52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0676 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0676  signal transduction protein  100 
 
 		 1073 aa  2198    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.224513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  22.02 
 
 		 1148 aa  77.8  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4437  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  21.32 
 
 		 725 aa  77.4  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3088  putative signal transduction protein with Nacht domain  22.1 
 
 		 798 aa  76.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4811  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.57 
 
 		 1067 aa  77.4  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.382069  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1473  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.05 
 
 		 762 aa  76.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1500  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.05 
 
 		 762 aa  76.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3032  putative signal transduction protein with Nacht domain  22.32 
 
 		 1004 aa  75.5  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00461923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3090  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.63 
 
 		 908 aa  74.7  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.624689  normal  0.76371 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1916  signal transduction protein  21.99 
 
 		 766 aa  74.3  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.394463 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3050  NTPase (NACHT family)-like protein  22.27 
 
 		 2216 aa  72.8  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.512729 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0067  signal transduction protein  21.79 
 
 		 773 aa  72.4  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.571466  normal  0.0199052 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5141  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  22.35 
 
 		 951 aa  70.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2751  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  21.86 
 
 		 942 aa  68.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5325  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  20 
 
 		 805 aa  67  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1465  signal transduction protein  22.52 
 
 		 570 aa  66.2  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.137269 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1452  protein of unknown function DUF323  23.98 
 
 		 1053 aa  65.5  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1048  signal transduction protein  23.04 
 
 		 1216 aa  63.9  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.958943  normal  0.02885 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5124  hypothetical protein  22.14 
 
 		 951 aa  63.5  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5122  signal transduction protein  24.07 
 
 		 953 aa  62  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0457  signal transduction protein  22.27 
 
 		 1049 aa  61.6  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0650  signal transduction protein  20.72 
 
 		 801 aa  61.2  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.190918 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3214  putative signal transduction protein with Nacht domain  21.56 
 
 		 649 aa  61.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.614434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4586  putative signal transduction protein with Nacht domain  21.56 
 
 		 1086 aa  61.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2296  NACHT family-like NTPase  20.68 
 
 		 1267 aa  60.8  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3570  signal transduction protein  21.69 
 
 		 783 aa  61.2  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2498  signal transduction protein  21.62 
 
 		 1349 aa  59.7  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1047  putative signal transduction protein with Nacht domain  21.9 
 
 		 1183 aa  58.5  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.598608  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2449  putative signal transduction protein with Nacht domain  20.67 
 
 		 888 aa  58.2  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.152058  normal  0.158989 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4985  signal transduction protein  21.58 
 
 		 1345 aa  58.2  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4476  signal transduction protein  21.47 
 
 		 1237 aa  57.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.62278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5123  hypothetical protein  24.02 
 
 		 949 aa  57  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2632  signal transduction protein  20.99 
 
 		 1742 aa  56.2  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2344  protein of unknown function DUF323  24.72 
 
 		 1190 aa  55.1  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3571  signal transduction protein  20.58 
 
 		 2194 aa  55.1  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5163  signal transduction protein  24.35 
 
 		 969 aa  54.3  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3181  NTPase (NACHT family)-like protein  21.49 
 
 		 1150 aa  54.3  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00494273  normal  0.197936 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0856  hypothetical protein  21.47 
 
 		 923 aa  54.3  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5750  putative signal transduction protein with Nacht domain  21.94 
 
 		 1330 aa  53.9  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2529  putative signal transduction protein with Nacht domain  22.93 
 
 		 1174 aa  52  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.250967  normal  0.208659 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2496  signal transduction protein  21.62 
 
 		 1339 aa  49.3  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1562  putative signal transduction protein with Nacht domain  19.49 
 
 		 1044 aa  48.9  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1893  hypothetical protein  21.6 
 
 		 1581 aa  48.9  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.75 
 
 		 1438 aa  48.9  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7397  NTPase (NACHT family)-like protein  22.85 
 
 		 1106 aa  48.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1565  putative signal transduction protein with Nacht domain  21.96 
 
 		 1041 aa  46.6  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0735  protein of unknown function DUF323  21.95 
 
 		 1201 aa  46.6  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2919  hypothetical protein  20.37 
 
 		 1080 aa  46.6  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2563  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.92 
 
 		 997 aa  46.6  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.238788  normal  0.0710109 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1602  signal transduction protein  24.71 
 
 		 1002 aa  45.8  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2427  putative signal transduction protein with Nacht domain  22.36 
 
 		 1044 aa  45.4  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.509479  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1553  putative signal transduction protein with Nacht domain  20.65 
 
 		 1023 aa  45.4  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0972336  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>