More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2339 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2339  protein of unknown function DUF323  100 
 
 		 775 aa  1614    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0068  hypothetical protein  77.06 
 
 		 1200 aa  524  1e-147  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2349  protein of unknown function DUF323  69.85 
 
 		 1186 aa  477  1e-133  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.719002  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1047  putative signal transduction protein with Nacht domain  61.32 
 
 		 1183 aa  404  1e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.598608  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1893  hypothetical protein  55.74 
 
 		 1581 aa  391  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0735  protein of unknown function DUF323  51.48 
 
 		 1201 aa  321  3.9999999999999996e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1587  protein of unknown function DUF323  56.9 
 
 		 1064 aa  320  9e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2344  protein of unknown function DUF323  56.34 
 
 		 1190 aa  307  6e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2427  putative signal transduction protein with Nacht domain  55.09 
 
 		 1044 aa  286  8e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.509479  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1452  protein of unknown function DUF323  51.82 
 
 		 1053 aa  274  4.0000000000000004e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0457  signal transduction protein  50.74 
 
 		 1049 aa  251  3e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1553  putative signal transduction protein with Nacht domain  48.35 
 
 		 1023 aa  249  2e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0972336  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0460  hypothetical protein  49.25 
 
 		 965 aa  244  6e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0102271  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1562  putative signal transduction protein with Nacht domain  47.51 
 
 		 1044 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1565  putative signal transduction protein with Nacht domain  45.99 
 
 		 1041 aa  230  6e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2192  protein of unknown function DUF323  49.08 
 
 		 1049 aa  230  8e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2186  protein of unknown function DUF323  47.51 
 
 		 1007 aa  219  2e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000553602  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0364  signal transduction protein  42.25 
 
 		 960 aa  216  1.9999999999999998e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0856  hypothetical protein  44.74 
 
 		 923 aa  214  7e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1299  hypothetical protein  43.23 
 
 		 1492 aa  190  7e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1843  SEFIR domain-containing protein  43.57 
 
 		 513 aa  123  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  27.04 
 
 		 398 aa  123  9.999999999999999e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1885  SEFIR domain protein  38.99 
 
 		 549 aa  121  6e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  32.34 
 
 		 433 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  24.13 
 
 		 826 aa  114  8.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1079  protein of unknown function DUF323  32.21 
 
 		 267 aa  112  3e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000235261  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1976  protein of unknown function DUF323  40.44 
 
 		 319 aa  105  3e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300253  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  29.34 
 
 		 586 aa  104  5e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  32.06 
 
 		 751 aa  104  6e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  31.65 
 
 		 325 aa  103  1e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3102  protein of unknown function DUF323  41.18 
 
 		 740 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1944  protein of unknown function DUF323  30.55 
 
 		 829 aa  103  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.550405  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1660  sefir domain protein  34.39 
 
 		 316 aa  101  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0275  SEFIR domain-containing protein  36.49 
 
 		 290 aa  101  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1857  SEFIR domain-containing protein  37.16 
 
 		 482 aa  101  6e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1490  hypothetical protein  32 
 
 		 742 aa  100  7e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00271295  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2548  methyltransferase  29.07 
 
 		 766 aa  100  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  39.53 
 
 		 517 aa  99  3e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1942  protein of unknown function DUF323  30.79 
 
 		 517 aa  98.6  4e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00637394  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3248  hypothetical protein  38.76 
 
 		 416 aa  97.8  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000238215  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2940  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.4 
 
 		 416 aa  97.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.279621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3177  protein of unknown function DUF323  32.4 
 
 		 416 aa  97.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  26 
 
 		 398 aa  97.1  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0422  hypothetical protein  40.36 
 
 		 614 aa  95.9  2e-18  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.385064  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3065  protein of unknown function DUF323  36.5 
 
 		 1104 aa  96.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34453 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2919  hypothetical protein  32.21 
 
 		 1080 aa  95.9  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0602  protein of unknown function DUF323  36.16 
 
 		 273 aa  95.1  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0325143  normal  0.360547 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1325  WD40 repeat, subgroup  29.59 
 
 		 1484 aa  94.7  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237461  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1816  hypothetical protein  35.1 
 
 		 398 aa  93.6  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3099  protein of unknown function DUF323  37.5 
 
 		 269 aa  92.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0904  hypothetical protein  38.65 
 
 		 251 aa  92.8  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000158237 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2390  protein of unknown function DUF323  36.52 
 
