143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0054 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1756  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  43.17 
 
 
854 aa  640    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760103 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0054  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
885 aa  1792    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.494605 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2565  TPR repeat-containing protein  43.44 
 
 
851 aa  652    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4137  TPR repeat-containing protein  45.35 
 
 
868 aa  713    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000228127  decreased coverage  0.0057951 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4183  tetratricopeptide TPR_4  44.93 
 
 
944 aa  707    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166941 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2488  Tetratricopeptide domain protein  41.02 
 
 
950 aa  612  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4462  hypothetical protein  41.83 
 
 
853 aa  611  1e-173  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.60042  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3620  Tetratricopeptide domain protein  41.15 
 
 
950 aa  611  1e-173  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0380  tetratricopeptide region  40.85 
 
 
960 aa  605  1.0000000000000001e-171  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1685  Tetratricopeptide domain protein  40.47 
 
 
891 aa  585  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.131427 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3648  TPR repeat-containing protein  35.91 
 
 
905 aa  538  1e-151  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2461  TPR repeat-containing protein  36.01 
 
 
905 aa  535  1e-150  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3057  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.78 
 
 
904 aa  500  1e-140  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.249484 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3488  tetratricopeptide region  38.43 
 
 
840 aa  471  1.0000000000000001e-131  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3265  hypothetical protein  37.03 
 
 
845 aa  461  9.999999999999999e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.463161  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0007  TPR repeat-containing protein  35.01 
 
 
822 aa  400  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.286469  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2808  TPR repeat-containing protein  32.15 
 
 
883 aa  370  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0914392  normal  0.245716 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5804  TPR repeat-containing protein  31.48 
 
 
796 aa  308  3e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  25.06 
 
 
957 aa  212  3e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5481  hypothetical protein  29.89 
 
 
698 aa  206  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0491751 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  32.36 
 
 
809 aa  197  7e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  35.8 
 
 
1009 aa  189  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0573  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.63 
 
 
3298 aa  179  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3223  hypothetical protein  32.05 
 
 
447 aa  176  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.758214  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0570  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.12 
 
 
3535 aa  175  3.9999999999999995e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0363  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  36.07 
 
 
1772 aa  174  9e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.387099 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1975  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.67 
 
 
3299 aa  174  9e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1065  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  34.5 
 
 
1650 aa  171  8e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195318 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1265  hypothetical protein  29.84 
 
 
553 aa  168  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0292259  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0572  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.43 
 
 
3419 aa  167  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3830  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.79 
 
 
3537 aa  166  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5642  Tetratricopeptide TPR_4  30.41 
 
 
725 aa  166  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00884597 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03421  hypothetical protein  30.49 
 
 
418 aa  161  4e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.634587 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  31.96 
 
 
949 aa  151  6e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  34.39 
 
 
828 aa  145  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1636  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  32.39 
 
 
2637 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.191392 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 
1060 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0462  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.03 
 
 
2741 aa  115  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.46 
 
 
2741 aa  114  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.51 
 
 
991 aa  110  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0857  hypothetical protein  29.61 
 
 
532 aa  108  5e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0698719  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  27.99 
 
 
1215 aa  100  9e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.05 
 
 
968 aa  99.4  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317983  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  28.61 
 
 
919 aa  95.5  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  28.88 
 
 
1328 aa  95.1  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4095  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 
729 aa  93.6  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000736734 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3141  hypothetical protein  33.33 
 
 
192 aa  92.8  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.11 
 
 
1162 aa  90.9  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  33.11 
 
 
1162 aa  90.9  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0502  Tetratricopeptide domain protein  26.57 
 
 
717 aa  87.8  7e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0790  TPR repeat-containing protein  31.19 
 
 
916 aa  87.8  7e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.601667 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1987  hypothetical protein  26.63 
 
 
1039 aa  86.3  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0283  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 
854 aa  83.6  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1271  hypothetical protein  25.54 
 
