37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2011 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2011  hypothetical protein  100 
 
 		 684 aa  1380    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1155  hypothetical protein  38.41 
 
 		 689 aa  403  1e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1159  hypothetical protein  40.71 
 
 		 392 aa  279  1e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.45694  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.05 
 
 		 1424 aa  156  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2861  hypothetical protein  29.01 
 
 		 504 aa  145  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0476882  normal  0.0347919 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1090  hypothetical protein  34.17 
 
 		 268 aa  140  6e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6920  hypothetical protein  30.18 
 
 		 293 aa  132  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2550  hypothetical protein  28.14 
 
 		 302 aa  108  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0605029  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1089  TIR protein  31.87 
 
 		 585 aa  108  4e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0814211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5145  hypothetical protein  29.52 
 
 		 1689 aa  86.3  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0775613  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5268  TPR repeat-containing protein  28.62 
 
 		 1958 aa  84.3  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.494598  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2142  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  31.82 
 
 		 943 aa  79.7  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.624762  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3208  hypothetical protein  27.32 
 
 		 689 aa  78.6  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.905159  normal  0.252675 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3909  hypothetical protein  27.36 
 
 		 697 aa  77.4  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3408  heat repeat-containing PBS lyase  28.03 
 
 		 1203 aa  73.2  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.539879 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  27.64 
 
 		 1238 aa  71.2  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1986  hypothetical protein  27.74 
 
 		 682 aa  70.1  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2711  FHA domain-containing protein  26.12 
 
 		 544 aa  60.8  0.00000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0305  FHA domain-containing protein  26.02 
 
 		 525 aa  60.5  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2236  hypothetical protein  23.84 
 
 		 467 aa  60.1  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.555143  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1210  hypothetical protein  23.97 
 
 		 496 aa  59.7  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0023593  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2815  hypothetical protein  24.82 
 
 		 392 aa  57  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.616753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2132  hypothetical protein  24.69 
 
 		 699 aa  55.8  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.565923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3262  hypothetical protein  36.07 
 
 		 1020 aa  55.8  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3868  Tetratricopeptide TPR_4  34.71 
 
 		 1736 aa  52.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0314468 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4363  hypothetical protein  25 
 
 		 534 aa  52.4  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.388065  normal  0.394148 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7004  hypothetical protein  31.49 
 
 		 1051 aa  52  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  26.4 
 
 		 1611 aa  50.8  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4219  heterocyst differentiation protein  24.01 
 
 		 806 aa  49.7  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.638928 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3361  hypothetical protein  28.46 
 
 		 482 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2281  hypothetical protein  25.39 
 
 		 440 aa  48.5  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.503347  normal  0.134184 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0033  heterocyst differentiation protein HetF  23.68 
 
 		 823 aa  48.5  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0687  hypothetical protein  31.31 
 
 		 519 aa  47.8  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0836  hypothetical protein  31.31 
 
 		 613 aa  47.8  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.715517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1020  hypothetical protein  32.78 
 
 		 565 aa  46.2  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  30.52 
 
 		 1526 aa  45.8  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1412  tetratricopeptide TPR_4  27.75 
 
 		 874 aa  45.4  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>