 		 293 aa  92  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264886  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1634  hypothetical protein  35.98 
 
 		 263 aa  91.7  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2222  serine/threonine protein kinase  37.5 
 
 		 1818 aa  90.9  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.943108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0670  protein of unknown function DUF323  34.87 
 
 		 654 aa  91.3  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0525  SEFIR domain-containing protein  31.29 
 
 		 553 aa  90.1  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0577741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2380  protein of unknown function DUF323  37.65 
 
 		 417 aa  90.5  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2228  hypothetical protein  30.65 
 
 		 1196 aa  89.7  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2077  hypothetical protein  32.17 
 
 		 636 aa  88.6  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189777  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3074  hypothetical protein  36.52 
 
 		 620 aa  88.6  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2507  protein of unknown function DUF323  29.36 
 
 		 538 aa  88.2  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2650  hypothetical protein  26.73 
 
 		 439 aa  87.8  7e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.112589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3346  adenylate/guanylate cyclase  35.15 
 
 		 1392 aa  87.8  8e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0911306  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0703  phosphohydrolase protein  24.45 
 
 		 1071 aa  87.4  9e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.159768  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0125  hypothetical protein  34.69 
 
 		 781 aa  87  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.871876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3236  hypothetical protein  30.73 
 
 		 957 aa  87  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0717  serine/threonine protein kinase  39.88 
 
 		 861 aa  87.4  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000196708  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1135  SEFIR domain-containing protein  29.56 
 
 		 324 aa  85.9  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3842  hypothetical protein  37.5 
 
 		 616 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.360861 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1731  hypothetical protein  38.42 
 
 		 877 aa  85.9  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0460  serine/threonine protein kinase  29.48 
 
 		 620 aa  85.1  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22460  conserved hypothetical protein TIGR03440  28.52 
 
 		 468 aa  85.5  0.000000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.599861 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4578  hypothetical protein  34.95 
 
 		 852 aa  84.7  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.54262  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4215  hypothetical protein  28.67 
 
 		 301 aa  84.3  0.000000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.579009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2480  protein of unknown function DUF323  31.98 
 
 		 584 aa  84.3  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2193  protein of unknown function DUF323  33.85 
 
 		 453 aa  84.3  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4512  hypothetical protein  27.72 
 
 		 487 aa  84.3  0.000000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.720233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5169  hypothetical protein  30 
 
 		 437 aa  84  0.000000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_94690  predicted protein  35.48 
 
 		 819 aa  84  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.154344 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0922  hypothetical protein  37.95 
 
 		 413 aa  83.6  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5054  Serine/threonine protein kinase  28.71 
 
 		 616 aa  83.6  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.688753 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2114  hypothetical protein  29.03 
 
 		 444 aa  83.6  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0420844 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2788  SEFIR domain protein  32.39 
 
 		 489 aa  83.6  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0246678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1330  protein of unknown function DUF323  37.14 
 
 		 475 aa  83.6  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2454  protein of unknown function DUF323  38.12 
 
 		 1132 aa  83.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0264144 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4092  hypothetical protein  36.2 
 
 		 253 aa  84  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.189106  normal  0.479505 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1912  protein of unknown function DUF323  27.25 
 
 		 346 aa  83.2  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0442791 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2257  hypothetical protein  29.39 
 
 		 444 aa  82.8  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689177  normal  0.0943468 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3760  serine/threonine protein kinase  36.76 
 
 		 637 aa  82.8  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3068  serine/threonine protein kinase  36.2 
 
 		 621 aa  83.2  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000268642  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1865  protein of unknown function DUF323  25.24 
 
 		 289 aa  83.2  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000544959  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4101  protein of unknown function DUF323  35.87 
 
 		 358 aa  82.8  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.664344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1081  protein of unknown function DUF323  31.3 
 
 		 447 aa  82.4  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8029  protein of unknown function DUF323  28.87 
 
 		 446 aa  82.4  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.217933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3524  hypothetical protein  28.66 
 
 		 802 aa  82.4  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.38 
 
 		 554 aa  82  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1853  hypothetical protein  33.16 
 
 		 464 aa  81.6  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0463  serine/threonine protein kinase  34.39 
 
 		 637 aa  81.6  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3128  protein of unknown function DUF323  31.72 
 
 		 348 aa  81.3  0.00000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4351  serine/threonine protein kinase  38.55 
 
 		 882 aa  81.3  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>