143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0857 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0857  hypothetical protein  100 
 
 
532 aa  1087    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0698719  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0292  hypothetical protein  37.16 
 
 
903 aa  169  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0790  TPR repeat-containing protein  25.14 
 
 
916 aa  147  6e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.601667 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.02 
 
 
2741 aa  145  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0462  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.79 
 
 
2741 aa  141  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  30.15 
 
 
828 aa  126  9e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2979  TPR repeat-containing protein  31.07 
 
 
1054 aa  122  9.999999999999999e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.864707  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  29.76 
 
 
1328 aa  122  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0502  Tetratricopeptide domain protein  34.1 
 
 
717 aa  121  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  31.21 
 
 
919 aa  120  3.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2752  Tetratricopeptide TPR_4  30.87 
 
 
893 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1214  TPR repeat-containing protein  30.45 
 
 
1365 aa  113  8.000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.75 
 
 
1162 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  29.75 
 
 
1162 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4137  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
868 aa  108  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000228127  decreased coverage  0.0057951 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  29.5 
 
 
809 aa  106  9e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  27.51 
 
 
1215 aa  105  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1301  hypothetical protein  28.95 
 
 
989 aa  106  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.55 
 
 
968 aa  105  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317983  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 
1060 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4462  hypothetical protein  31.67 
 
 
853 aa  103  6e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.60042  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0283  TPR repeat-containing protein  29.59 
 
 
854 aa  103  6e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2565  TPR repeat-containing protein  28.48 
 
 
851 aa  102  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1756  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.97 
 
 
854 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760103 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  30.55 
 
 
1025 aa  101  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.9 
 
 
991 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4095  TPR repeat-containing protein  30.2 
 
 
729 aa  100  7e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000736734 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3620  Tetratricopeptide domain protein  29.76 
 
 
950 aa  99.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0528  TPR repeat-containing protein  27.63 
 
 
1409 aa  100  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.987709  decreased coverage  0.00608589 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2488  Tetratricopeptide domain protein  29.76 
 
 
950 aa  99.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0409  TPR repeat-containing protein  29.13 
 
 
851 aa  98.6  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.613133  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3775  TPR repeat-containing protein  26.83 
 
 
937 aa  97.1  7e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3265  hypothetical protein  27.1 
 
 
845 aa  95.9  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.463161  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0054  TPR repeat-containing protein  29.61 
 
 
885 aa  94  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.494605 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1534  TPR repeat-containing protein  28.3 
 
 
868 aa  93.6  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  30.25 
 
 
1009 aa  93.2  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2706  TPR repeat-containing protein  30.39 
 
 
928 aa  92.4  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332396  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5804  TPR repeat-containing protein  31.11 
 
 
796 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1271  hypothetical protein  30.29 
 
 
884 aa  91.3  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1164  hypothetical protein  30 
 
 
643 aa  89  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.145735  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5642  Tetratricopeptide TPR_4  26.08 
 
 
725 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00884597 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2118  TPR repeat-containing protein  27.69 
 
 
1028 aa  88.6  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3307  Tetratricopeptide domain protein  28.29 
 
 
909 aa  88.2  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.106188 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0380  tetratricopeptide region  28.2 
 
 
960 aa  87.8  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1768  TPR repeat-containing protein  24.33 
 
 
923 aa  87  7e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03421  hypothetical protein  29.41 
 
 
418 aa  87  7e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.634587 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1380  tetratricopeptide TPR_4  28.38 
 
 
937 aa  87  7e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0007  TPR repeat-containing protein  30.93 
 
 
822 aa  87  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.286469  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.46 
 
 
1186 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3648  TPR repeat-containing protein  30.1 
 
 
905 aa  85.1  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2808  TPR repeat-containing protein  28.9 
 
 
883 aa  84.7  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0914392  normal  0.245716 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1707  TPR repeat-containing protein  31.02 
 
 
846 aa  84.7  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2461  TPR repeat-containing protein  30.1 
 
 
905 aa  84.7  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5481  hypothetical protein  24.83 
 
 
698 aa  84.3  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0491751 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  43.24 
 
 
1475 aa  84  0.000000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2763  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 
1711 aa  82  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1685  Tetratricopeptide domain protein  29.79 
 
 
891 aa  81.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.131427 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3057  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.48 
 
 
904 aa  81.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.249484 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0570  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.25 
 
 
3535 aa  80.9  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0572  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.25 
 
 
3419 aa  80.9  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1492  hypothetical protein  25.25 
 
 
1259 aa  80.9  0.00000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0573  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.57 
 
 
3298 aa  80.9  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3830  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.25 
 
 
3537 aa  80.5  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7004  hypothetical protein  24.38 
 
 
1051 aa  80.5  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244252  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4183  tetratricopeptide TPR_4  25.84 
 
 
944 aa  79.7  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166941 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0354  hypothetical protein  26.41 
 
 
1025 aa  79.7  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.219727  normal  0.251109 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  27.3 
 
 
957 aa  80.1  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  26.71 
 
 
949 aa  79.7  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  29.18 
 
 
1266 aa  77.4  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3488  tetratricopeptide region  26.67 
 
 
840 aa  77.8  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0542  TPR repeat-containing protein  29.73 
 
 
994 aa  76.3  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.397005  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4247  TPR repeat-containing protein  26.88 
 
 
1055 aa  76.6  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0057  hypothetical protein  26.92 
 
 
827 aa  76.3  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0363  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  27.21 
 
 
1772 aa  75.9  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.387099 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2355  hypothetical protein  26.54 
 
 
877 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3223  hypothetical protein  28.57 
 
 
447 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.758214  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1065  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  29.17 
 
 
1650 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195318 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1975  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.39 
 
 
3299 aa  74.7  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3677  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 
1448 aa  74.7  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114945  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1636  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  28.26 
 
 
2637 aa  73.9  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.191392 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  30.08 
 
 
1007 aa  73.2  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1984  hypothetical protein  26.72 
 
 
959 aa  73.6  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7301  WD-40 repeat-containing protein  26.27 
 
 
1247 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.408957  hitchhiker  0.00671221 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1987  hypothetical protein  34.18 
 
 
1039 aa  71.2  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3141  hypothetical protein  33.54 
 
 
192 aa  70.9  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2387  hypothetical protein  32.94 
 
 
1051 aa  70.9  0.00000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1265  hypothetical protein  26.67 
 
 
553 aa  70.9  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0292259  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3192  TPR repeat-containing protein  33.76 
 
 
1036 aa  70.5  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.080394  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1412  tetratricopeptide TPR_4  25.23 
 
 
874 aa  70.1  0.00000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  27.54 
 
 
1276 aa  68.6  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2670  tetratricopeptide TPR_4  24.62 
 
 
905 aa  68.2  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1020  hypothetical protein  28.98 
 
 
565 aa  67.4  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3618  hypothetical protein  24.31 
 
 
1805 aa  65.9  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.461669  hitchhiker  0.00340564 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4460  TPR repeat-containing protein  29.93 
 
 
1247 aa  64.7  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0317978  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4958  TPR repeat-containing protein  27.34 
 
 
1621 aa  63.5  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5411  Tetratricopeptide TPR_4  24.21 
 
 
873 aa  63.5  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.710354  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3535  tetratricopeptide TPR_4  29.07 
 
 
934 aa  62.8  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.155601 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1200  hypothetical protein  26.15 
 
 
2159 aa  62.4  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.932976 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0158  hypothetical protein  30.34 
 
 
1142 aa  62.8  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1546  TPR repeat-containing protein  30.37 
 
 
1779 aa  62.4  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362162  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>