More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1047 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1047  putative signal transduction protein with Nacht domain  100 
 
 		 1183 aa  2444    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.598608  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0735  protein of unknown function DUF323  43.31 
 
 		 1201 aa  972    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1452  protein of unknown function DUF323  44.31 
 
 		 1053 aa  693    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2192  protein of unknown function DUF323  53.7 
 
 		 1049 aa  871    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1562  putative signal transduction protein with Nacht domain  54.27 
 
 		 1044 aa  872    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0364  signal transduction protein  47.38 
 
 		 960 aa  734    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0856  hypothetical protein  52.09 
 
 		 923 aa  836    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2349  protein of unknown function DUF323  49.55 
 
 		 1186 aa  1103    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.719002  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1587  protein of unknown function DUF323  44.34 
 
 		 1064 aa  689    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2427  putative signal transduction protein with Nacht domain  47.01 
 
 		 1044 aa  753    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.509479  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1553  putative signal transduction protein with Nacht domain  55.84 
 
 		 1023 aa  910    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0972336  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2344  protein of unknown function DUF323  40.15 
 
 		 1190 aa  805    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0068  hypothetical protein  39.69 
 
 		 1200 aa  800    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0457  signal transduction protein  49.55 
 
 		 1049 aa  762    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1299  hypothetical protein  55.98 
 
 		 1492 aa  905    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1565  putative signal transduction protein with Nacht domain  56.63 
 
 		 1041 aa  915    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2186  protein of unknown function DUF323  54.39 
 
 		 1007 aa  841    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000553602  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1893  hypothetical protein  67.03 
 
 		 1581 aa  1607    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0460  hypothetical protein  43.34 
 
 		 965 aa  622  1e-176  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0102271  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2339  protein of unknown function DUF323  61.13 
 
 		 775 aa  404  1e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1598  hypothetical protein  33.54 
 
 		 644 aa  208  4e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2222  serine/threonine protein kinase  25.71 
 
 		 1818 aa  181  5.999999999999999e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.943108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3090  putative signal transduction protein with Nacht domain  29.06 
 
 		 908 aa  118  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.624689  normal  0.76371 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5123  hypothetical protein  24.88 
 
 		 949 aa  117  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4811  putative signal transduction protein with Nacht domain  27.32 
 
 		 1067 aa  114  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.382069  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5124  hypothetical protein  23.94 
 
 		 951 aa  112  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  25.44 
 
 		 1148 aa  110  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4765  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  24.9 
 
 		 887 aa  110  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2449  putative signal transduction protein with Nacht domain  27.54 
 
 		 888 aa  107  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.152058  normal  0.158989 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3050  NTPase (NACHT family)-like protein  27.4 
 
 		 2216 aa  101  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.512729 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1500  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.7 
 
 		 762 aa  100  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2563  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.7 
 
 		 997 aa  100  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.238788  normal  0.0710109 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1473  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.7 
 
 		 762 aa  100  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3570  signal transduction protein  25.57 
 
 		 783 aa  100  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3236  hypothetical protein  23.19 
 
 		 957 aa  99.8  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2498  signal transduction protein  25.51 
 
 		 1349 aa  97.8  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_64  calcineurin-like phosphoesterase  28.52 
 
 		 437 aa  97.4  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0515875  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4437  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  24.04 
 
 		 725 aa  97.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2496  signal transduction protein  25.29 
 
 		 1339 aa  96.7  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0422  hypothetical protein  32.5 
 
 		 614 aa  96.7  3e-18  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.385064  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5122  signal transduction protein  23.15 
 
 		 953 aa  96.7  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3131  GUN4 domain protein  27.16 
 
 		 818 aa  95.9  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4985  signal transduction protein  25.22 
 
 		 1345 aa  95.5  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0703  phosphohydrolase protein  25.26 
 
 		 1071 aa  95.5  6e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.159768  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1392  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.12 
 
 		 1091 aa  95.1  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2751  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  26.67 
 
 		 942 aa  94.7  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0602  protein of unknown function DUF323  38.36 
 
 		 273 aa  92.4  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0325143  normal  0.360547 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5141  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  25.31 
 
 		 951 aa  92.4  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0904  hypothetical protein  42.07 
 
 		 251 aa  91.7  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000158237 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0687  hypothetical protein  28.89 
 
 		 437 aa  91.7  8e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4476  signal transduction protein  24.63 
 
 		 1237 aa  91.3  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.62278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4586  putative signal transduction protein with Nacht domain  26.81 
 
