More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2427 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1452  protein of unknown function DUF323  47.76 
 
 		 1053 aa  762    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2344  protein of unknown function DUF323  45.58 
 
 		 1190 aa  739    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1587  protein of unknown function DUF323  57.31 
 
 		 1064 aa  1104    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1047  putative signal transduction protein with Nacht domain  47.01 
 
 		 1183 aa  753    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.598608  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0364  signal transduction protein  45.45 
 
 		 960 aa  649    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0856  hypothetical protein  47.59 
 
 		 923 aa  749    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2427  putative signal transduction protein with Nacht domain  100 
 
 		 1044 aa  2167    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.509479  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2349  protein of unknown function DUF323  63.34 
 
 		 1186 aa  1084    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.719002  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2186  protein of unknown function DUF323  44.48 
 
 		 1007 aa  762    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000553602  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0735  protein of unknown function DUF323  46.9 
 
 		 1201 aa  733    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1553  putative signal transduction protein with Nacht domain  44.34 
 
 		 1023 aa  778    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0972336  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2192  protein of unknown function DUF323  50.4 
 
 		 1049 aa  783    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1562  putative signal transduction protein with Nacht domain  46.5 
 
 		 1044 aa  739    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1565  putative signal transduction protein with Nacht domain  49.59 
 
 		 1041 aa  780    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0457  signal transduction protein  44.79 
 
 		 1049 aa  758    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0460  hypothetical protein  51.02 
 
 		 965 aa  813    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0102271  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1299  hypothetical protein  44.66 
 
 		 1492 aa  781    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1893  hypothetical protein  48.83 
 
 		 1581 aa  718    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0068  hypothetical protein  37.51 
 
 		 1200 aa  502  1e-140  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2339  protein of unknown function DUF323  51.01 
 
 		 775 aa  281  3e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1598  hypothetical protein  31.38 
 
 		 644 aa  213  2e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1556  hypothetical protein  64.75 
 
 		 263 aa  178  6e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.808052  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3090  putative signal transduction protein with Nacht domain  27.68 
 
 		 908 aa  127  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.624689  normal  0.76371 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2222  serine/threonine protein kinase  26.55 
 
 		 1818 aa  126  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.943108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  26.55 
 
 		 1148 aa  124  7e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4811  putative signal transduction protein with Nacht domain  26.71 
 
 		 1067 aa  124  9e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.382069  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2449  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.73 
 
 		 888 aa  123  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.152058  normal  0.158989 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5123  hypothetical protein  23.57 
 
 		 949 aa  119  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2498  signal transduction protein  26.05 
 
 		 1349 aa  112  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3050  NTPase (NACHT family)-like protein  24.38 
 
 		 2216 aa  109  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.512729 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3181  NTPase (NACHT family)-like protein  24.24 
 
 		 1150 aa  108  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00494273  normal  0.197936 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4476  signal transduction protein  24.51 
 
 		 1237 aa  106  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.62278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4985  signal transduction protein  25.81 
 
 		 1345 aa  105  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3032  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.67 
 
 		 1004 aa  105  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00461923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5141  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  25.3 
 
 		 951 aa  105  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3088  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.45 
 
 		 798 aa  103  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1473  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.55 
 
 		 762 aa  103  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2496  signal transduction protein  26.12 
 
 		 1339 aa  103  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2563  putative signal transduction protein with Nacht domain  27.88 
 
 		 997 aa  103  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.238788  normal  0.0710109 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1500  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.55 
 
 		 762 aa  103  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3570  signal transduction protein  25.11 
 
 		 783 aa  102  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2632  signal transduction protein  25.89 
 
 		 1742 aa  102  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1392  putative signal transduction protein with Nacht domain  27 
 
 		 1091 aa  101  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2751  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  24.26 
 
 		 942 aa  101  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3131  GUN4 domain protein  25.9 
 
 		 818 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1916  signal transduction protein  24.16 
 
 		 766 aa  100  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.394463 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4765  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  21.91 
 
 		 887 aa  99.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3571  signal transduction protein  26 
 
 		 2194 aa  99.8  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1602  signal transduction protein  24.74 
 
 		 1002 aa  97.4  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5325  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  25.13 
 
 		 805 aa  97.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5124  hypothetical protein  22.02 
 
