More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2919 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2919  hypothetical protein  100 
 
 		 1080 aa  2159    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1565  putative signal transduction protein with Nacht domain  26.97 
 
 		 1041 aa  191  9e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2192  protein of unknown function DUF323  27.47 
 
 		 1049 aa  185  4.0000000000000006e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0460  hypothetical protein  26.43 
 
 		 965 aa  183  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0102271  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1452  protein of unknown function DUF323  25.99 
 
 		 1053 aa  177  8e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1553  putative signal transduction protein with Nacht domain  27.07 
 
 		 1023 aa  177  9.999999999999999e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0972336  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1893  hypothetical protein  27.97 
 
 		 1581 aa  167  8e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2186  protein of unknown function DUF323  26.2 
 
 		 1007 aa  159  3e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000553602  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0856  hypothetical protein  25.06 
 
 		 923 aa  157  1e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1587  protein of unknown function DUF323  25.96 
 
 		 1064 aa  151  7e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1562  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.54 
 
 		 1044 aa  143  9.999999999999999e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1299  hypothetical protein  24.23 
 
 		 1492 aa  138  5e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5124  hypothetical protein  26.51 
 
 		 951 aa  135  5e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5123  hypothetical protein  27.98 
 
 		 949 aa  134  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3236  hypothetical protein  26.52 
 
 		 957 aa  132  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1602  signal transduction protein  30.06 
 
 		 1002 aa  130  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0068  hypothetical protein  25.35 
 
 		 1200 aa  129  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5122  signal transduction protein  28.04 
 
 		 953 aa  127  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  27.7 
 
 		 1148 aa  123  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4578  hypothetical protein  30.51 
 
 		 852 aa  115  6e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.54262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0125  hypothetical protein  26.06 
 
 		 781 aa  113  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.871876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5163  signal transduction protein  24.61 
 
 		 969 aa  111  7.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5325  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  24.37 
 
 		 805 aa  111  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4092  hypothetical protein  33.09 
 
 		 253 aa  109  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.189106  normal  0.479505 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0457  signal transduction protein  28.29 
 
 		 1049 aa  107  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4437  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  25 
 
 		 725 aa  104  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3570  signal transduction protein  25.95 
 
 		 783 aa  104  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0687  hypothetical protein  32.07 
 
 		 437 aa  103  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2349  protein of unknown function DUF323  25.1 
 
 		 1186 aa  103  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.719002  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0364  signal transduction protein  26.14 
 
 		 960 aa  102  4e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1634  hypothetical protein  31.27 
 
 		 263 aa  101  7e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3068  serine/threonine protein kinase  31.58 
 
 		 621 aa  101  9e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000268642  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4512  hypothetical protein  33.33 
 
 		 487 aa  100  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.720233  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0422  hypothetical protein  32.28 
 
 		 614 aa  99.8  2e-19  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.385064  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3088  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.97 
 
 		 798 aa  100  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1500  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.42 
 
 		 762 aa  100  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1473  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.42 
 
 		 762 aa  100  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3131  GUN4 domain protein  26.36 
 
 		 818 aa  99  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4280  hypothetical protein  30.69 
 
 		 412 aa  99  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0735  protein of unknown function DUF323  28.21 
 
 		 1201 aa  97.4  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2563  putative signal transduction protein with Nacht domain  28.3 
 
 		 997 aa  96.7  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.238788  normal  0.0710109 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3640  protein of unknown function DUF323  31.33 
 
 		 442 aa  96.3  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.530686  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0657  hypothetical protein  28.42 
 
 		 436 aa  95.9  4e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.568956 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2114  hypothetical protein  31.53 
 
 		 444 aa  95.9  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0420844 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1048  signal transduction protein  26.62 
 
 		 1216 aa  95.5  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.958943  normal  0.02885 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2650  hypothetical protein  32.14 
 
 		 439 aa  95.1  6e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.112589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2257  hypothetical protein  33.45 
 
 		 444 aa  94.7  8e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689177  normal  0.0943468 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7301  hypothetical protein  32.99 
 
 		 506 aa  94.7  9e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3090  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.71 
 
 		 908 aa  94  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.624689  normal  0.76371 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22460  conserved hypothetical protein TIGR03440  32.32 
 
 		 468 aa  94.4  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.599861 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2498  signal transduction protein  23.95 
 
