40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_0583 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_0566  hypothetical protein  98.91 
 
 
552 aa  1124    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0583  hypothetical protein  100 
 
 
552 aa  1135    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0273  TIR protein  43.97 
 
 
342 aa  125  3e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1625  hypothetical protein  38.36 
 
 
290 aa  106  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1089  TIR protein  36.05 
 
 
585 aa  105  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0814211  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0269  hypothetical protein  38.3 
 
 
195 aa  97.1  7e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.108769  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0023  hypothetical protein  33.8 
 
 
320 aa  77  0.0000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5724  TIR protein  36.36 
 
 
942 aa  76.6  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00541848 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1477  TIR protein  35.65 
 
 
183 aa  72.8  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.475025  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0632  hypothetical protein  29.27 
 
 
514 aa  71.6  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.489107  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2742  TIR protein  29.58 
 
 
320 aa  70.9  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000609469  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3242  hypothetical protein  30.66 
 
 
325 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4818  TIR protein  26.49 
 
 
327 aa  69.3  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0092  response regulator receiver protein  29.58 
 
 
383 aa  65.9  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.170556  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1783  TIR protein  26.81 
 
 
316 aa  65.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1920  TIR protein  31.82 
 
 
250 aa  63.5  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.417099 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6204  TIR protein  22.92 
 
 
260 aa  60.8  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.396579  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4289  hypothetical protein  36 
 
 
137 aa  57  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0088  TIR protein  30.77 
 
 
245 aa  55.5  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0832287  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1090  hypothetical protein  23.28 
 
 
268 aa  54.7  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0968  hypothetical protein  23.91 
 
 
298 aa  53.9  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2480  protein of unknown function DUF323  28.47 
 
 
584 aa  53.5  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1921  Toll-interleukin receptor  29.59 
 
 
851 aa  52.8  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.504102  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5102  hypothetical protein  24.77 
 
 
300 aa  50.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3634  hypothetical protein  21.54 
 
 
298 aa  50.4  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.651721 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3816  hypothetical protein  23.81 
 
 
135 aa  50.1  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000096587  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3600  hypothetical protein  25.81 
 
 
462 aa  49.3  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000126135 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0409  hypothetical protein  23.13 
 
 
284 aa  48.5  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.991789  normal  0.340922 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0218  hypothetical protein  23.6 
 
 
280 aa  46.6  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.776931  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5406  TIR protein  29.25 
 
 
249 aa  46.6  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  30.68 
 
 
1266 aa  45.4  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2550  hypothetical protein  25 
 
 
302 aa  45.4  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0605029  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2995  Toll-interleukin receptor  28.05 
 
 
374 aa  45.1  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.462352 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2378  WD-40 repeat protein  36.14 
 
 
1016 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0066  hypothetical protein  40.62 
 
 
384 aa  44.7  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4184  sensor protein  29.17 
 
 
1048 aa  44.3  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00072831 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2429  WD-40 repeat protein  36.14 
 
 
1016 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3815  hypothetical protein  34.33 
 
 
364 aa  44.7  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00546269  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4464  hypothetical protein  25.11 
 
 
301 aa  44.3  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  35.14 
 
 
1348 aa  43.9  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>