60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_3798 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_3798  NACHT family-like NTPase  100 
 
 
584 aa  1174    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0430  NACHT family-like NTPase  47.24 
 
 
573 aa  388  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00169219  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2386  signal transduction protein  30.56 
 
 
595 aa  186  1.0000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.76685  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3298  NACHT family-like NTPase  26.88 
 
 
625 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1185  hypothetical protein  28.18 
 
 
647 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.132787  decreased coverage  0.00946214 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4811  putative signal transduction protein with Nacht domain  20.16 
 
 
1067 aa  87.4  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.382069  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4437  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  26.69 
 
 
725 aa  86.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1916  signal transduction protein  23.88 
 
 
766 aa  83.6  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.394463 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0411  hypothetical protein  25.78 
 
 
637 aa  82.4  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0440311  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3286  NACHT family-like NTPase  22.95 
 
 
1335 aa  79  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.149878 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5325  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  23.62 
 
 
805 aa  78.2  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3090  putative signal transduction protein with Nacht domain  21.41 
 
 
908 aa  76.3  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.624689  normal  0.76371 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3214  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.63 
 
 
649 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.614434  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4765  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  22.05 
 
 
887 aa  72  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1473  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.31 
 
 
762 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1500  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.31 
 
 
762 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0067  signal transduction protein  23.3 
 
 
773 aa  69.3  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.571466  normal  0.0199052 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3131  GUN4 domain protein  21.59 
 
 
818 aa  66.6  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3181  NTPase (NACHT family)-like protein  22.5 
 
 
1150 aa  66.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00494273  normal  0.197936 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2449  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.42 
 
 
888 aa  64.7  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.152058  normal  0.158989 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2563  putative signal transduction protein with Nacht domain  22.76 
 
 
997 aa  64.3  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.238788  normal  0.0710109 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1465  signal transduction protein  23.74 
 
 
570 aa  63.9  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.137269 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3244  signal transduction protein  20.65 
 
 
799 aa  62  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0094323  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4586  putative signal transduction protein with Nacht domain  19.77 
 
 
1086 aa  61.6  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7397  NTPase (NACHT family)-like protein  19.11 
 
 
1106 aa  58.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4476  signal transduction protein  24.63 
 
 
1237 aa  57.8  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.62278  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0650  signal transduction protein  21.99 
 
 
801 aa  57.4  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.190918 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1048  signal transduction protein  21.88 
 
 
1216 aa  57.4  0.0000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.958943  normal  0.02885 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3050  NTPase (NACHT family)-like protein  25.1 
 
 
2216 aa  57  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.512729 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3348  NACHT family-like NTPase  29.02 
 
 
260 aa  57  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.670607  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1133  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  23.63 
 
 
951 aa  57  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2751  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  24.46 
 
 
942 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2498  signal transduction protein  25.21 
 
 
1349 aa  55.1  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5141  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  25 
 
 
951 aa  54.7  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224088  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  23.91 
 
 
1094 aa  53.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4985  signal transduction protein  26.81 
 
 
1345 aa  52.8  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266997  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3032  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.95 
 
 
1004 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00461923  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3088  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.85 
 
 
798 aa  52  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2496  signal transduction protein  25.64 
 
 
1339 aa  52.4  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5241  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.32 
 
 
914 aa  52  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.668655  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0622  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  25.11 
 
 
872 aa  51.2  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1605  hypothetical protein  22.75 
 
 
1065 aa  50.8  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0129457  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0457  signal transduction protein  21.76 
 
 
1049 aa  50.8  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5750  putative signal transduction protein with Nacht domain  19.22 
 
 
1330 aa  49.7  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5122  signal transduction protein  19.68 
 
 
953 aa  49.7  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5123  hypothetical protein  18.62 
 
 
949 aa  47.8  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  31.76 
 
 
1766 aa  47.4  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3570  signal transduction protein  26.79 
 
 
783 aa  47.4  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5163  signal transduction protein  20.59 
 
 
969 aa  47.4  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0460  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.27 
 
 
1729 aa  47  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.832377  normal  0.0598199 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0552  signal transduction protein  21.37 
 
 
1004 aa  45.8  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1904  hypothetical protein  25.63 
 
 
772 aa  45.1  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.51395  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  31.87 
 
 
1831 aa  45.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  23.53 
 
 
1148 aa  45.4  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0626  hypothetical protein  24.77 
 
 
896 aa  45.4  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5609  transcriptional regulator  23.01 
 
 
948 aa  45.1  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160081  normal  0.519557 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7016  transcriptional regulator  28.36 
 
 
973 aa  44.3  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252317  normal  0.0265916 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5826  transcriptional regulator  26.14 
 
 
948 aa  44.3  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3126  NTPase (NACHT family)-like protein  21.09 
 
 
1282 aa  43.9  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.791023  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3571  signal transduction protein  22.61 
 
 
2194 aa  43.5  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>