98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4811 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4811  putative signal transduction protein with Nacht domain  100 
 
 		 1067 aa  2167    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.382069  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3090  putative signal transduction protein with Nacht domain  40.63 
 
 		 908 aa  404  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.624689  normal  0.76371 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2563  putative signal transduction protein with Nacht domain  29.92 
 
 		 997 aa  281  3e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.238788  normal  0.0710109 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3131  GUN4 domain protein  28.57 
 
 		 818 aa  197  9e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1642  putative signal transduction protein with Nacht domain  30.33 
 
 		 911 aa  196  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.409211 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4765  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  26.55 
 
 		 887 aa  185  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2449  putative signal transduction protein with Nacht domain  27.57 
 
 		 888 aa  176  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.152058  normal  0.158989 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4437  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  28.54 
 
 		 725 aa  154  7e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5325  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  29.73 
 
 		 805 aa  145  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1500  putative signal transduction protein with Nacht domain  26.97 
 
 		 762 aa  139  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1473  putative signal transduction protein with Nacht domain  26.97 
 
 		 762 aa  139  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0067  signal transduction protein  26.98 
 
 		 773 aa  136  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.571466  normal  0.0199052 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1562  putative signal transduction protein with Nacht domain  26.61 
 
 		 1044 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  27.11 
 
 		 1148 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0457  signal transduction protein  28.45 
 
 		 1049 aa  130  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1565  putative signal transduction protein with Nacht domain  27.47 
 
 		 1041 aa  127  1e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2427  putative signal transduction protein with Nacht domain  26.71 
 
 		 1044 aa  124  9e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.509479  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0856  hypothetical protein  26.39 
 
 		 923 aa  124  9.999999999999999e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2349  protein of unknown function DUF323  28.11 
 
 		 1186 aa  121  9e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.719002  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3088  putative signal transduction protein with Nacht domain  27.84 
 
 		 798 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1392  putative signal transduction protein with Nacht domain  28.7 
 
 		 1091 aa  119  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3032  putative signal transduction protein with Nacht domain  28.24 
 
 		 1004 aa  119  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00461923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1587  protein of unknown function DUF323  26.49 
 
 		 1064 aa  117  7.999999999999999e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1553  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.8 
 
 		 1023 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0972336  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3181  NTPase (NACHT family)-like protein  28.83 
 
 		 1150 aa  114  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00494273  normal  0.197936 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0735  protein of unknown function DUF323  25.79 
 
 		 1201 aa  114  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1047  putative signal transduction protein with Nacht domain  27.32 
 
 		 1183 aa  114  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.598608  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2192  protein of unknown function DUF323  25.05 
 
 		 1049 aa  113  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1916  signal transduction protein  26.37 
 
 		 766 aa  112  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.394463 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4586  putative signal transduction protein with Nacht domain  27.77 
 
 		 1086 aa  112  5e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1452  protein of unknown function DUF323  26.98 
 
 		 1053 aa  112  5e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0364  signal transduction protein  27.46 
 
 		 960 aa  111  7.000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1893  hypothetical protein  28.21 
 
 		 1581 aa  110  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3244  signal transduction protein  27.49 
 
 		 799 aa  109  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0094323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3214  putative signal transduction protein with Nacht domain  27.22 
 
 		 649 aa  110  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.614434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1299  hypothetical protein  24.81 
 
 		 1492 aa  109  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2186  protein of unknown function DUF323  25.13 
 
 		 1007 aa  103  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000553602  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2529  putative signal transduction protein with Nacht domain  27.63 
 
 		 1174 aa  103  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.250967  normal  0.208659 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0460  hypothetical protein  25.88 
 
 		 965 aa  102  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0102271  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3570  signal transduction protein  25.56 
 
 		 783 aa  102  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7397  NTPase (NACHT family)-like protein  29.46 
 
 		 1106 aa  102  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1465  signal transduction protein  28.72 
 
 		 570 aa  100  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.137269 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2344  protein of unknown function DUF323  23.14 
 
 		 1190 aa  97.8  8e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0068  hypothetical protein  24.55 
 
 		 1200 aa  97.8  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1602  signal transduction protein  27.46 
 
 		 1002 aa  96.7  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4476  signal transduction protein  25.7 
 
