28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B4818 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011149  SeAg_B4818  TIR protein  100 
 
 		 327 aa  690    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2742  TIR protein  43.08 
 
 		 320 aa  275  8e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000609469  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0023  hypothetical protein  42.59 
 
 		 320 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1783  TIR protein  43.38 
 
 		 316 aa  264  1e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3242  hypothetical protein  39.94 
 
 		 325 aa  248  1e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2480  protein of unknown function DUF323  47.9 
 
 		 584 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5724  TIR protein  42.86 
 
 		 942 aa  152  5.9999999999999996e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00541848 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6204  TIR protein  43.33 
 
 		 260 aa  142  9e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.396579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0092  response regulator receiver protein  46.04 
 
 		 383 aa  138  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.170556  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3816  hypothetical protein  43.85 
 
 		 135 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000096587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1920  TIR protein  34.97 
 
 		 250 aa  104  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.417099 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1921  Toll-interleukin receptor  38.57 
 
 		 851 aa  100  3e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.504102  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3815  hypothetical protein  37.41 
 
 		 364 aa  99.8  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00546269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0088  TIR protein  32.47 
 
 		 245 aa  99.4  8e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0832287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5406  TIR protein  28.47 
 
 		 249 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1477  TIR protein  28.97 
 
 		 183 aa  83.2  0.000000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.475025  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1625  hypothetical protein  35.35 
 
 		 290 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0269  hypothetical protein  36 
 
 		 195 aa  69.7  0.00000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.108769  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0583  hypothetical protein  26.49 
 
 		 552 aa  69.3  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1089  TIR protein  29.81 
 
 		 585 aa  68.9  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0814211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0566  hypothetical protein  25.83 
 
 		 552 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0273  TIR protein  24.66 
 
 		 342 aa  64.3  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  33.33 
 
 		 1348 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  22.93 
 
 		 1266 aa  50.1  0.00005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  26.6 
 
 		 398 aa  45.4  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0104  hypothetical protein  28.57 
 
 		 386 aa  44.3  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2375  hypothetical protein  27.84 
 
 		 303 aa  43.9  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000173875  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  25.73 
 
 		 1363 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>