48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2132 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_2132  hypothetical protein  100 
 
 
699 aa  1438    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.565923  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2236  hypothetical protein  41.38 
 
 
467 aa  271  4e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.555143  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  33.33 
 
 
1238 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1210  hypothetical protein  30.58 
 
 
496 aa  131  5.0000000000000004e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0023593  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3909  hypothetical protein  28.19 
 
 
697 aa  111  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2142  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.08 
 
 
943 aa  110  9.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.624762  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3208  hypothetical protein  27.03 
 
 
689 aa  104  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.905159  normal  0.252675 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4363  hypothetical protein  28.09 
 
 
534 aa  90.9  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.388065  normal  0.394148 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3408  heat repeat-containing PBS lyase  23.84 
 
 
1203 aa  79.7  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.539879 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4219  heterocyst differentiation protein  24.5 
 
 
806 aa  79.3  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.638928 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3525  heterocyst differentiation protein  24.38 
 
 
835 aa  79  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.857828  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5145  hypothetical protein  25.94 
 
 
1689 aa  73.2  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0775613  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5268  TPR repeat-containing protein  24.36 
 
 
1958 aa  72  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.494598  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0033  heterocyst differentiation protein HetF  22.53 
 
 
823 aa  66.6  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1155  hypothetical protein  24.4 
 
 
689 aa  65.9  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  25.91 
 
 
1313 aa  62  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0503  polysaccharide deacetylase  22.57 
 
 
705 aa  59.3  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1986  hypothetical protein  24.57 
 
 
682 aa  60.1  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3637  TPR repeat-containing protein  24.66 
 
 
1285 aa  59.3  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  26.2 
 
 
1611 aa  59.3  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1602  hypothetical protein  25.06 
 
 
499 aa  59.3  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.1352  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2709  FHA domain containing protein  22.48 
 
 
562 aa  58.9  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.863608 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3407  FHA domain containing protein  22.48 
 
 
562 aa  58.9  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2281  hypothetical protein  26.27 
 
 
440 aa  58.5  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.503347  normal  0.134184 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3255  FHA domain containing protein  22.66 
 
 
569 aa  58.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4077  TPR repeat-containing protein  24.13 
 
 
1298 aa  57.4  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2711  FHA domain-containing protein  20.97 
 
 
544 aa  55.5  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3695  Tetratricopeptide TPR_4  25.81 
 
 
1914 aa  55.1  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.174493 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2861  hypothetical protein  27.01 
 
 
504 aa  53.5  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0476882  normal  0.0347919 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1258  polysaccharide deacetylase  25.71 
 
 
699 aa  53.5  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252566  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0305  FHA domain-containing protein  21.62 
 
 
525 aa  52.4  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2075  hypothetical protein  24.91 
 
 
460 aa  52.4  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.853533  normal  0.712255 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4814  hypothetical protein  32.12 
 
 
534 aa  51.6  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.592191  normal  0.650141 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1337  FHA domain-containing protein  20.17 
 
 
559 aa  51.2  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3103  hypothetical protein  27.59 
 
 
346 aa  50.8  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.492914 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2611  hypothetical protein  41.54 
 
 
87 aa  50.4  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.735379  normal  0.540073 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0791  TPR repeat-containing protein  22.58 
 
 
1063 aa  50.4  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118647  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3065  protein of unknown function DUF323  29.23 
 
 
1104 aa  50.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34453 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6006  hypothetical protein  27.68 
 
 
610 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1632  Tetratricopeptide TPR_4  36.07 
 
 
848 aa  48.9  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521503  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0475  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.92 
 
 
1279 aa  48.5  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.894605  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1733  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.14 
 
 
643 aa  47.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.635761  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5154  TPR repeat-containing protein  21.46 
 
 
1596 aa  46.2  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2583  TPR repeat-containing protein  26.71 
 
 
1714 aa  45.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2348  hypothetical protein  27.27 
 
 
254 aa  45.1  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.389344  normal  0.18746 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0788  TPR repeat-containing protein  23.36 
 
 
1101 aa  44.3  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000957174  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  23.81 
 
 
1276 aa  44.3  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3192  hypothetical protein  25.68 
 
 
933 aa  43.9  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00191616 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>