 		 951 aa  96.3  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5122  signal transduction protein  23.01 
 
 		 953 aa  93.6  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4586  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.32 
 
 		 1086 aa  91.7  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1048  signal transduction protein  25.26 
 
 		 1216 aa  91.7  8e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.958943  normal  0.02885 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2919  hypothetical protein  30.48 
 
 		 1080 aa  87.8  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4437  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  24.54 
 
 		 725 aa  86.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1642  putative signal transduction protein with Nacht domain  26.18 
 
 		 911 aa  85.9  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.409211 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0904  hypothetical protein  37.28 
 
 		 251 aa  85.9  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000158237 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1465  signal transduction protein  23.85 
 
 		 570 aa  85.5  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.137269 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3236  hypothetical protein  21.19 
 
 		 957 aa  83.2  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0650  signal transduction protein  25.76 
 
 		 801 aa  82.4  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.190918 
 
 
-
 
NC_002620  TC0422  hypothetical protein  36.09 
 
 		 614 aa  82.4  0.00000000000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.385064  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2296  NACHT family-like NTPase  22.14 
 
 		 1267 aa  82  0.00000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2940  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.57 
 
 		 416 aa  81.6  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.279621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2548  methyltransferase  24.76 
 
 		 766 aa  81.6  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3177  protein of unknown function DUF323  32.57 
 
 		 416 aa  81.6  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1634  hypothetical protein  30.84 
 
 		 263 aa  79.7  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4092  hypothetical protein  30.5 
 
 		 253 aa  80.1  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.189106  normal  0.479505 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2380  protein of unknown function DUF323  33.71 
 
 		 417 aa  80.1  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0897  hypothetical protein  33.15 
 
 		 291 aa  79  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000129772  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  32.76 
 
 		 751 aa  77.8  0.0000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0125  hypothetical protein  32.79 
 
 		 781 aa  76.6  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.871876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4346  hypothetical protein  40.17 
 
 		 291 aa  77  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  33.33 
 
 		 925 aa  77  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3244  signal transduction protein  23.69 
 
 		 799 aa  76.3  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0094323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2228  hypothetical protein  39.69 
 
 		 1196 aa  76.3  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4578  hypothetical protein  28.64 
 
 		 852 aa  75.9  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.54262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3128  protein of unknown function DUF323  31.14 
 
 		 348 aa  75.9  0.000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2507  protein of unknown function DUF323  27.05 
 
 		 538 aa  75.5  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2650  hypothetical protein  30.52 
 
 		 439 aa  75.5  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.112589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4639  hypothetical protein  31.51 
 
 		 295 aa  75.5  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0221265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3855  hypothetical protein  31.14 
 
 		 348 aa  75.1  0.000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3214  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.41 
 
 		 649 aa  74.7  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.614434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6095  protein of unknown function DUF323  31.49 
 
 		 319 aa  74.7  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2718  hypothetical protein  36.52 
 
 		 292 aa  73.6  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2114  hypothetical protein  39.42 
 
 		 444 aa  73.2  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0420844 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8029  protein of unknown function DUF323  29.07 
 
 		 446 aa  73.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.217933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0717  serine/threonine protein kinase  32.61 
 
 		 861 aa  73.2  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000196708  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3102  protein of unknown function DUF323  34.74 
 
 		 740 aa  72.8  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0052  protein of unknown function DUF323  29.26 
 
 		 303 aa  72.8  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4459  hypothetical protein  31.38 
 
 		 390 aa  72.8  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0669008 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7301  hypothetical protein  29.83 
 
 		 506 aa  72.4  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1731  hypothetical protein  31.94 
 
 		 877 aa  72.8  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2071  hypothetical protein  36.59 
 
 		 892 aa  72.4  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0602  protein of unknown function DUF323  35.54 
 
 		 273 aa  72.8  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0325143  normal  0.360547 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2257  hypothetical protein  40.38 
 
 		 444 aa  72  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689177  normal  0.0943468 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2390  protein of unknown function DUF323  33.33 
 
 		 293 aa  72  0.00000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264886  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3346  adenylate/guanylate cyclase  29.19 
 
 		 1392 aa  72.4  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0911306  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4280  hypothetical protein  24.72 
 
 		 412 aa  72  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3065  protein of unknown function DUF323  31.22 
 
 		 1104 aa  70.5  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34453 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>