42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1483 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1483  putative signal transduction protein with Nacht domain  100 
 
 		 636 aa  1228    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3605  NTPase (NACHT family)-like protein  29.97 
 
 		 1225 aa  86.7  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.442586 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1047  putative signal transduction protein with Nacht domain  29.5 
 
 		 1183 aa  73.9  0.000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.598608  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0457  signal transduction protein  29.74 
 
 		 1049 aa  69.3  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3050  NTPase (NACHT family)-like protein  31.75 
 
 		 2216 aa  65.1  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.512729 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2349  protein of unknown function DUF323  28.84 
 
 		 1186 aa  63.2  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.719002  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4476  signal transduction protein  26.58 
 
 		 1237 aa  61.6  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.62278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3181  NTPase (NACHT family)-like protein  28.26 
 
 		 1150 aa  61.2  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00494273  normal  0.197936 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3570  signal transduction protein  28.31 
 
 		 783 aa  61.2  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2498  signal transduction protein  27.78 
 
 		 1349 aa  59.3  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0856  hypothetical protein  27.9 
 
 		 923 aa  59.3  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1893  hypothetical protein  25.57 
 
 		 1581 aa  58.2  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3090  putative signal transduction protein with Nacht domain  36.49 
 
 		 908 aa  58.2  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.624689  normal  0.76371 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3126  NTPase (NACHT family)-like protein  25.8 
 
 		 1282 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.791023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2427  putative signal transduction protein with Nacht domain  26.32 
 
 		 1044 aa  56.2  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.509479  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5141  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  30.09 
 
 		 951 aa  54.7  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0067  signal transduction protein  27.6 
 
 		 773 aa  54.3  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.571466  normal  0.0199052 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4811  putative signal transduction protein with Nacht domain  29.55 
 
 		 1067 aa  53.9  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.382069  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2496  signal transduction protein  27.38 
 
 		 1339 aa  53.9  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1452  protein of unknown function DUF323  28.01 
 
 		 1053 aa  52.8  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  26.2 
 
 		 1148 aa  52  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2344  protein of unknown function DUF323  24.65 
 
 		 1190 aa  51.2  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3214  putative signal transduction protein with Nacht domain  26.34 
 
 		 649 aa  50.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.614434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1587  protein of unknown function DUF323  25.78 
 
 		 1064 aa  50.4  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5325  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  22.82 
 
 		 805 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2751  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  24.3 
 
 		 942 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2296  NACHT family-like NTPase  29.41 
 
 		 1267 aa  50.4  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4985  signal transduction protein  25.79 
 
 		 1345 aa  50.4  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2632  signal transduction protein  25.1 
 
 		 1742 aa  50.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2186  protein of unknown function DUF323  26.25 
 
 		 1007 aa  49.3  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000553602  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2563  putative signal transduction protein with Nacht domain  29.2 
 
 		 997 aa  48.1  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.238788  normal  0.0710109 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2192  protein of unknown function DUF323  25.8 
 
 		 1049 aa  48.1  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3032  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.2 
 
 		 1004 aa  48.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00461923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0650  signal transduction protein  24.38 
 
 		 801 aa  47.8  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.190918 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3088  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.4 
 
 		 798 aa  47.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0735  protein of unknown function DUF323  25.96 
 
 		 1201 aa  47.4  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3244  signal transduction protein  27.31 
 
 		 799 aa  47.4  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0094323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3571  signal transduction protein  25.1 
 
 		 2194 aa  46.6  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1562  putative signal transduction protein with Nacht domain  27.94 
 
 		 1044 aa  45.8  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0460  hypothetical protein  25.89 
 
 		 965 aa  45.8  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0102271  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.82 
 
 		 1557 aa  45.8  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  26.72 
 
 		 903 aa  44.3  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0671183 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>