105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1020 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1020  hypothetical protein  100 
 
 		 565 aa  1129    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5133  hypothetical protein  31.79 
 
 		 1058 aa  232  1e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0695  hypothetical protein  34 
 
 		 521 aa  188  3e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.987521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7004  hypothetical protein  33.39 
 
 		 1051 aa  177  6e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0848  Tetratricopeptide domain protein  27.99 
 
 		 992 aa  154  5.9999999999999996e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0302645  normal  0.423245 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2763  TPR repeat-containing protein  33.76 
 
 		 1711 aa  149  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4136  Tetratricopeptide domain protein  31.73 
 
 		 1219 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4460  TPR repeat-containing protein  27.45 
 
 		 1247 aa  137  4e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0317978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0057  hypothetical protein  35.33 
 
 		 827 aa  136  8e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0380  hypothetical protein  34.92 
 
 		 371 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0542  TPR repeat-containing protein  30.29 
 
 		 994 aa  130  9.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.397005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1546  TPR repeat-containing protein  27.46 
 
 		 1779 aa  125  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  31.25 
 
 		 1007 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  26.16 
 
 		 1276 aa  118  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2728  hypothetical protein  29.8 
 
 		 1096 aa  117  7.999999999999999e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2552  hypothetical protein  31.24 
 
 		 1104 aa  112  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0158  hypothetical protein  28.54 
 
 		 1142 aa  103  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07397  conserved hypothetical protein  25.22 
 
 		 852 aa  101  3e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.155715 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00481  conserved hypothetical protein  28.11 
 
 		 1114 aa  100  5e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.846176  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07129  conserved hypothetical protein  27.03 
 
 		 997 aa  100  8e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.242912  normal  0.044822 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6582  hypothetical protein  29.13 
 
 		 1076 aa  89.7  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1402  hypothetical protein  34.29 
 
 		 1228 aa  89.7  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03325  conserved hypothetical protein  26.58 
 
 		 1476 aa  87.8  5e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0462  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.97 
 
 		 2741 aa  87.4  7e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.22 
 
 		 2741 aa  86.3  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0790  TPR repeat-containing protein  29.74 
 
 		 916 aa  84.7  0.000000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.601667 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5349  hypothetical protein  30.84 
 
 		 1441 aa  84.3  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.598215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6571  hypothetical protein  36.79 
 
 		 1077 aa  84  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997096  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00539  conserved hypothetical protein  27.01 
 
 		 1363 aa  79.7  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.304551  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  23.86 
 
 		 1192 aa  79  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21160  hypothetical protein  28.82 
 
 		 1171 aa  78.2  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.225843 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  29.17 
 
 		 809 aa  77.8  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1756  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.27 
 
 		 854 aa  77.4  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760103 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0292  hypothetical protein  31.56 
 
 		 903 aa  77  0.0000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0502  Tetratricopeptide domain protein  31.58 
 
 		 717 aa  75.5  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1707  TPR repeat-containing protein  36.88 
 
 		 846 aa  74.7  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3265  hypothetical protein  31.07 
 
 		 845 aa  74.3  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.463161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  25.53 
 
 		 1276 aa  73.9  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3677  TPR repeat-containing protein  26.03 
 
 		 1448 aa  73.2  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2461  TPR repeat-containing protein  30.04 
 
 		 905 aa  72.4  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3648  TPR repeat-containing protein  30.04 
 
 		 905 aa  72.4  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2488  Tetratricopeptide domain protein  27.23 
 
 		 950 aa  70.5  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3620  Tetratricopeptide domain protein  27.23 
 
 		 950 aa  70.1  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  25.51 
 
 		 1009 aa  69.7  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  27.24 
 
 		 957 aa  69.7  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2575  hypothetical protein  29.39 
 
 		 1241 aa  67.8  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.633416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  26.62 
 
 		 1162 aa  67.4  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.62 
 
 		 1162 aa  67.4  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0857  hypothetical protein  28.98 
 
 		 532 aa  67.4  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0698719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  24.3 
 
