30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1921 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_1921  Toll-interleukin receptor  100 
 
 		 851 aa  1745    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.504102  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0143  hypothetical protein  25.47 
 
 		 897 aa  182  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0372395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1393  hypothetical protein  27.05 
 
 		 658 aa  157  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0294  hypothetical protein  23.97 
 
 		 1020 aa  153  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000662732  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6204  TIR protein  41.89 
 
 		 260 aa  119  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.396579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5724  TIR protein  44.83 
 
 		 942 aa  113  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00541848 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3242  hypothetical protein  40.6 
 
 		 325 aa  107  8e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2742  TIR protein  37.84 
 
 		 320 aa  107  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000609469  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0023  hypothetical protein  38.46 
 
 		 320 aa  106  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4818  TIR protein  38.03 
 
 		 327 aa  100  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2480  protein of unknown function DUF323  35.85 
 
 		 584 aa  96.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1783  TIR protein  35.21 
 
 		 316 aa  95.5  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0092  response regulator receiver protein  32.19 
 
 		 383 aa  89  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.170556  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1477  TIR protein  34.27 
 
 		 183 aa  82.4  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.475025  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1920  TIR protein  31.29 
 
 		 250 aa  82  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.417099 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1625  hypothetical protein  36.92 
 
 		 290 aa  80.1  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3815  hypothetical protein  30.16 
 
 		 364 aa  74.3  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00546269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3816  hypothetical protein  32.26 
 
 		 135 aa  73.9  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000096587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0088  TIR protein  29.14 
 
 		 245 aa  71.2  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0832287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1089  TIR protein  30.3 
 
 		 585 aa  65.5  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0814211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5406  TIR protein  26.71 
 
 		 249 aa  60.1  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0273  TIR protein  29.29 
 
 		 342 aa  57  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0269  hypothetical protein  32 
 
 		 195 aa  54.3  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.108769  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0583  hypothetical protein  29.59 
 
 		 552 aa  52.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0566  hypothetical protein  29.59 
 
 		 552 aa  52.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0746  TIR protein  29.13 
 
 		 598 aa  50.1  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  29.2 
 
 		 1611 aa  48.9  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2375  hypothetical protein  24.75 
 
 		 303 aa  48.5  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000173875  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0066  hypothetical protein  25.44 
 
 		 384 aa  46.2  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3409  hypothetical protein  27.18 
 
 		 796 aa  44.3  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.835686  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>