45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3298 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_3298  NACHT family-like NTPase  100 
 
 
625 aa  1277    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3798  NACHT family-like NTPase  26.88 
 
 
584 aa  154  5e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0430  NACHT family-like NTPase  27.11 
 
 
573 aa  152  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00169219  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1185  hypothetical protein  24.82 
 
 
647 aa  108  4e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.132787  decreased coverage  0.00946214 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2386  signal transduction protein  28.42 
 
 
595 aa  101  5e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.76685  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0411  hypothetical protein  25.32 
 
 
637 aa  95.9  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0440311  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1465  signal transduction protein  25 
 
 
570 aa  80.9  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.137269 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4811  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.49 
 
 
1067 aa  80.5  0.00000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.382069  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2529  putative signal transduction protein with Nacht domain  22.63 
 
 
1174 aa  75.1  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.250967  normal  0.208659 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3286  NACHT family-like NTPase  22.33 
 
 
1335 aa  73.9  0.000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.149878 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3090  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.63 
 
 
908 aa  73.2  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.624689  normal  0.76371 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  23.04 
 
 
1148 aa  69.3  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5325  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  23.95 
 
 
805 aa  68.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4586  putative signal transduction protein with Nacht domain  22.63 
 
 
1086 aa  68.2  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4476  signal transduction protein  26.48 
 
 
1237 aa  67.8  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.62278  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4765  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  21.67 
 
 
887 aa  67.4  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4437  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  22.52 
 
 
725 aa  66.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5141  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  26.65 
 
 
951 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224088  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1500  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.4 
 
 
762 aa  64.3  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1473  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.4 
 
 
762 aa  64.3  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0457  signal transduction protein  22.83 
 
 
1049 aa  63.5  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1605  hypothetical protein  25.14 
 
 
1065 aa  63.5  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0129457  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4985  signal transduction protein  23.87 
 
 
1345 aa  61.2  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266997  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3570  signal transduction protein  25.44 
 
 
783 aa  59.3  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2449  putative signal transduction protein with Nacht domain  21.9 
 
 
888 aa  55.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.152058  normal  0.158989 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3181  NTPase (NACHT family)-like protein  21.79 
 
 
1150 aa  51.6  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00494273  normal  0.197936 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5241  putative signal transduction protein with Nacht domain  19.15 
 
 
914 aa  50.8  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.668655  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2296  NACHT family-like NTPase  25.95 
 
 
1267 aa  51.2  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  26.89 
 
 
1831 aa  51.2  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3131  GUN4 domain protein  19.79 
 
 
818 aa  50.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5122  signal transduction protein  20.61 
 
 
953 aa  50.4  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1916  signal transduction protein  23.89 
 
 
766 aa  49.3  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.394463 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5124  hypothetical protein  23.43 
 
 
951 aa  47.8  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1562  putative signal transduction protein with Nacht domain  22.3 
 
 
1044 aa  47.4  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0735  protein of unknown function DUF323  20.38 
 
 
1201 aa  47.4  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3050  NTPase (NACHT family)-like protein  24.15 
 
 
2216 aa  47.4  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.512729 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5123  hypothetical protein  19.47 
 
 
949 aa  47.4  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1452  protein of unknown function DUF323  19.05 
 
 
1053 aa  47.4  0.0009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1133  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  24.55 
 
 
951 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  24.55 
 
 
1094 aa  47  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0622  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  21.04 
 
 
872 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1893  hypothetical protein  21.46 
 
 
1581 aa  45.8  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3214  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.4 
 
 
649 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.614434  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1587  protein of unknown function DUF323  22.47 
 
 
1064 aa  45.1  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5163  signal transduction protein  20.14 
 
 
969 aa  43.9  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>