91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7397 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7397  NTPase (NACHT family)-like protein  100 
 
 
1106 aa  2168    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1392  putative signal transduction protein with Nacht domain  38.83 
 
 
1091 aa  653    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4586  putative signal transduction protein with Nacht domain  50.09 
 
 
1086 aa  900    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4811  putative signal transduction protein with Nacht domain  28.64 
 
 
1067 aa  122  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.382069  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1473  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.67 
 
 
762 aa  115  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1500  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.67 
 
 
762 aa  115  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5141  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  27.33 
 
 
951 aa  110  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224088  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2563  putative signal transduction protein with Nacht domain  29.68 
 
 
997 aa  107  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.238788  normal  0.0710109 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3050  NTPase (NACHT family)-like protein  27.68 
 
 
2216 aa  103  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.512729 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3244  signal transduction protein  25 
 
 
799 aa  103  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0094323  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3090  putative signal transduction protein with Nacht domain  26.83 
 
 
908 aa  102  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.624689  normal  0.76371 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5325  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  23.56 
 
 
805 aa  102  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2751  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  24.83 
 
 
942 aa  100  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4476  signal transduction protein  23.78 
 
 
1237 aa  99.4  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.62278  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  22.81 
 
 
1148 aa  99  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0457  signal transduction protein  26.46 
 
 
1049 aa  98.2  7e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0067  signal transduction protein  23.99 
 
 
773 aa  98.2  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.571466  normal  0.0199052 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3032  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.22 
 
 
1004 aa  97.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00461923  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4437  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  23.03 
 
 
725 aa  96.3  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3088  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.99 
 
 
798 aa  94.7  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3181  NTPase (NACHT family)-like protein  29.16 
 
 
1150 aa  92.8  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00494273  normal  0.197936 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1452  protein of unknown function DUF323  25.14 
 
 
1053 aa  92.4  4e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2192  protein of unknown function DUF323  26.08 
 
 
1049 aa  92  5e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0856  hypothetical protein  25.37 
 
 
923 aa  90.9  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1553  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.49 
 
 
1023 aa  90.1  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0972336  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2427  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.28 
 
 
1044 aa  89.7  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.509479  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2349  protein of unknown function DUF323  25.89 
 
 
1186 aa  89.4  4e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.719002  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3214  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.4 
 
 
649 aa  88.2  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.614434  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1893  hypothetical protein  24.6 
 
 
1581 aa  86.7  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4985  signal transduction protein  22.97 
 
 
1345 aa  85.9  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266997  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0650  signal transduction protein  21.33 
 
 
801 aa  85.5  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.190918 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1916  signal transduction protein  24.2 
 
 
766 aa  85.1  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.394463 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2449  putative signal transduction protein with Nacht domain  21.55 
 
 
888 aa  84.7  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.152058  normal  0.158989 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1565  putative signal transduction protein with Nacht domain  26.34 
 
 
1041 aa  84.3  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1587  protein of unknown function DUF323  24.42 
 
 
1064 aa  84  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3570  signal transduction protein  21.27 
 
 
783 aa  83.6  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5750  putative signal transduction protein with Nacht domain  26.91 
 
 
1330 aa  80.9  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4765  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  22.54 
 
 
887 aa  80.9  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0735  protein of unknown function DUF323  22.9 
 
 
1201 aa  81.3  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2498  signal transduction protein  22.68 
 
 
1349 aa  80.1  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2496  signal transduction protein  22.51 
 
 
1339 aa  80.1  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3571  signal transduction protein  23.6 
 
 
2194 aa  79.3  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1465  signal transduction protein  25.07 
 
 
570 aa  77.4  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.137269 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0364  signal transduction protein  23.12 
 
 
960 aa  77  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2344  protein of unknown function DUF323  23.82 
 
 
1190 aa  75.9  0.000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3131  GUN4 domain protein  21.37 
 
 
818 aa  74.3  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1047  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.41 
 
 
1183 aa  73.9  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.598608  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5124  hypothetical protein  26 
 
 
951 aa  72.8  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2632  signal transduction protein  22.41 
 
 
1742 aa  73.2  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3126  NTPase (NACHT family)-like protein  26.23 
 
 
1282 aa  72.4  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.791023  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1299  hypothetical protein  24.04 
 
 
1492 aa  70.1  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2222  serine/threonine protein kinase  27.62 
 
 
1818 aa  69.7  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.943108  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1602  signal transduction protein  29.17 
 
 
1002 aa  69.7  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1185  hypothetical protein  23.59 
 
 
647 aa  68.2  0.0000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.132787  decreased coverage  0.00946214 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1642  putative signal transduction protein with Nacht domain  26.42 
 
 
911 aa  67.8  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.409211 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5241  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.75 
 
 
914 aa  67  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.668655  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2919  hypothetical protein  25.9 
 
 
1080 aa  67.4  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2186  protein of unknown function DUF323  22.61 
 
 
1007 aa  67  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000553602  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1133  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  25.14 
 
 
951 aa  65.1  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1048  signal transduction protein  25.26 
 
 
1216 aa  63.9  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.958943  normal  0.02885 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2529  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.72 
 
 
1174 aa  63.2  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.250967  normal  0.208659 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5163  signal transduction protein  22.65 
 
 
969 aa  63.2  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1562  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.19 
 
 
1044 aa  62.8  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0460  hypothetical protein  23.67 
 
 
965 aa  62.4  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0102271  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2386  signal transduction protein  27.43 
 
 
595 aa  62  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.76685  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0068  hypothetical protein  22.86 
 
 
1200 aa  61.6  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  20.47 
 
 
1094 aa  61.6  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0837  leucine-rich repeat-containing protein  31.19 
 
 
1085 aa  58.9  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.27 
 
 
1343 aa  58.2  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3798  NACHT family-like NTPase  18.88 
 
 
584 aa  57  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3286  NACHT family-like NTPase  25.67 
 
 
1335 aa  57.4  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.149878 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1598  hypothetical protein  25.27 
 
 
644 aa  55.5  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1022  hypothetical protein  26.39 
 
 
327 aa  55.5  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.255794  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5123  hypothetical protein  24.12 
 
 
949 aa  53.5  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.37 
 
 
1438 aa  53.1  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2296  NACHT family-like NTPase  28.3 
 
 
1267 aa  52.4  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1904  hypothetical protein  18.31 
 
 
772 aa  52  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.51395  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0676  signal transduction protein  20.87 
 
 
1073 aa  52  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.224513  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1245  NEAr transporter  28 
 
 
766 aa  51.6  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1473  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  30.19 
 
 
341 aa  50.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0301891 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3962  putative internalin  27.47 
 
 
760 aa  49.3  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.769038  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5122  signal transduction protein  22.44 
 
 
953 aa  47.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0430  NACHT family-like NTPase  22.98 
 
 
573 aa  48.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00169219  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0907  protein of unknown function/lipoprotein, putative  27.21 
 
 
877 aa  46.2  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1382  putative internalin  26 
 
 
760 aa  45.8  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0411  hypothetical protein  19.95 
 
 
637 aa  46.2  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0440311  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4578  hypothetical protein  27.69 
 
 
852 aa  45.8  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.54262  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1485  putative internalin  25.33 
 
 
766 aa  45.4  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1419  putative internalin  26 
 
 
779 aa  45.1  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.131072 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1605  hypothetical protein  24.17 
 
 
1065 aa  45.1  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0129457  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1220  internalin  26 
 
 
765 aa  45.1  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.359434  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>