 		 1349 aa  93.6  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0904  hypothetical protein  32.25 
 
 		 251 aa  92.8  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000158237 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2632  signal transduction protein  23.65 
 
 		 1742 aa  92.8  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3032  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.66 
 
 		 1004 aa  92  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00461923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4811  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.77 
 
 		 1067 aa  90.9  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.382069  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0331  hypothetical protein  31.05 
 
 		 433 aa  90.9  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.188129  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2296  NACHT family-like NTPase  23.41 
 
 		 1267 aa  90.1  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2496  signal transduction protein  23.85 
 
 		 1339 aa  90.5  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2380  protein of unknown function DUF323  28.52 
 
 		 417 aa  90.1  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2427  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.1 
 
 		 1044 aa  89.4  4e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.509479  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3181  NTPase (NACHT family)-like protein  27.07 
 
 		 1150 aa  88.6  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00494273  normal  0.197936 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2751  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  25.2 
 
 		 942 aa  88.6  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1047  putative signal transduction protein with Nacht domain  28.28 
 
 		 1183 aa  88.6  6e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.598608  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4765  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  23.45 
 
 		 887 aa  88.2  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0638  protein of unknown function DUF323  30.98 
 
 		 446 aa  88.2  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.749121 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1081  protein of unknown function DUF323  35.64 
 
 		 447 aa  87.8  9e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1316  hypothetical protein  32.53 
 
 		 429 aa  87.8  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.722294 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2344  protein of unknown function DUF323  29.39 
 
 		 1190 aa  87.4  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0602  protein of unknown function DUF323  30.99 
 
 		 273 aa  87.8  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0325143  normal  0.360547 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3177  protein of unknown function DUF323  28.52 
 
 		 416 aa  87.8  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2339  protein of unknown function DUF323  32.21 
 
 		 775 aa  87.8  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1490  hypothetical protein  28.38 
 
 		 742 aa  87.4  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00271295  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5249  hypothetical protein  31.7 
 
 		 436 aa  87  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4693  protein of unknown function DUF323  31.83 
 
 		 446 aa  86.7  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.522761 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4881  hypothetical protein  31.7 
 
 		 436 aa  87  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.546495  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4970  hypothetical protein  31.7 
 
 		 436 aa  87  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0650  signal transduction protein  24.76 
 
 		 801 aa  86.3  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.190918 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5169  hypothetical protein  30.3 
 
 		 437 aa  86.3  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  29.79 
 
 		 826 aa  86.7  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0067  signal transduction protein  24.23 
 
 		 773 aa  85.9  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.571466  normal  0.0199052 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2940  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.18 
 
 		 416 aa  85.9  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.279621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2123  protein of unknown function DUF323  30.23 
 
 		 442 aa  85.9  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13734  hypothetical protein  41.83 
 
 		 425 aa  85.9  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.72863 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4985  signal transduction protein  23.75 
 
 		 1345 aa  85.9  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1282  serine/threonine kinase  34.39 
 
 		 327 aa  85.5  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0376412  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1392  putative signal transduction protein with Nacht domain  27.8 
 
 		 1091 aa  85.5  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8029  protein of unknown function DUF323  32.99 
 
 		 446 aa  84  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.217933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2548  methyltransferase  27.97 
 
 		 766 aa  84  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5141  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  25.53 
 
 		 951 aa  84  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3244  signal transduction protein  24.09 
 
 		 799 aa  82.8  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0094323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1465  signal transduction protein  30 
 
 		 570 aa  83.2  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.137269 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3214  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.6 
 
 		 649 aa  82.4  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.614434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1916  signal transduction protein  23.71 
 
 		 766 aa  82.4  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.394463 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3050  NTPase (NACHT family)-like protein  27.8 
 
 		 2216 aa  81.3  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.512729 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3571  signal transduction protein  24.82 
 
 		 2194 aa  81.3  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2222  serine/threonine protein kinase  26.27 
 
 		 1818 aa  81.3  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.943108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_94690  predicted protein  28.05 
 
 		 819 aa  80.1  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.154344 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4476  signal transduction protein  25.05 
 
 		 1237 aa  80.5  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.62278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  28.08 
 
 		 751 aa  79.7  0.0000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1626  hypothetical protein  32.14 
 
 		 329 aa  79  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>