15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0703 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_0703  phosphohydrolase protein  100 
 
 
1071 aa  2224    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.159768  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0068  hypothetical protein  27.27 
 
 
1200 aa  100  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1047  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.26 
 
 
1183 aa  95.1  7e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.598608  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2349  protein of unknown function DUF323  25.9 
 
 
1186 aa  89.4  4e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.719002  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1893  hypothetical protein  25.7 
 
 
1581 aa  88.2  9e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2339  protein of unknown function DUF323  24.45 
 
 
775 aa  87.4  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0735  protein of unknown function DUF323  24.26 
 
 
1201 aa  82.4  0.00000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7294  metallophosphoesterase  26.33 
 
 
426 aa  61.6  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.502471  normal  0.0243654 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0294  hypothetical protein  23.02 
 
 
1020 aa  59.7  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000662732  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2344  protein of unknown function DUF323  23.91 
 
 
1190 aa  59.7  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  25 
 
 
1766 aa  50.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4577  Ser/Thr protein phosphatase family protein  22.83 
 
 
469 aa  48.9  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000318036  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  25.41 
 
 
1831 aa  48.9  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44430  Metallophosphoesterase protein  29.91 
 
 
291 aa  45.8  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.112836  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  22.81 
 
 
1807 aa  45.8  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>