18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0294 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0294  hypothetical protein  100 
 
 
1020 aa  2073    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000662732  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0143  hypothetical protein  37.89 
 
 
897 aa  623  1e-177  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0372395  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1393  hypothetical protein  26.91 
 
 
658 aa  169  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1394  metallophosphoesterase  27.47 
 
 
369 aa  145  3e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1921  Toll-interleukin receptor  24.35 
 
 
851 aa  139  2e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.504102  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1047  putative signal transduction protein with Nacht domain  28.91 
 
 
1183 aa  85.1  0.000000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.598608  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1893  hypothetical protein  26.86 
 
 
1581 aa  78.2  0.0000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7294  metallophosphoesterase  25.26 
 
 
426 aa  72.8  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.502471  normal  0.0243654 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0068  hypothetical protein  25.56 
 
 
1200 aa  68.2  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2349  protein of unknown function DUF323  25.2 
 
 
1186 aa  67  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.719002  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_64  calcineurin-like phosphoesterase  24.72 
 
 
437 aa  60.8  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0515875  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0703  phosphohydrolase protein  23.02 
 
 
1071 aa  59.3  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.159768  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4577  Ser/Thr protein phosphatase family protein  24.62 
 
 
469 aa  55.8  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000318036  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0735  protein of unknown function DUF323  23.86 
 
 
1201 aa  53.1  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2339  protein of unknown function DUF323  24.18 
 
 
775 aa  53.1  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1325  WD40 repeat, subgroup  22.11 
 
 
1484 aa  52.4  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237461  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2222  serine/threonine protein kinase  21.33 
 
 
1818 aa  52  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.943108  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2344  protein of unknown function DUF323  27.31 
 
 
1190 aa  50.1  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>