More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2344 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2186  protein of unknown function DUF323  45.68 
 
 		 1007 aa  668    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000553602  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0364  signal transduction protein  44.56 
 
 		 960 aa  642    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0856  hypothetical protein  44.38 
 
 		 923 aa  655    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1553  putative signal transduction protein with Nacht domain  46.21 
 
 		 1023 aa  689    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0972336  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2192  protein of unknown function DUF323  46.14 
 
 		 1049 aa  681    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1587  protein of unknown function DUF323  49.17 
 
 		 1064 aa  762    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0735  protein of unknown function DUF323  41.37 
 
 		 1201 aa  832    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2344  protein of unknown function DUF323  100 
 
 		 1190 aa  2467    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2349  protein of unknown function DUF323  47.03 
 
 		 1186 aa  1001    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.719002  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1565  putative signal transduction protein with Nacht domain  45.65 
 
 		 1041 aa  667    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1047  putative signal transduction protein with Nacht domain  40.37 
 
 		 1183 aa  811    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.598608  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1893  hypothetical protein  41.25 
 
 		 1581 aa  851    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2427  putative signal transduction protein with Nacht domain  45.99 
 
 		 1044 aa  751    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.509479  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0068  hypothetical protein  38.57 
 
 		 1200 aa  704    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1299  hypothetical protein  43.84 
 
 		 1492 aa  640    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0457  signal transduction protein  43.14 
 
 		 1049 aa  630  1e-179  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1562  putative signal transduction protein with Nacht domain  43.76 
 
 		 1044 aa  625  1e-177  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1452  protein of unknown function DUF323  42.01 
 
 		 1053 aa  615  9.999999999999999e-175  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0460  hypothetical protein  44.9 
 
 		 965 aa  607  9.999999999999999e-173  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0102271  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2339  protein of unknown function DUF323  56.34 
 
 		 775 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1598  hypothetical protein  28.57 
 
 		 644 aa  179  2e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1556  hypothetical protein  61.48 
 
 		 263 aa  164  1e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.808052  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3131  GUN4 domain protein  28.18 
 
 		 818 aa  115  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1976  protein of unknown function DUF323  38.42 
 
 		 319 aa  114  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300253  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  26.6 
 
 		 1148 aa  112  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  33.33 
 
 		 433 aa  112  4.0000000000000004e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1079  protein of unknown function DUF323  31.49 
 
 		 267 aa  112  4.0000000000000004e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000235261  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1602  signal transduction protein  23.37 
 
 		 1002 aa  112  5e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3090  putative signal transduction protein with Nacht domain  26.52 
 
 		 908 aa  110  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.624689  normal  0.76371 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2563  putative signal transduction protein with Nacht domain  28.14 
 
 		 997 aa  108  9e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.238788  normal  0.0710109 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4476  signal transduction protein  27.85 
 
 		 1237 aa  105  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.62278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2114  hypothetical protein  29.14 
 
 		 444 aa  103  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0420844 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1490  hypothetical protein  32.19 
 
 		 742 aa  102  6e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00271295  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1473  putative signal transduction protein with Nacht domain  26.9 
 
 		 762 aa  101  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1500  putative signal transduction protein with Nacht domain  26.9 
 
 		 762 aa  101  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2257  hypothetical protein  29.37 
 
 		 444 aa  100  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689177  normal  0.0943468 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2222  serine/threonine protein kinase  21.43 
 
 		 1818 aa  100  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.943108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4811  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.82 
 
 		 1067 aa  100  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.382069  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4985  signal transduction protein  25.9 
 
 		 1345 aa  100  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4765  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  25.11 
 
 		 887 aa  99  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4512  hypothetical protein  29.33 
 
 		 487 aa  98.2  9e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.720233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1392  putative signal transduction protein with Nacht domain  25 
 
 		 1091 aa  97.8  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3640  protein of unknown function DUF323  31.1 
 
 		 442 aa  97.4  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.530686  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1944  protein of unknown function DUF323  27.16 
 
 		 829 aa  97.4  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.550405  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5141  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  25.18 
 
 		 951 aa  97.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2498  signal transduction protein  26.01 
 
 		 1349 aa  97.4  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  27.92 
 
 		 826 aa  97.1  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7301  hypothetical protein  29.43 
 
 		 506 aa  96.3  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  30.34 
 
 		 325 aa  94.4  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0687  hypothetical protein  28.11 
 