 
884 aa  84  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2979  TPR repeat-containing protein  30.49 
 
 
1054 aa  82.4  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.864707  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0409  TPR repeat-containing protein  27.67 
 
 
851 aa  80.1  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.613133  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  28.98 
 
 
1475 aa  79.3  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2752  Tetratricopeptide TPR_4  28.32 
 
 
893 aa  77.8  0.0000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7004  hypothetical protein  26.67 
 
 
1051 aa  77.8  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244252  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3775  TPR repeat-containing protein  25.89 
 
 
937 aa  77  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0057  hypothetical protein  39.68 
 
 
827 aa  73.2  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7301  WD-40 repeat-containing protein  25.6 
 
 
1247 aa  73.2  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.408957  hitchhiker  0.00671221 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0528  TPR repeat-containing protein  26.92 
 
 
1409 aa  72.8  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.987709  decreased coverage  0.00608589 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  27.39 
 
 
1025 aa  71.6  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0292  hypothetical protein  30.5 
 
 
903 aa  70.9  0.00000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3192  TPR repeat-containing protein  23.53 
 
 
1036 aa  70.1  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.080394  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.72 
 
 
1186 aa  68.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  27.54 
 
 
2145 aa  68.2  0.0000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1214  TPR repeat-containing protein  27.92 
 
 
1365 aa  67.8  0.0000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1020  hypothetical protein  29.36 
 
 
565 aa  65.1  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2842  hypothetical protein  35.51 
 
 
121 aa  64.3  0.000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  21.84 
 
 
1238 aa  62.8  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21160  hypothetical protein  31.29 
 
 
1171 aa  62.4  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.225843 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2387  hypothetical protein  26.63 
 
 
1051 aa  61.2  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0354  hypothetical protein  30.05 
 
 
1025 aa  61.2  0.00000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.219727  normal  0.251109 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1707  TPR repeat-containing protein  30.25 
 
 
846 aa  61.2  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1402  hypothetical protein  34.09 
 
 
1228 aa  60.8  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5411  Tetratricopeptide TPR_4  28.4 
 
 
873 aa  60.5  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.710354  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1380  tetratricopeptide TPR_4  30.6 
 
 
937 aa  59.7  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6259  NB-ARC domain protein  25.73 
 
 
790 aa  59.7  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0765  tetratricopeptide TPR_2  22.83 
 
 
1180 aa  59.3  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.82828  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  21.12 
 
 
782 aa  59.3  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2706  TPR repeat-containing protein  26.82 
 
 
928 aa  59.3  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332396  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4189  hypothetical protein  34.44 
 
 
1246 aa  58.5  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  25.2 
 
 
1276 aa  57.8  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2763  TPR repeat-containing protein  31.13 
 
 
1711 aa  57.8  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1301  hypothetical protein  32.03 
 
 
989 aa  57.4  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6701  hypothetical protein  26.88 
 
 
675 aa  57  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0517108 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6571  hypothetical protein  27.65 
 
 
1077 aa  56.2  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997096  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3307  Tetratricopeptide domain protein  25.37 
 
 
909 aa  55.5  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.106188 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0158  hypothetical protein  28.93 
 
 
1142 aa  55.1  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  28.44 
 
 
1550 aa  55.1  0.000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1699  hypothetical protein  24.85 
 
 
1127 aa  55.1  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.871536  normal  0.201111 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0542  TPR repeat-containing protein  23.63 
 
 
994 aa  54.7  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.397005  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4247  TPR repeat-containing protein  23.49 
 
 
1055 aa  53.9  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2548  transcriptional regulator, SARP family  27.18 
 
 
992 aa  54.3  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.709979  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1768  TPR repeat-containing protein  32 
 
 
923 aa  53.5  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1376  TPR repeat-containing protein  22.83 
 
 
1261 aa  52.8  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0670144  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  21.85 
 
 
1007 aa  52  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  21.14 
 
 
985 aa  52.4  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>