of unknown function DUF323  27.48 
 
 		 447 aa  84  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_94690  predicted protein  31.18 
 
 		 819 aa  83.6  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.154344 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3065  protein of unknown function DUF323  32.04 
 
 		 1104 aa  83.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34453 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0650  signal transduction protein  23.37 
 
 		 801 aa  83.2  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.190918 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3099  protein of unknown function DUF323  26.85 
 
 		 269 aa  83.2  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4985  signal transduction protein  25.81 
 
 		 1345 aa  83.2  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1325  WD40 repeat, subgroup  27.36 
 
 		 1484 aa  83.2  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3346  adenylate/guanylate cyclase  31.55 
 
 		 1392 aa  82.4  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0911306  normal  0.84372 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>