51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3286 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3286  NACHT family-like NTPase  100 
 
 		 1335 aa  2583    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.149878 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  20.97 
 
 		 1148 aa  86.7  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3298  NACHT family-like NTPase  22.33 
 
 		 625 aa  73.6  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2296  NACHT family-like NTPase  26.53 
 
 		 1267 aa  70.5  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2751  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  20 
 
 		 942 aa  67.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4985  signal transduction protein  21.67 
 
 		 1345 aa  67.4  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2498  signal transduction protein  21.89 
 
 		 1349 aa  65.9  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1465  signal transduction protein  24.64 
 
 		 570 aa  65.9  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.137269 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3181  NTPase (NACHT family)-like protein  25.42 
 
 		 1150 aa  65.9  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00494273  normal  0.197936 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0067  signal transduction protein  21.17 
 
 		 773 aa  65.1  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.571466  normal  0.0199052 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4437  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  21.71 
 
 		 725 aa  64.3  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5325  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  24.27 
 
 		 805 aa  63.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3090  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.02 
 
 		 908 aa  63.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.624689  normal  0.76371 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0457  signal transduction protein  25 
 
 		 1049 aa  63.2  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4811  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.66 
 
 		 1067 aa  62.8  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.382069  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3244  signal transduction protein  21.86 
 
 		 799 aa  62.4  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0094323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2563  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.43 
 
 		 997 aa  62  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.238788  normal  0.0710109 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4476  signal transduction protein  22.76 
 
 		 1237 aa  61.6  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.62278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3571  signal transduction protein  20.9 
 
 		 2194 aa  60.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2496  signal transduction protein  20.9 
 
 		 1339 aa  60.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1587  protein of unknown function DUF323  24.58 
 
 		 1064 aa  60.5  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0049  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.49 
 
 		 944 aa  59.3  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229879  normal  0.368167 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0430  NACHT family-like NTPase  26.23 
 
 		 573 aa  59.3  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00169219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1047  putative signal transduction protein with Nacht domain  28.22 
 
 		 1183 aa  58.9  0.0000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.598608  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1602  signal transduction protein  26.15 
 
 		 1002 aa  58.2  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3050  NTPase (NACHT family)-like protein  23.65 
 
 		 2216 aa  58.2  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.512729 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3214  putative signal transduction protein with Nacht domain  21.91 
 
 		 649 aa  57.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.614434  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0012  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35 
 
 		 851 aa  57  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.037328  normal  0.0184635 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5141  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  22.19 
 
 		 951 aa  57.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2632  signal transduction protein  20.5 
 
 		 1742 aa  57.4  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3798  NACHT family-like NTPase  22.95 
 
 		 584 aa  57.4  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0735  protein of unknown function DUF323  22.65 
 
 		 1201 aa  56.2  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5750  putative signal transduction protein with Nacht domain  29.88 
 
 		 1330 aa  55.5  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3348  NACHT family-like NTPase  21.83 
 
 		 260 aa  55.1  0.000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.670607  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1893  hypothetical protein  28.05 
 
 		 1581 aa  54.7  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2386  signal transduction protein  26.7 
 
 		 595 aa  55.1  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.76685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3131  GUN4 domain protein  21.55 
 
 		 818 aa  54.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1642  putative signal transduction protein with Nacht domain  29.03 
 
 		 911 aa  53.5  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.409211 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2344  protein of unknown function DUF323  21.38 
 
 		 1190 aa  52.8  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1565  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.94 
 
 		 1041 aa  51.6  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2638  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  23.94 
 
 		 852 aa  49.7  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.637289 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1452  protein of unknown function DUF323  21.8 
 
 		 1053 aa  49.7  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0856  hypothetical protein  23.02 
 
 		 923 aa  49.3  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2427  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.06 
 
 		 1044 aa  48.5  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.509479  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2192  protein of unknown function DUF323  24.76 
 
 		 1049 aa  48.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1553  putative signal transduction protein with Nacht domain  21.71 
 
 		 1023 aa  47.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0972336  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2529  putative signal transduction protein with Nacht domain  25 
 
 		 1174 aa  46.6  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.250967  normal  0.208659 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2349  protein of unknown function DUF323  25.24 
 
 		 1186 aa  47  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.719002  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5241  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.16 
 
 		 914 aa  46.2  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.668655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2186  protein of unknown function DUF323  24.77 
 
 		 1007 aa  45.8  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000553602  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1562  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.1 
 
 		 1044 aa  45.1  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>