40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0411 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0411  hypothetical protein  100 
 
 		 637 aa  1292    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0440311  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1185  hypothetical protein  34.19 
 
 		 647 aa  231  2e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.132787  decreased coverage  0.00946214 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3298  NACHT family-like NTPase  26.1 
 
 		 625 aa  98.6  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5325  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  24.62 
 
 		 805 aa  73.9  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4437  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  23.31 
 
 		 725 aa  73.9  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4586  putative signal transduction protein with Nacht domain  22.44 
 
 		 1086 aa  70.1  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3798  NACHT family-like NTPase  26.4 
 
 		 584 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0430  NACHT family-like NTPase  24.44 
 
 		 573 aa  68.2  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00169219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1500  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.17 
 
 		 762 aa  65.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1473  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.17 
 
 		 762 aa  65.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1392  putative signal transduction protein with Nacht domain  21.83 
 
 		 1091 aa  62.8  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2386  signal transduction protein  24.49 
 
 		 595 aa  58.2  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.76685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3181  NTPase (NACHT family)-like protein  23.25 
 
 		 1150 aa  56.2  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00494273  normal  0.197936 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4985  signal transduction protein  23.02 
 
 		 1345 aa  55.8  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3090  putative signal transduction protein with Nacht domain  20.58 
 
 		 908 aa  54.7  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.624689  normal  0.76371 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1452  protein of unknown function DUF323  23.2 
 
 		 1053 aa  54.7  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2529  putative signal transduction protein with Nacht domain  22.27 
 
 		 1174 aa  54.3  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.250967  normal  0.208659 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2498  signal transduction protein  23.26 
 
 		 1349 aa  53.9  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1482  NTPase (NACHT family)-like protein  21.99 
 
 		 1051 aa  53.9  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2496  signal transduction protein  23.24 
 
 		 1339 aa  52.8  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3214  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.31 
 
 		 649 aa  50.4  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.614434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0049  HEAT repeat-containing PBS lyase  22.54 
 
 		 944 aa  50.4  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229879  normal  0.368167 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1916  signal transduction protein  22.09 
 
 		 766 aa  50.1  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.394463 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2919  hypothetical protein  22.01 
 
 		 1080 aa  49.7  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7397  NTPase (NACHT family)-like protein  20.91 
 
 		 1106 aa  49.3  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5750  putative signal transduction protein with Nacht domain  21.34 
 
 		 1330 aa  49.3  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2449  putative signal transduction protein with Nacht domain  21.75 
 
 		 888 aa  47.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.152058  normal  0.158989 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4476  signal transduction protein  21.61 
 
 		 1237 aa  47.4  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.62278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5141  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  23.33 
 
 		 951 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3570  signal transduction protein  25.37 
 
 		 783 aa  47.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4765  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  21.58 
 
 		 887 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3032  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.53 
 
 		 1004 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00461923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0067  signal transduction protein  21.81 
 
 		 773 aa  45.8  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.571466  normal  0.0199052 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2427  putative signal transduction protein with Nacht domain  20.92 
 
 		 1044 aa  46.2  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.509479  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3571  signal transduction protein  22.26 
 
 		 2194 aa  46.6  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2751  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  24.17 
 
 		 942 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  27.71 
 
 		 1094 aa  45.1  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1299  hypothetical protein  20.28 
 
 		 1492 aa  45.1  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3088  putative signal transduction protein with Nacht domain  22.92 
 
 		 798 aa  45.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  24.37 
 
 		 1148 aa  44.7  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139224 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>