 		 1060 aa  67  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  25.94 
 
 		 828 aa  65.9  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4959  TPR repeat-containing protein  29.44 
 
 		 1544 aa  65.9  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  24.45 
 
 		 1266 aa  65.1  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4958  TPR repeat-containing protein  23.84 
 
 		 1621 aa  64.3  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03421  hypothetical protein  40.59 
 
 		 418 aa  64.3  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.634587 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4095  TPR repeat-containing protein  31.65 
 
 		 729 aa  63.9  0.000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000736734 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1699  hypothetical protein  26.62 
 
 		 1127 aa  63.5  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.871536  normal  0.201111 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1271  hypothetical protein  26.32 
 
 		 884 aa  62.8  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.41 
 
 		 991 aa  63.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0380  tetratricopeptide region  25.56 
 
 		 960 aa  62.8  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2780  hypothetical protein  27.38 
 
 		 1147 aa  62  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3057  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.24 
 
 		 904 aa  61.2  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.249484 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3488  tetratricopeptide region  29.65 
 
 		 840 aa  60.8  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2808  TPR repeat-containing protein  26.27 
 
 		 883 aa  60.5  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0914392  normal  0.245716 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5663  hypothetical protein  33.65 
 
 		 960 aa  60.5  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.937261  normal  0.177848 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4462  hypothetical protein  25.21 
 
 		 853 aa  59.7  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.60042  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6950  hypothetical protein  37.24 
 
 		 909 aa  60.1  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.568828  normal  0.658727 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4183  tetratricopeptide TPR_4  24.73 
 
 		 944 aa  59.3  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166941 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.57 
 
 		 1186 aa  59.3  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03525  conserved hypothetical protein  30.52 
 
 		 747 aa  58.5  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.125574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2565  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 851 aa  57  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3141  hypothetical protein  33.94 
 
 		 192 aa  56.6  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0283  TPR repeat-containing protein  30.28 
 
 		 854 aa  56.6  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0570  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  23.51 
 
 		 3535 aa  57  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0572  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  23.51 
 
 		 3419 aa  56.6  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1685  Tetratricopeptide domain protein  26.23 
 
 		 891 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.131427 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4137  TPR repeat-containing protein  24.9 
 
 		 868 aa  56.2  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000228127  decreased coverage  0.0057951 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0573  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  23.21 
 
 		 3298 aa  55.1  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0409  TPR repeat-containing protein  31.69 
 
 		 851 aa  54.7  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.613133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1768  TPR repeat-containing protein  33.54 
 
 		 923 aa  53.9  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1534  TPR repeat-containing protein  29.37 
 
 		 868 aa  53.5  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7063  hypothetical protein  32.26 
 
 		 811 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0007  TPR repeat-containing protein  33.65 
 
 		 822 aa  52  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.286469  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  28.16 
 
 		 919 aa  52  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  26.79 
 
 		 1328 aa  51.6  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3830  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  23.3 
 
 		 3537 aa  50.4  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  27.36 
 
 		 949 aa  50.4  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0054  TPR repeat-containing protein  29.36 
 
 		 885 aa  50.4  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.494605 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5642  Tetratricopeptide TPR_4  37.8 
 
 		 725 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00884597 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3223  hypothetical protein  34.58 
 
 		 447 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.758214  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0381  TPR repeat-containing protein  31.67 
 
 		 422 aa  49.3  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3775  TPR repeat-containing protein  35.42 
 
 		 937 aa  49.3  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0363  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.91 
 
 		 1772 aa  48.1  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.387099 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1975  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.73 
 
 		 3299 aa  48.1  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5481  hypothetical protein  24.06 
 
 		 698 aa  47  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0491751 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1636  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  30.69 
 
 		 2637 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.191392 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1265  hypothetical protein  28.97 
 
 		 553 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0292259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2706  TPR repeat-containing protein  29.03 
 
 		 928 aa  47  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.1 
 
 		 968 aa  46.2  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317983  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4247  TPR repeat-containing protein  27.82 
 
 		 1055 aa  45.4  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>