 		 1086 aa  90.1  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1325  WD40 repeat, subgroup  30.31 
 
 		 1484 aa  88.2  9e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4092  hypothetical protein  38.93 
 
 		 253 aa  87.8  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.189106  normal  0.479505 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0067  signal transduction protein  23.77 
 
 		 773 aa  86.3  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.571466  normal  0.0199052 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0294  hypothetical protein  28.91 
 
 		 1020 aa  85.5  0.000000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000662732  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4577  Ser/Thr protein phosphatase family protein  25 
 
 		 469 aa  85.1  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000318036  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3346  adenylate/guanylate cyclase  34.76 
 
 		 1392 aa  85.1  0.000000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0911306  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2718  hypothetical protein  36.65 
 
 		 292 aa  84  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3571  signal transduction protein  24.6 
 
 		 2194 aa  84.3  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1994  hypothetical protein  35.85 
 
 		 304 aa  83.6  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  27.2 
 
 		 751 aa  83.6  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2919  hypothetical protein  27.78 
 
 		 1080 aa  83.6  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3181  NTPase (NACHT family)-like protein  27.25 
 
 		 1150 aa  84  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00494273  normal  0.197936 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0125  hypothetical protein  31.79 
 
 		 781 aa  83.2  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.871876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4578  hypothetical protein  31.66 
 
 		 852 aa  83.2  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.54262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2259  hypothetical protein  27.14 
 
 		 262 aa  82.8  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1048  signal transduction protein  25 
 
 		 1216 aa  82.4  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.958943  normal  0.02885 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  29.04 
 
 		 826 aa  82.4  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2650  hypothetical protein  28.86 
 
 		 439 aa  82.4  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.112589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  28.12 
 
 		 325 aa  82  0.00000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4283  metallophosphoesterase  31.62 
 
 		 463 aa  81.6  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.989715  normal  0.129985 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26230  hypothetical protein  33.33 
 
 		 312 aa  81.6  0.00000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5325  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  23.89 
 
 		 805 aa  81.6  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1634  hypothetical protein  45.45 
 
 		 263 aa  81.3  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2390  protein of unknown function DUF323  34.97 
 
 		 293 aa  80.9  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264886  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4512  hypothetical protein  29.69 
 
 		 487 aa  81.3  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.720233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2114  hypothetical protein  35.44 
 
 		 444 aa  81.3  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0420844 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1234  protein of unknown function DUF323  27.6 
 
 		 265 aa  80.9  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0897  hypothetical protein  33.14 
 
 		 291 aa  80.1  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000129772  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3032  putative signal transduction protein with Nacht domain  22.75 
 
 		 1004 aa  80.1  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00461923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3855  hypothetical protein  29.74 
 
 		 348 aa  80.5  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3088  putative signal transduction protein with Nacht domain  22.99 
 
 		 798 aa  80.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2257  hypothetical protein  37.36 
 
 		 444 aa  79.7  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689177  normal  0.0943468 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2507  protein of unknown function DUF323  39.38 
 
 		 538 aa  79.7  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2380  protein of unknown function DUF323  31.31 
 
 		 417 aa  79.7  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3128  protein of unknown function DUF323  35.45 
 
 		 348 aa  79.3  0.0000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  35.48 
 
 		 398 aa  79.3  0.0000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3102  protein of unknown function DUF323  36.27 
 
 		 740 aa  79  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2548  methyltransferase  33.92 
 
 		 766 aa  79  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7294  metallophosphoesterase  27.27 
 
 		 426 aa  79  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.502471  normal  0.0243654 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0650  signal transduction protein  23.62 
 
 		 801 aa  78.6  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.190918 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6095  protein of unknown function DUF323  36.31 
 
 		 319 aa  78.6  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2940  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.54 
 
 		 416 aa  78.6  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.279621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4115  hypothetical protein  37.58 
 
 		 291 aa  78.2  0.0000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.081326  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3177  protein of unknown function DUF323  32.54 
 
 		 416 aa  78.2  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22460  conserved hypothetical protein TIGR03440  34.3 
 
 		 468 aa  78.2  0.0000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.599861 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4190  hypothetical protein  37.58 
 
 		 291 aa  78.2  0.0000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1556  hypothetical protein  38.35 
 
 		 263 aa  77.4  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.808052  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2228  hypothetical protein  35.36 
 
 		 1196 aa  77.8  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.245656 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>