 		 1237 aa  96.7  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.62278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0650  signal transduction protein  23.18 
 
 		 801 aa  95.5  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.190918 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5141  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  27.06 
 
 		 951 aa  95.1  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2498  signal transduction protein  25.5 
 
 		 1349 aa  92  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1048  signal transduction protein  26.61 
 
 		 1216 aa  91.3  9e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.958943  normal  0.02885 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1598  hypothetical protein  25.08 
 
 		 644 aa  90.9  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2751  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  24.8 
 
 		 942 aa  89.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2496  signal transduction protein  26.29 
 
 		 1339 aa  89.4  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2632  signal transduction protein  24.38 
 
 		 1742 aa  89.4  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3571  signal transduction protein  25.63 
 
 		 2194 aa  88.2  8e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3050  NTPase (NACHT family)-like protein  25.25 
 
 		 2216 aa  85.9  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.512729 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4985  signal transduction protein  25 
 
 		 1345 aa  84.3  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2919  hypothetical protein  25.71 
 
 		 1080 aa  82.8  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  23.87 
 
 		 1094 aa  82.4  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2296  NACHT family-like NTPase  25.33 
 
 		 1267 aa  80.5  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3298  NACHT family-like NTPase  24.49 
 
 		 625 aa  80.5  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2222  serine/threonine protein kinase  25.25 
 
 		 1818 aa  78.6  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.943108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0676  signal transduction protein  24.57 
 
 		 1073 aa  78.2  0.0000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.224513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5122  signal transduction protein  26.49 
 
 		 953 aa  72  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5750  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.51 
 
 		 1330 aa  72  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5241  putative signal transduction protein with Nacht domain  26.18 
 
 		 914 aa  71.6  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.668655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1763  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  26.13 
 
 		 1475 aa  70.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.923912 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2638  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  24.05 
 
 		 852 aa  70.1  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.637289 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3798  NACHT family-like NTPase  19.07 
 
 		 584 aa  68.9  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5123  hypothetical protein  25.99 
 
 		 949 aa  68.2  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5124  hypothetical protein  24.21 
 
 		 951 aa  66.2  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  23.01 
 
 		 1443 aa  66.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.69 
 
 		 1438 aa  66.2  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5163  signal transduction protein  24.64 
 
 		 969 aa  65.5  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0049  HEAT repeat-containing PBS lyase  21.23 
 
 		 944 aa  64.7  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229879  normal  0.368167 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.06 
 
 		 1557 aa  63.9  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  24.52 
 
 		 1807 aa  63.2  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1185  hypothetical protein  20.1 
 
 		 647 aa  62.8  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.132787  decreased coverage  0.00946214 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6430  pentapeptide repeat protein  23.24 
 
 		 998 aa  62  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3286  NACHT family-like NTPase  23.66 
 
 		 1335 aa  61.6  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.149878 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2386  signal transduction protein  23.92 
 
 		 595 aa  57.4  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.76685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  25 
 
 		 1901 aa  56.2  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0622  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  24.79 
 
 		 872 aa  55.5  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3236  hypothetical protein  22.64 
 
 		 957 aa  55.1  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  21.87 
 
 		 1868 aa  54.7  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1133  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  23.88 
 
 		 951 aa  53.5  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1483  putative signal transduction protein with Nacht domain  29.55 
 
 		 636 aa  53.9  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3126  NTPase (NACHT family)-like protein  21.91 
 
 		 1282 aa  53.5  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.791023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0430  NACHT family-like NTPase  21.89 
 
 		 573 aa  52.4  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00169219  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1605  hypothetical protein  21.29 
 
 		 1065 aa  52  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0129457  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0799  putative signal transduction protein with Nacht domain  22.77 
 
 		 549 aa  51.2  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.15 
 
 		 2240 aa  49.7  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  22.59 
 
 		 1831 aa  48.1  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  20.06 
 
 		 1474 aa  47.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3348  NACHT family-like NTPase  22.71 
 
 		 260 aa  47  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.670607  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0552  signal transduction protein  20.89 
 
 		 1004 aa  46.6  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  24 
 
 		 1766 aa  45.4  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3605  NTPase (NACHT family)-like protein  25.66 
 
 		 1225 aa  45.4  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.442586 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>