75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2386 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2386  signal transduction protein  100 
 
 		 595 aa  1206    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.76685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3798  NACHT family-like NTPase  32.68 
 
 		 584 aa  183  6e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0430  NACHT family-like NTPase  31.84 
 
 		 573 aa  159  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00169219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3298  NACHT family-like NTPase  28.65 
 
 		 625 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1185  hypothetical protein  26.79 
 
 		 647 aa  100  5e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.132787  decreased coverage  0.00946214 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2751  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  26.06 
 
 		 942 aa  84.3  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5325  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  24.15 
 
 		 805 aa  80.9  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4437  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  24.48 
 
 		 725 aa  80.1  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1133  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  26.7 
 
 		 951 aa  79  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4586  putative signal transduction protein with Nacht domain  22.71 
 
 		 1086 aa  78.2  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3181  NTPase (NACHT family)-like protein  25.73 
 
 		 1150 aa  77.4  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00494273  normal  0.197936 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1500  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.95 
 
 		 762 aa  75.1  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1473  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.95 
 
 		 762 aa  75.1  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1916  signal transduction protein  23.57 
 
 		 766 aa  74.3  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.394463 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3244  signal transduction protein  21.81 
 
 		 799 aa  73.9  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0094323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2427  putative signal transduction protein with Nacht domain  21.73 
 
 		 1044 aa  73.9  0.000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.509479  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1465  signal transduction protein  23.26 
 
 		 570 aa  73.6  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.137269 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4811  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.64 
 
 		 1067 aa  72.4  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.382069  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0067  signal transduction protein  26.86 
 
 		 773 aa  72  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.571466  normal  0.0199052 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0411  hypothetical protein  24.92 
 
 		 637 aa  71.6  0.00000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0440311  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1392  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.39 
 
 		 1091 aa  70.9  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3090  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.19 
 
 		 908 aa  70.9  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.624689  normal  0.76371 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0735  protein of unknown function DUF323  22.95 
 
 		 1201 aa  69.7  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4476  signal transduction protein  24.34 
 
 		 1237 aa  69.7  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.62278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1452  protein of unknown function DUF323  22.91 
 
 		 1053 aa  68.9  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3088  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.21 
 
 		 798 aa  67.4  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3032  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.63 
 
 		 1004 aa  66.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00461923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3214  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.99 
 
 		 649 aa  65.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.614434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4765  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  19.62 
 
 		 887 aa  65.1  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0457  signal transduction protein  23.47 
 
 		 1049 aa  65.1  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0856  hypothetical protein  23.34 
 
 		 923 aa  64.3  0.000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7397  NTPase (NACHT family)-like protein  24.88 
 
 		 1106 aa  63.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3050  NTPase (NACHT family)-like protein  23.47 
 
 		 2216 aa  62.4  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.512729 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3286  NACHT family-like NTPase  22.52 
 
 		 1335 aa  61.6  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.149878 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5141  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  25.27 
 
 		 951 aa  59.3  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2449  putative signal transduction protein with Nacht domain  21.86 
 
 		 888 aa  57  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.152058  normal  0.158989 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2349  protein of unknown function DUF323  20.61 
 
 		 1186 aa  56.6  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.719002  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0068  hypothetical protein  23.34 
 
 		 1200 aa  56.6  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3570  signal transduction protein  23.99 
 
 		 783 aa  56.2  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1553  putative signal transduction protein with Nacht domain  22.73 
 
 		 1023 aa  55.5  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0972336  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1587  protein of unknown function DUF323  21.22 
 
 		 1064 aa  55.8  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1893  hypothetical protein  21.57 
 
 		 1581 aa  55.5  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1482  NTPase (NACHT family)-like protein  21.61 
 
 		 1051 aa  54.7  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1562  putative signal transduction protein with Nacht domain  20.89 
 
 		 1044 aa  54.7  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.5 
 
 		 1343 aa  54.3  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4985  signal transduction protein  22.45 
 
 		 1345 aa  53.9  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2498  signal transduction protein  20.63 
 
 		 1349 aa  53.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  23.46 
 
 		 1148 aa  53.5  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2192  protein of unknown function DUF323  21.48 
 
 		 1049 aa  52  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1047  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.26 
 
 		 1183 aa  52  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.598608  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0460  hypothetical protein  20.51 
 
 		 965 aa  52  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0102271  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2296  NACHT family-like NTPase  23.3 
 
 		 1267 aa  51.6  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3131  GUN4 domain protein  20.42 
 
 		 818 aa  50.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5750  putative signal transduction protein with Nacht domain  21.93 
 
 		 1330 aa  50.8  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2632  signal transduction protein  22.2 
 
 		 1742 aa  50.8  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5241  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.27 
 
 		 914 aa  50.8  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.668655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  25.69 
 
 		 1033 aa  50.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2529  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.37 
 
 		 1174 aa  50.1  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.250967  normal  0.208659 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  29.31 
 
 		 1807 aa  49.3  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3571  signal transduction protein  23.56 
 
 		 2194 aa  49.7  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  28 
 
 		 1831 aa  48.9  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1299  hypothetical protein  18.91 
 
 		 1492 aa  48.9  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2919  hypothetical protein  22.94 
 
 		 1080 aa  48.1  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2186  protein of unknown function DUF323  21.52 
 
 		 1007 aa  47.8  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000553602  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  24.16 
 
 		 1094 aa  47.4  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1605  hypothetical protein  24.15 
 
 		 1065 aa  46.6  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0129457  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.5 
 
 		 1438 aa  46.6  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1048  signal transduction protein  23.46 
 
 		 1216 aa  46.6  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.958943  normal  0.02885 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0650  signal transduction protein  21.47 
 
 		 801 aa  47  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.190918 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  26.9 
 
 		 1901 aa  45.4  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2430  putative signal transduction protein with Nacht domain  20.16 
 
 		 911 aa  44.7  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2496  signal transduction protein  21.28 
 
 		 1339 aa  44.3  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1483  putative signal transduction protein with Nacht domain  26.34 
 
 		 636 aa  44.3  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  34.88 
 
 		 1766 aa  43.5  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1565  putative signal transduction protein with Nacht domain  22.09 
 
 		 1041 aa  43.5  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>