33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1089 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1089  TIR protein  100 
 
 		 585 aa  1182    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0814211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1155  hypothetical protein  28.61 
 
 		 689 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0566  hypothetical protein  36.73 
 
 		 552 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0583  hypothetical protein  36.05 
 
 		 552 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2011  hypothetical protein  30.77 
 
 		 684 aa  94.7  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0273  TIR protein  43.36 
 
 		 342 aa  92  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1625  hypothetical protein  39.81 
 
 		 290 aa  90.9  6e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2742  TIR protein  28.65 
 
 		 320 aa  80.5  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000609469  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3242  hypothetical protein  30.07 
 
 		 325 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0023  hypothetical protein  28.57 
 
 		 320 aa  78.6  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0269  hypothetical protein  29.17 
 
 		 195 aa  77  0.0000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.108769  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2480  protein of unknown function DUF323  30.7 
 
 		 584 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5724  TIR protein  30.97 
 
 		 942 aa  74.7  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00541848 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1783  TIR protein  28.26 
 
 		 316 aa  72  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0092  response regulator receiver protein  33.68 
 
 		 383 aa  71.6  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.170556  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6204  TIR protein  29.7 
 
 		 260 aa  70.1  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.396579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4818  TIR protein  29.81 
 
 		 327 aa  68.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1477  TIR protein  32.67 
 
 		 183 aa  67  0.0000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.475025  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1921  Toll-interleukin receptor  30.3 
 
 		 851 aa  65.5  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.504102  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1920  TIR protein  31.63 
 
 		 250 aa  62.8  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.417099 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0088  TIR protein  26.32 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0832287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0066  hypothetical protein  34.31 
 
 		 384 aa  56.6  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3816  hypothetical protein  28.4 
 
 		 135 aa  51.2  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000096587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3815  hypothetical protein  24.59 
 
 		 364 aa  51.2  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00546269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.22 
 
 		 1424 aa  51.2  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  27.78 
 
 		 1266 aa  48.5  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4630  TIR protein  28.71 
 
 		 291 aa  48.1  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.788158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5406  TIR protein  25.53 
 
 		 249 aa  48.1  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3566  hypothetical protein  28.16 
 
 		 272 aa  47  0.0009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1159  hypothetical protein  26.61 
 
 		 392 aa  47  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.45694  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5120  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  27.37 
 
 		 490 aa  44.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2941  hypothetical protein  26.79 
 
 		 286 aa  44.7  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0104  hypothetical protein  31.37 
 
 		 386 aa  44.7  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>