71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0622 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0622  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  100 
 
 
872 aa  1793    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0049  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.59 
 
 
944 aa  461  9.999999999999999e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229879  normal  0.368167 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1763  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  33.83 
 
 
1475 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.923912 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2638  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  36.76 
 
 
852 aa  322  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.637289 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0570  putative signal transduction protein with Nacht domain  30.26 
 
 
1235 aa  318  4e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.466575 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0553  putative signal transduction protein with Nacht domain  30.26 
 
 
1235 aa  317  5e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4212  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  28.86 
 
 
1234 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5325  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  26.75 
 
 
805 aa  97.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  25 
 
 
1148 aa  78.6  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4437  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  25.25 
 
 
725 aa  77  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2192  protein of unknown function DUF323  23.35 
 
 
1049 aa  73.2  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2751  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  25.7 
 
 
942 aa  72.8  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2349  protein of unknown function DUF323  23.7 
 
 
1186 aa  72  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.719002  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0067  signal transduction protein  25.25 
 
 
773 aa  72.4  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.571466  normal  0.0199052 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2498  signal transduction protein  25.67 
 
 
1349 aa  71.6  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1452  protein of unknown function DUF323  23.55 
 
 
1053 aa  71.6  0.00000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1465  signal transduction protein  25.8 
 
 
570 aa  70.1  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.137269 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0856  hypothetical protein  23.8 
 
 
923 aa  68.2  0.0000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1500  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.49 
 
 
762 aa  67.8  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1473  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.49 
 
 
762 aa  67.8  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3570  signal transduction protein  26.22 
 
 
783 aa  67.8  0.0000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3088  putative signal transduction protein with Nacht domain  22.16 
 
 
798 aa  67  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1642  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.84 
 
 
911 aa  67.4  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.409211 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0735  protein of unknown function DUF323  24.79 
 
 
1201 aa  67.4  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2529  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.62 
 
 
1174 aa  66.6  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.250967  normal  0.208659 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4476  signal transduction protein  24.57 
 
 
1237 aa  66.2  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.62278  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3032  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.83 
 
 
1004 aa  65.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00461923  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3090  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.52 
 
 
908 aa  64.3  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.624689  normal  0.76371 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5163  signal transduction protein  21.67 
 
 
969 aa  63.2  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2449  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.46 
 
 
888 aa  63.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.152058  normal  0.158989 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  22.81 
 
 
1094 aa  62.8  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2427  putative signal transduction protein with Nacht domain  21.08 
 
 
1044 aa  61.2  0.00000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.509479  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0457  signal transduction protein  23.11 
 
 
1049 aa  61.2  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1565  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.46 
 
 
1041 aa  61.2  0.00000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4985  signal transduction protein  24.94 
 
 
1345 aa  60.1  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266997  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2496  signal transduction protein  25.85 
 
 
1339 aa  60.1  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2919  hypothetical protein  24.34 
 
 
1080 aa  60.1  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1133  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  23.58 
 
 
951 aa  58.5  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3214  putative signal transduction protein with Nacht domain  28.49 
 
 
649 aa  57.8  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.614434  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1587  protein of unknown function DUF323  22.14 
 
 
1064 aa  57.4  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5124  hypothetical protein  24.44 
 
 
951 aa  57.4  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1553  putative signal transduction protein with Nacht domain  22.84 
 
 
1023 aa  57.4  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0972336  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5122  signal transduction protein  21.63 
 
 
953 aa  57.4  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3571  signal transduction protein  25.38 
 
 
2194 aa  57  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2186  protein of unknown function DUF323  23.06 
 
 
1007 aa  56.6  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000553602  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1185  hypothetical protein  23.3 
 
 
647 aa  57  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.132787  decreased coverage  0.00946214 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1048  signal transduction protein  23.67 
 
 
1216 aa  57  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.958943  normal  0.02885 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2563  putative signal transduction protein with Nacht domain  22.39 
 
 
997 aa  56.2  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.238788  normal  0.0710109 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1916  signal transduction protein  26.27 
 
 
766 aa  55.8  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.394463 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3126  NTPase (NACHT family)-like protein  25 
 
 
1282 aa  55.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.791023  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4586  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.61 
 
 
1086 aa  55.1  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4811  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.45 
 
 
1067 aa  55.5  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.382069  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5123  hypothetical protein  21.4 
 
 
949 aa  55.1  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3050  NTPase (NACHT family)-like protein  24.23 
 
 
2216 aa  54.7  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.512729 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1562  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.94 
 
 
1044 aa  54.7  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1602  signal transduction protein  24.71 
 
 
1002 aa  54.7  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.45 
 
 
1343 aa  54.7  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3181  NTPase (NACHT family)-like protein  23.16 
 
 
1150 aa  53.5  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00494273  normal  0.197936 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0068  hypothetical protein  23.06 
 
 
1200 aa  53.5  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1299  hypothetical protein  24.94 
 
 
1492 aa  52.4  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1893  hypothetical protein  22.08 
 
 
1581 aa  52.4  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5141  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  27.55 
 
 
951 aa  52  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224088  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3244  signal transduction protein  27.91 
 
 
799 aa  50.4  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0094323  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0650  signal transduction protein  22.95 
 
 
801 aa  50.4  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.190918 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2632  signal transduction protein  25.18 
 
 
1742 aa  49.7  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1807  hypothetical protein  25.77 
 
 
1579 aa  49.3  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1950  putative signal transduction protein with Nacht domain  28.36 
 
 
778 aa  48.9  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0899222  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1047  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.86 
 
 
1183 aa  46.6  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.598608  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1482  NTPase (NACHT family)-like protein  22.55 
 
 
1051 aa  46.2  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3298  NACHT family-like NTPase  21.04 
 
 
625 aa  45.8  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0430  NACHT family-like NTPase  28.67 
 
 
573 aa  45.1  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00169219  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>