 		 437 aa  94.4  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2548  methyltransferase  27.93 
 
 		 766 aa  94.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2123  protein of unknown function DUF323  28.15 
 
 		 442 aa  93.6  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3088  putative signal transduction protein with Nacht domain  27.66 
 
 		 798 aa  93.6  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3570  signal transduction protein  24.48 
 
 		 783 aa  92.8  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2449  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.87 
 
 		 888 aa  92.8  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.152058  normal  0.158989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8029  protein of unknown function DUF323  26.98 
 
 		 446 aa  92  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.217933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3032  putative signal transduction protein with Nacht domain  26.45 
 
 		 1004 aa  92  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00461923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2496  signal transduction protein  26.16 
 
 		 1339 aa  91.7  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  36.65 
 
 		 398 aa  91.3  9e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22460  conserved hypothetical protein TIGR03440  28.21 
 
 		 468 aa  91.3  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.599861 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4970  hypothetical protein  28.88 
 
 		 436 aa  90.1  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4881  hypothetical protein  28.88 
 
 		 436 aa  90.1  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.546495  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5249  hypothetical protein  28.88 
 
 		 436 aa  90.1  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3177  protein of unknown function DUF323  34.55 
 
 		 416 aa  90.1  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2940  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.55 
 
 		 416 aa  90.1  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.279621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5325  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  24.32 
 
 		 805 aa  89.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2751  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  26.88 
 
 		 942 aa  89.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3571  signal transduction protein  25.26 
 
 		 2194 aa  89.7  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1916  signal transduction protein  25 
 
 		 766 aa  89.4  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.394463 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2632  signal transduction protein  25.11 
 
 		 1742 aa  89  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1048  signal transduction protein  24.36 
 
 		 1216 aa  88.6  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.958943  normal  0.02885 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2650  hypothetical protein  29.92 
 
 		 439 aa  88.6  6e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.112589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5123  hypothetical protein  21.44 
 
 		 949 aa  88.6  6e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2296  NACHT family-like NTPase  24.68 
 
 		 1267 aa  88.6  7e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1081  protein of unknown function DUF323  28.8 
 
 		 447 aa  88.6  7e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0331  hypothetical protein  26.55 
 
 		 433 aa  88.2  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.188129  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1942  protein of unknown function DUF323  30.14 
 
 		 517 aa  87.8  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00637394  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2919  hypothetical protein  29.5 
 
 		 1080 aa  87.8  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2071  hypothetical protein  28.62 
 
 		 892 aa  87.8  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  27.34 
 
 		 586 aa  87.4  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  29.45 
 
 		 751 aa  87  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5169  hypothetical protein  27.31 
 
 		 437 aa  87.4  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0904  hypothetical protein  36.14 
 
 		 251 aa  86.7  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000158237 
 
 
-
 
NC_002620  TC0422  hypothetical protein  36.53 
 
 		 614 aa  86.3  0.000000000000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.385064  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3855  hypothetical protein  35 
 
 		 348 aa  85.9  0.000000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3128  protein of unknown function DUF323  35 
 
 		 348 aa  85.9  0.000000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  34.72 
 
 		 398 aa  85.9  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3248  hypothetical protein  26.68 
 
 		 416 aa  85.9  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000238215  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  31.6 
 
 		 517 aa  85.5  0.000000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3181  NTPase (NACHT family)-like protein  26.18 
 
 		 1150 aa  85.1  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00494273  normal  0.197936 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4459  hypothetical protein  32.07 
 
 		 390 aa  85.1  0.000000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0669008 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3099  protein of unknown function DUF323  31.25 
 
 		 269 aa  85.1  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4550  hypothetical protein  28.62 
 
 		 287 aa  85.1  0.000000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4215  hypothetical protein  27.96 
 
 		 301 aa  84.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.579009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2380  protein of unknown function DUF323  31.03 
 
 		 417 aa  84.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0204  protein of unknown function DUF323  26.3 
 
 		 442 aa  84  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2390  protein of unknown function DUF323  33.7 
 
 		 293 aa  84  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264886  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4586  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.33 
 
 		 1086 aa  84  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1642  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.82 
 
 		 911 aa  82.4  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.409211 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0650  signal transduction protein  25.43 
 
 		 801 aa  82.8  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.190918 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>