58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5241 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5241  putative signal transduction protein with Nacht domain  100 
 
 
914 aa  1806    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.668655  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5750  putative signal transduction protein with Nacht domain  40.13 
 
 
1330 aa  542  9.999999999999999e-153  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  23.8 
 
 
1148 aa  89.4  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0067  signal transduction protein  24.06 
 
 
773 aa  85.1  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.571466  normal  0.0199052 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1500  putative signal transduction protein with Nacht domain  26.19 
 
 
762 aa  82.4  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1473  putative signal transduction protein with Nacht domain  26.19 
 
 
762 aa  82.4  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3088  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.06 
 
 
798 aa  81.3  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3244  signal transduction protein  24 
 
 
799 aa  80.5  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0094323  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3032  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.3 
 
 
1004 aa  80.5  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00461923  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4586  putative signal transduction protein with Nacht domain  28.4 
 
 
1086 aa  79.7  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3181  NTPase (NACHT family)-like protein  28.57 
 
 
1150 aa  78.6  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00494273  normal  0.197936 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0457  signal transduction protein  26.03 
 
 
1049 aa  78.2  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5141  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  27.12 
 
 
951 aa  77.4  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224088  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4811  putative signal transduction protein with Nacht domain  26.18 
 
 
1067 aa  75.9  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.382069  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3090  putative signal transduction protein with Nacht domain  30.13 
 
 
908 aa  73.9  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.624689  normal  0.76371 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  23.14 
 
 
1094 aa  73.6  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3570  signal transduction protein  22.04 
 
 
783 aa  73.6  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4985  signal transduction protein  24.5 
 
 
1345 aa  71.6  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266997  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1048  signal transduction protein  28.78 
 
 
1216 aa  71.6  0.00000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.958943  normal  0.02885 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2751  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  25.3 
 
 
942 aa  71.2  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1392  putative signal transduction protein with Nacht domain  26.6 
 
 
1091 aa  71.6  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2449  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.52 
 
 
888 aa  70.5  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.152058  normal  0.158989 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1916  signal transduction protein  24.13 
 
 
766 aa  69.7  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.394463 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2344  protein of unknown function DUF323  25.3 
 
 
1190 aa  67.8  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0650  signal transduction protein  22.03 
 
 
801 aa  67.4  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.190918 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3050  NTPase (NACHT family)-like protein  24.68 
 
 
2216 aa  66.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.512729 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2919  hypothetical protein  27.39 
 
 
1080 aa  64.7  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2563  putative signal transduction protein with Nacht domain  27.29 
 
 
997 aa  64.7  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.238788  normal  0.0710109 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5325  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  23.49 
 
 
805 aa  63.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5123  hypothetical protein  27.99 
 
 
949 aa  62.8  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1047  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.08 
 
 
1183 aa  60.1  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.598608  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7397  NTPase (NACHT family)-like protein  25.62 
 
 
1106 aa  60.1  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1893  hypothetical protein  26.52 
 
 
1581 aa  60.1  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1602  signal transduction protein  27.04 
 
 
1002 aa  58.9  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1452  protein of unknown function DUF323  23.66 
 
 
1053 aa  58.5  0.0000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2349  protein of unknown function DUF323  23.89 
 
 
1186 aa  58.9  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.719002  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4476  signal transduction protein  23.82 
 
 
1237 aa  58.5  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.62278  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2498  signal transduction protein  22.47 
 
 
1349 aa  58.2  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5122  signal transduction protein  27.64 
 
 
953 aa  57.8  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0856  hypothetical protein  25 
 
 
923 aa  57  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2296  NACHT family-like NTPase  22.41 
 
 
1267 aa  56.2  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3571  signal transduction protein  23.74 
 
 
2194 aa  55.8  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2496  signal transduction protein  22.73 
 
 
1339 aa  54.3  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4437  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  21.75 
 
 
725 aa  53.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0460  hypothetical protein  24.6 
 
 
965 aa  52.8  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0102271  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2632  signal transduction protein  22.31 
 
 
1742 aa  53.1  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2427  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.83 
 
 
1044 aa  51.2  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.509479  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3286  NACHT family-like NTPase  24.68 
 
 
1335 aa  51.2  0.00008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.149878 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3298  NACHT family-like NTPase  19.15 
 
 
625 aa  51.2  0.00009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1587  protein of unknown function DUF323  24.79 
 
 
1064 aa  50.8  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5163  signal transduction protein  23.58 
 
 
969 aa  50.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2192  protein of unknown function DUF323  23.46 
 
 
1049 aa  48.9  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1565  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.11 
 
 
1041 aa  48.9  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1185  hypothetical protein  23.49 
 
 
647 aa  48.5  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.132787  decreased coverage  0.00946214 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3126  NTPase (NACHT family)-like protein  24.91 
 
 
1282 aa  48.1  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.791023  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0622  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  23.43 
 
 
872 aa  45.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3798  NACHT family-like NTPase  25.12 
 
 
584 aa  44.7  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0676  signal transduction protein  20.48 
 
 
1073 aa  44.7  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.224513  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>